Klinická epidemiologie křovinatého tyfu u lidí, chlumců a hlodavců
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Studovat design:
Projekt provede podrobný průzkum jedné lidské komunity a jejího prostředí, které je ohroženo křovinatým tyfem:
Chiggers, hlodavci a studie stanovišť:
Transekty napříč různými biotopy určující prostorovou distribuci druhů chiggerů a hlodavců. Bude se provádět 3x ročně.
Mapování stanovišť s vysokým rozlišením. Porovnání genomů O. tsutsugamushi detekovaných v různých prostředích pomocí pokusu WGS.
Studie vesnické kohorty:
Sledujte kohortu vesničanů po dobu 2 let, kteří vyšetřují všechny febrilní pacienty na křovitý tyfus a stanovují míru sérokonverze a infikují genotypy O. tsutsugamushi.
Postupy:
- Roztoči:
Ve spolupráci s ekologickými/GIS spolupracovníky bude zmapováno prostředí komunity a položeny transekty napříč různými biotopy používanými komunitou. Volně žijící roztoči budou sbíráni černými plastovými deskami a černou látkou21, z půdy pomocí Berlese nálevek a od hlodavců. Trombiculidní roztoči budou identifikováni podle rodu a podskupiny podle druhu.
Z jednotlivých chiggerů bude extrahována DNA a proveden qPCR screening na pozitivitu O. tsutsugamushi (real-time PCR targeting 47kDa-gen). Část potvrzených pozitiv podstoupí genotypizaci pokusem o sekvenování celého genomu (WGS).
- Hlodavci:
Hlodavci budou zachyceni živí podél transektů a identifikováni ve spolupráci s University of Montpellier24. Všichni roztoči budou z hlodavců odstraněni, hlodavci usmrceni a slezina a játra hlodavců budou odebrány pro O. tsutsugamushi qPCR screening. Část vzorků pozitivních na O. tsutsugamushi podstoupí genotypizaci pomocí WGS nebo rozšířené analýzy MLST.
- Lidská kohorta:
Všichni členové komunity (>10 let) budou osloveni a požádáni o souhlas s účastí. Všem přihlášeným se bude každé 4 měsíce po dobu 2 let provádět test ELISA/IFA na tyfus (z krevních skvrn z filtračního papíru vpichem do prstu), aby se odhadla rychlost a dynamika sérokonverze. Při každé návštěvě bude rozdán krátký dotazník, který určí, zda měl účastník v předchozích 4 měsících horečnaté onemocnění.
Pacienti s horečnatým onemocněním v místních zdravotnických zařízeních budou klinicky vyšetřeni a provede se na místě rychlý diagnostický test IgM na tyfus (RDT). RDT pozitivní pacienti budou přijati do studie a spárované akutní/rekonvalescentní vzorky budou odeslány do LOMWRU pro ELISA, qPCR a BSL3 kultivaci, po které bude následovat genotypizace pomocí WGS. Rekrutovaným pacientům bude podán dotazník ke stanovení symptomatologie a zaznamenaných vitálních funkcí.
Epidemiologie a ekologie:
Přesná místa odběru vzorků a podrobnosti o stanovišti budou zaznamenány.
Genomické analýzy:
Abychom charakterizovali vztahy mezi vysoce různorodými genotypy O. tsutsugamushi u hostitelů infikovaných více kmeny/genotypem, podíl qPCR pozitivních (cca. 480 vzorků) bude analyzováno celogenomovým sekvenováním na WTCHG v Oxfordu.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Skupina 1 Muži nebo ženy ve věku 10 let nebo starší s horečkou
Skupina 2 Muži nebo ženy, ve věku 10 let nebo více, žijící v prostředí s křovinatým tyfem
Popis
Kritéria pro zařazení:
Akutní křovinatý tyfus (skupina 1)
- S horečkou >38 C a pozitivním testem na tyfus RDT.
- Muž nebo žena ve věku 10 let nebo více.
- Účastník je ochoten a schopen dát informovaný souhlas s účastí ve studii.
Sérový průzkum tyfu (skupina 2)
- Vesničané žijící v prostředí, kde je známo, že se vyskytuje křovinný tyfus, jsou asymptomatičtí.
- Muž nebo žena ve věku 10 let nebo více.
- Účastník je ochoten a schopen dát informovaný souhlas s účastí ve studii.
Kritéria vyloučení:
Akutní křovinatý tyfus (skupina 1)
- Vesničané/pacienti mladší 10 let.
- Ti, kteří nejsou ochotni dát písemný informovaný souhlas.
Sérový průzkum tyfu (skupina 2)
- Vesničané/pacienti mladší 10 let.
- Ti, kteří nejsou ochotni dát písemný informovaný souhlas.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Budoucí
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Akutní křovinatý tyfus (skupina 1)
Účastníci s horečkou obdrží ústní souhlas s použitím RDT křoviny tyfu
|
|
Sérový průzkum tyfu (skupina 2)
Vesničané, kteří žijí v identifikovaném prostředí s křovinovým tyfem, budou o studii informováni a požádáni o písemný informovaný souhlas.
Pokud souhlasí s připojením ke studii, budou požádáni, aby provedli test DBS (prst prick dry blood spot), na kterém budou provedeny testy ELISA na tyfus a IFA.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
určit rozmanitost genotypů O. tsutsugamushi infikujících hlodavce a roztoče a spojit je s jejich geografickým rozšířením a souvisejícími charakteristikami stanovišť.
Časové okno: až 24 měsíců
|
až 24 měsíců
|
|
Porovnejte četnost O. tsutsugamushi u roztočů a hlodavců s charakteristikami stanoviště, abyste definovali interakce mezi distribucí a dynamikou přenosu.
Časové okno: až 24 měsíců
|
až 24 měsíců
|
|
Identifikujte klíčové přenašeče roztočů a hlodavce, kteří se podílejí na přirozené historii křovinového tyfu, lidské infekci a virulenci onemocnění
Časové okno: až 24 měsíců
|
až 24 měsíců
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
Určete změny v titrech protilátek proti křovinatému tyfu v průběhu času a identifikujte akutně infikované případy křového tyfu
Časové okno: až 24 měsíců
|
až 24 měsíců
|
|
Identifikujte genotypy O. tsutsugamushi odvozené od člověka a definujte genomické vztahy mezi genotypy odvozenými od člověka, hlodavců a roztočů.
Časové okno: až 24 měsíců
|
až 24 měsíců
|
|
Identifikujte domnělé determinanty lidské infekce/virulence
Časové okno: až 24 měsíců
|
až 24 měsíců
|
|
Propojit distribuci O. tsutsugamushi pozitivních roztočů, hlodavců a lidí s charakteristikami stanovišť a navrhnout intervence ke snížení rizika lidských onemocnění.
Časové okno: až 24 měsíců
|
až 24 měsíců
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhad)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- OxTREC no. 48-15
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .