Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Helgenomsekvensering for blodgruppegenotyping og definisjon som eksemplifisert på U- og St(a)+. (Blood Genome)

24. august 2015 oppdatert av: Christoph Gassner, Blood Donation Service Zurich, SRC

Anvendbarhet av helgenomsekvensering for genotyping av menneskelig blodgruppe og genetisk definisjon av nye alleler som eksemplifisert på referanser og de to MNS-variantene: U- og Stones(a)+

Ingen helsetilstand(er) er undersøkt. Genetisk bakgrunn av blodgrupper studeres. U- og Stones(a)+ ("kaukasisk type") brukes som prinsippprøver. Sykdomsassosiasjoner til alle blodgruppegener som er undersøkt er svært sjeldne, f.eks. < 1 blant 1000 sveitsiske individer (se tabell 1), og er ikke å forvente i løpet av denne studien.

Genomisk DNA fra 2 U-prøver ble begge levert som blindet referansemateriale fra henholdsvis New York og Wiens blodsentre. Begge giverne går tapt for oppfølging, og selv om det ikke er dokumentert bevis for å nekte de respektive giverne å bruke deres materiale i forskningsprosjekter, mangler prøver fortsatt informert samtykke.

Studieoversikt

Status

Ukjent

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

Alle 34 humane blodgruppesystemer har minst to antitetiske antigener og er av potensiell relevans under graviditet og transfusjon. Heldigvis for daglig rutinepraksis er vaksinasjoner mot fremmede antigener sjeldne. Likevel kan inkompatibiliteter forekomme i alle blodgruppesystemer og vil da kreve typing for de respektive blodgruppeantigener.

Blodgenotyping utviklet seg som den valgte metoden, i tilfeller der typereagenser er kommersielt utilgjengelige, eller blod er utilgjengelig (foster). I databaser mangler de fleste oppføringer av blodgruppegener representativ polymorfisme (f. antall alleler). Dessuten er mange blodgruppeantigener utilstrekkelig beskrevet i deres introniske og intergenetiske sekvenser. Dette gjelder resultater av ulik kryssing, genkonverteringer og store insersjoner/delesjoner mellom svært homologe gener, spesielt innenfor blodgruppesystemene til Rhesus, f.eks. henholdsvis RhD/RhCE og MN/Ss. Bare Whole Genome Sequencing (WGS) tillater løsning av begge problemene: den leverer hele blodgruppegenomet til et individ, og gjenkjenner samtidig nye blodgruppealleler, eller haplotyper. Denne forespørselen om etisk godkjenning ønsker å teste denne forutsetningen.

De antigene determinantene U- og Stones(a)+ i blodgruppesystemet MNS mangler fortsatt fullstendig genetisk beskrivelse og vil tjene som utfordrende eksempler for beskrivelsen av nye alleler (haplotyper) forårsaket av store ins/del-mutasjoner av de to svært homologe genene GYPA og B. Genomisk DNA av 2 U-prøver ble begge gitt som blindet referansemateriale fra henholdsvis New York og Wiens blodsentre. Begge giverne går tapt for oppfølging, og selv om det ikke er dokumentert bevis for å nekte de respektive giverne å bruke deres materiale i forskningsprosjekter, mangler prøver fortsatt informert samtykke. Ytterligere referanseprøver (n max=4), og prøver med mistenkt Stones(a)+ (n max=4) vil kun rekrutteres fra Zürich-blodgivere med informert samtykke.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Forventet)

8

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

  • Sveits
    • Zürich
      • Schlieren, Zürich, Sveits, 8952
        • Rekruttering
        • Blutpende Zürich, Dienstleistungszentrum
        • Ta kontakt med:

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

2 år til 66 år (Barn, Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Genomisk DNA fra 2 U-prøver ble begge levert som blindet referansemateriale fra henholdsvis New York og Wiens blodsentre. Begge giverne går tapt for oppfølging, og selv om det ikke er dokumentert bevis for å nekte de respektive giverne å bruke deres materiale i forskningsprosjekter, mangler prøver fortsatt informert samtykke. Ytterligere referanseprøver (n max=4), og prøver med mistenkt Stones(a)+ (n max=4) vil bli rekruttert fra Zürich-blodgivere med informert samtykke, kun

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Eksisterende biomateriale (gDNA), eller
  • Eksisterende helserelaterte data for blodgruppe U- (n max=2) og kvalifisert for (venøs) blodprøvetaking på 20 ml, eller
  • Eksisterende blodgruppefeno- og genotypedata som indikerer St(a)+ og kvalifisert for (venøs) blodprøvetaking på 20 mL (n max=2), eller
  • Tilstrekkelig blodgruppeprofil fungerer som referanse (n max =4 & n max =4'000) og kvalifisert for (venøs) blodprøvetaking på 20 ml.

Ekskluderingskriterier:

  • Ikke kvalifisert for venøs blodprøve på ca. 20 ml.

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Observasjonsmodeller: Case-Control

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
personer negative i bg MNSs antigen U
Blodgruppe (bg) system MNSer. Personer med fenotype "U-". Homo- og heterozygote individer kan vurderes.
Annen: Helgenomsekvensering (WGS)
Det vil ikke være behov for andre intervensjoner enn blodprøvetaking (20 ml blod) i løpet av rutinemessig bloddonasjon (450 ml blod) for 8 av 10 individer som planlegges inkludert som prøve, eller referanseprøver i studien.
personer positive i bg MNSs antigen St(a)
Blodgruppe (bg) system MNSer. Personer med fenotype "St(a)+". Homo- og heterozygote individer kan vurderes.
Annen: Helgenomsekvensering (WGS)
Det vil ikke være behov for andre intervensjoner enn blodprøvetaking (20 ml blod) i løpet av rutinemessig bloddonasjon (450 ml blod) for 8 av 10 individer som planlegges inkludert som prøve, eller referanseprøver i studien.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Helgenomsekvensering for definisjon av genetisk bakgrunn for blodgruppeantigener U-, St(a)+
Tidsramme: 2 års periode
I løpet av en 2-års tidsperiode vil generering og analyse av helgenomsekvenseringsdata bli brukt for analyse og beskrivelse av den genetiske bakgrunnen for blodgruppeantigener U negativitet, og for St(a).
2 års periode

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Blood Donation Service Zurich, SRC

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Christoph Gassner, PhD, Blutspende Zürich, Dienstleistungszentrum

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart

1. juli 2015

Primær fullføring (Forventet)

1. juni 2016

Studiet fullført (Forventet)

1. juni 2018

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

10. august 2015

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

24. august 2015

Først lagt ut (Anslag)

27. august 2015

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Anslag)

27. august 2015

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

24. august 2015

Sist bekreftet

1. august 2015

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Andre studie-ID-numre

  • KEK-ZH-Nr. 2014-0408

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere