Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Helgenomsekvensering för blodgruppsgenotypning och definition som exemplifieras på U- och St(a)+. (Blood Genome)

24 augusti 2015 uppdaterad av: Christoph Gassner, Blood Donation Service Zurich, SRC

Tillämpligheten av helgenomsekvensering för genotypning av mänsklig blodgrupp och genetisk definition av nya alleler som exemplifieras på referenser och de två MNS-varianterna: U- och Stones(a)+

Inga hälsotillstånd studeras. Genetisk bakgrund av blodgrupper studeras. U- och Stones(a)+ ("kaukasisk typ") används som prov på principen. Sjukdomsassociationer av alla undersökta blodgruppsgener är mycket sällsynta, t.ex. < 1 bland 1 000 schweiziska individer (se tabell 1), och kan inte förväntas under denna studie.

Genomiskt DNA från 2 U-prover tillhandahölls båda som blindat referensmaterial från blodcentra i New York respektive Wien. Båda givarna går förlorade för uppföljning, och även om det inte finns några dokumenterade bevis för att respektive donator vägrar att använda sitt material i forskningsprojekt, saknar prover fortfarande informerat samtycke.

Studieöversikt

Status

Okänd

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljerad beskrivning

Alla 34 humana blodgruppssystem har minst två antitetiska antigener och är av potentiell relevans under graviditet och transfusion. Lyckligtvis är immuniseringar mot främmande antigener sällsynta för daglig rutin. Ändå kan inkompatibiliteter förekomma i alla blodgruppssystem och kommer då att kräva typning för respektive blodgruppsantigener.

Blodgenotypning utvecklades som den valda metoden, i fall då typningsreagenser är kommersiellt otillgängliga eller blod är otillgängligt (foster). I databaser saknar de flesta poster av blodgruppsgener representativ polymorfism (t. antal alleler). Dessutom är många blodgruppsantigener otillräckligt beskrivna i sina introniska och intergenetiska sekvenser. Detta gäller resultat av ojämna korsningar, genomvandlingar och stora insättningar/deletioner mellan mycket homologa gener, speciellt inom blodgruppssystemen hos Rhesus, t.ex. RhD/RhCE respektive MN/Ss. Endast Whole Genome Sequencing (WGS) tillåter lösning av båda problemen: den levererar hela blodgruppsgenomet för en individ och känner samtidigt igen nya blodgruppsalleler eller haplotyper. Denna begäran om etiskt godkännande vill testa detta antagande.

De antigena determinanterna U- och Stones(a)+ i blodgruppssystemet MNS saknar fortfarande fullständig genetisk beskrivning och kommer att fungera som utmanande exempel för beskrivningen av nya alleler (haplotyper) orsakade av stora ins/del-mutationer av de två mycket homologa generna GYPA och B. Genomiskt DNA från 2 U-prover tillhandahölls båda som blindat referensmaterial från New York respektive Wiens blodcentra. Båda givarna går förlorade för uppföljning, och även om det inte finns några dokumenterade bevis för att respektive donator vägrar att använda sitt material i forskningsprojekt, saknar prover fortfarande informerat samtycke. Ytterligare referensprover (n max=4) och prover med misstänkt Stones(a)+ (n max=4) kommer endast att rekryteras från Zürichs blodgivare med informerat samtycke.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Förväntat)

8

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

  • Schweiz
    • Zürich
      • Schlieren, Zürich, Schweiz, 8952
        • Rekrytering
        • Blutpende Zürich, Dienstleistungszentrum
        • Kontakt:

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

2 år till 66 år (Barn, Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Nej

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Sannolikhetsprov

Studera befolkning

Genomiskt DNA från 2 U-prover tillhandahölls båda som blindat referensmaterial från blodcentra i New York respektive Wien. Båda givarna går förlorade för uppföljning, och även om det inte finns några dokumenterade bevis för att respektive donator vägrar att använda sitt material i forskningsprojekt, saknar prover fortfarande informerat samtycke. Ytterligare referensprover (n max=4) och prover med misstänkt Stones(a)+ (n max=4) kommer endast att rekryteras från Zürichs blodgivare med informerat samtycke.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Befintligt biomaterial (gDNA), eller
  • Befintliga hälsorelaterade data för blodgrupp U- (n max=2) och kvalificerade för (venös) blodprov på 20 ml, eller
  • Befintlig blodgruppsfeno- och genotypningsdata som indikerar St(a)+ och kvalificerad för (venös) blodprovtagning på 20 ml (n max=2), eller
  • Adekvat blodgruppsprofil fungerar som referens (n ​​max =4 & n max =4 000) och kvalificerad för (venös) blodprov på 20 ml.

Exklusions kriterier:

  • Ej berättigad till venös blodprov på ca. 20 ml.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Observationsmodeller: Case-Control

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
personer negativa i bg MNSs antigen U
Blodgruppssystem (bg) MNS. Individer med fenotyp "U-". Homo- och heterozygota individer kan övervägas.
Övrig: Helgenomsekvensering (WGS)
Det kommer inte att behövas några ingrepp förutom blodprov (20 ml blod) under rutinmässig blodgivning (450 ml blod) för 8 av 10 personer som planeras att inkluderas som prov, eller referensprover i studien.
personer positiva i bg MNSs antigen St(a)
Blodgruppssystem (bg) MNS. Individer med fenotypen "St(a)+". Homo- och heterozygota individer kan övervägas.
Övrig: Helgenomsekvensering (WGS)
Det kommer inte att behövas några ingrepp förutom blodprov (20 ml blod) under rutinmässig blodgivning (450 ml blod) för 8 av 10 personer som planeras att inkluderas som prov, eller referensprover i studien.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Helgenomsekvensering för definition av genetisk bakgrund för blodgruppsantigener U-, St(a)+
Tidsram: 2 års period
Under en 2-årsperiod kommer generering och analys av helgenomsekvensdata att användas för analys och beskrivning av den genetiska bakgrunden för blodgruppsantigener U-negativitet och för St(a).
2 års period

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Blood Donation Service Zurich, SRC

Utredare

  • Huvudutredare: Christoph Gassner, PhD, Blutspende Zürich, Dienstleistungszentrum

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart

1 juli 2015

Primärt slutförande (Förväntat)

1 juni 2016

Avslutad studie (Förväntat)

1 juni 2018

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

10 augusti 2015

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

24 augusti 2015

Första postat (Uppskatta)

27 augusti 2015

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Uppskatta)

27 augusti 2015

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

24 augusti 2015

Senast verifierad

1 augusti 2015

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Andra studie-ID-nummer

  • KEK-ZH-Nr. 2014-0408

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera