Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Scrub typhusin kliininen epidemiologia ihmisillä, näppylillä ja jyrsijöillä

tiistai 28. syyskuuta 2021 päivittänyt: University of Oxford
Tässä tutkimuksessa kerätään ja tunnistetaan jyrsijöitä ja punkkeja transekttien poikki erilaisten elinympäristöjen kautta, joita ihmisyhteisö käyttää paikalliselta alueelta, joka on tunnistettu lavantautien "kuumaksi paikaksi".

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Valmis

Ehdot

Yksityiskohtainen kuvaus

Opintojen suunnittelu:

Hankkeessa tehdään yksityiskohtainen tutkimus yhdestä ihmisyhteisöstä ja sen ympäristöstä, jossa on lavantautiriski:

Chiggers, jyrsijät ja elinympäristötutkimus:

Se kulkee erilaisten elinympäristöjen poikki, mikä määrittää sika- ja jyrsijälajien alueellisen jakautumisen. Tämä tehdään 3 kertaa vuodessa.

Korkearesoluutioinen luontotyyppikartoitus. Eri ympäristöissä havaittujen O. tsutsugamushin genomien vertailu WGS-yritysten avulla.

Kyläkohorttitutkimus:

Seuraa yli 2 vuoden kyläläisten kohorttia seulomassa kaikkia kuumeisia potilaita kuurin lavantautien varalta ja määrittämällä serokonversioaste ja tartuttavat O. tsutsugamushi -genotyypit.

Toimenpiteet:

  • Punkit:

Yhteistyössä ekologian/GIS-yhteistyökumppaneiden kanssa yhteisön ympäristö kartoitetaan ja transektit asetetaan yhteisön käyttämien monimuotoisten elinympäristöjen poikki. Vapaana elävät punkit kerätään mustilla muovilevyillä ja mustalla kankaalla21, maasta Berlese-suppiloilla ja jyrsijöiltä. Trombikulidipunkit tunnistetaan sukuun ja alajoukko lajeihin.

DNA uutetaan yksittäisistä chiggereistä ja suoritetaan qPCR-seulonta O. tsutsugamushi-positiivisuuden varalta (reaaliaikainen PCR kohdistuu 47 kDa-geeniin). Osa vahvistetuista positiivisista testataan genotyypityksenä koko genomin sekvensoinnin (WGS) avulla.

  • Jyrsijät:

Jyrsijät vangitaan elävinä transekteilta ja tunnistetaan yhteistyössä Montpellierin yliopiston24 kanssa. Jyrsijöistä poistetaan kaikki punkit, jyrsijät tapetaan ja jyrsijöiden perna ja maksa kerätään O. tsutsugamushi qPCR-seulontaa varten. Osalle O. tsutsugamushi-positiivisista näytteistä tehdään genotyypitys WGS- tai laajennetun MLST-analyysin avulla.

  • Ihmiskohortti:

Kaikkia yhteisön jäseniä (>10-vuotiaita) lähestytään ja pyydetään suostumus osallistumiseen. Kaikille ilmoittautuneille suoritetaan typhuus ELISA/IFA (sormenpistossuodatinpaperin veripisteistä) 4 kuukauden välein 2 vuoden ajan serokonversion nopeuden ja dynamiikan arvioimiseksi. Jokaisella käynnillä laaditaan lyhyt kyselylomake sen selvittämiseksi, onko osallistujalla ollut kuumetauti viimeisen 4 kuukauden aikana.

Kuumesairautta sairastaville paikallisille terveydenhuollon laitoksille tehdään kliininen arviointi ja paikan päällä suoritettava typfuksen IgM-pikadiagnostiikkatesti (RDT). RDT-positiiviset potilaat värvätään tutkimukseen ja parilliset akuutit/toipuvat näytteet lähetetään LOMWRU:lle ELISA-, qPCR- ja BSL3-viljelyä varten, minkä jälkeen suoritetaan genotyypitys WGS-yrityksellä. Rekrytoiduille potilaille lähetetään kysely oireiden ja kirjattujen elintoimintojen määrittämiseksi.

Epidemiologia ja ekologia:

Tarkat näytteenottopaikat ja elinympäristötiedot kirjataan.

Genomianalyysit:

Erittäin monimuotoisten O. tsutsugamushi -genotyyppien välisten suhteiden karakterisoimiseksi useissa kannoissa/genotyypin infektoituneissa isännissä qPCR-positiivisten (n. 480 näytettä) analysoidaan koko genomin sekvensoinnilla WTCHG:ssä Oxfordissa.

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Odotettu)

1200

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

6 vuotta ja vanhemmat (Lapsi, Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Ryhmä 1 Mies tai nainen, vähintään 10-vuotiaat, joilla on kuumetta

Ryhmä 2 Mies tai naaras, vähintään 10-vuotias, joka elää tunnistetussa pensaikkolavantautiympäristössä

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

Akuutti kuurin lavantauti (ryhmä 1)

  1. Esiintyy yli 38 C kuumeella ja positiivinen testi typhus RDT:llä.
  2. Mies tai nainen, vähintään 10-vuotias.
  3. Osallistuja on halukas ja kykenevä antamaan tietoisen suostumuksen tutkimukseen osallistumiselle.

Scrub typhus serosurvey (ryhmä 2)

  1. Kyläläiset, jotka asuvat ympäristössä, jossa tiedetään esiintyvän lavantautia, jotka ovat oireettomia.
  2. Mies tai nainen, vähintään 10-vuotias.
  3. Osallistuja on halukas ja kykenevä antamaan tietoisen suostumuksen tutkimukseen osallistumiselle.

Poissulkemiskriteerit:

Akuutti kuurin lavantauti (ryhmä 1)

  1. Kyläläiset/alle 10-vuotiaat potilaat.
  2. Ne, jotka eivät halua antaa kirjallista tietoon perustuvaa suostumusta.

Scrub typhus serosurvey (ryhmä 2)

  1. Kyläläiset/alle 10-vuotiaat potilaat.
  2. Ne, jotka eivät halua antaa kirjallista tietoon perustuvaa suostumusta.

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Havaintomallit: Kohortti
  • Aikanäkymät: Tulevaisuuden

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Akuutti kuurin lavantauti (ryhmä 1)
Kuumetta esiintyville osallistujille annetaan suullinen suostumus kuurin lavantautiin käyttämällä
Scrub typhus serosurvey (ryhmä 2)
Kyläläisille, jotka asuvat tunnistetussa pensaikkolavantautiympäristössä, tiedotetaan tutkimuksesta ja heitä pyydetään antamaan kirjallinen tietoinen suostumus. Jos he suostuvat osallistumaan tutkimukseen, heitä pyydetään antamaan sormenpäällä kuivattu veripiste (DBS) -testi, jolle suoritetaan pensastautien ELISA ja IFA.

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Aikaikkuna
määrittää jyrsijöitä ja punkkeja tartuttavien O. tsutsugamushi -genotyyppien monimuotoisuuden ja liittää ne niiden maantieteelliseen levinneisyyteen ja niihin liittyviin elinympäristön ominaisuuksiin.
Aikaikkuna: jopa 24 kuukautta
jopa 24 kuukautta
Korreloi O. tsutsugamushin esiintymistiheys punkeissa ja jyrsijöissä elinympäristön ominaisuuksien kanssa määrittääksesi leviämis- ja leviämisdynamiikan väliset vuorovaikutukset.
Aikaikkuna: jopa 24 kuukautta
jopa 24 kuukautta
Tunnista tärkeimmät punkkivektorit ja jyrsijäisännät, jotka osallistuvat lavantautien luonnonhistoriaan, ihmisen infektioon ja taudin virulenssiin
Aikaikkuna: jopa 24 kuukautta
jopa 24 kuukautta

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Aikaikkuna
Selvitä kuurin lavantautivasta-ainetittereiden muutokset ajan myötä ja tunnista akuutisti tartunnan saaneet lavantautitapaukset
Aikaikkuna: jopa 24 kuukautta
jopa 24 kuukautta
Tunnista ihmisperäiset O. tsutsugamushin genotyypit määrittääksesi genomisuhteet ihmis-, jyrsijä- ja punkkiperäisten genotyyppien välillä.
Aikaikkuna: jopa 24 kuukautta
jopa 24 kuukautta
Tunnista ihmisen infektion/virulenssin oletetut tekijät
Aikaikkuna: jopa 24 kuukautta
jopa 24 kuukautta
O. tsutsugamushi -positiivisten punkkien, jyrsijöiden ja ihmisten leviämisen yhdistäminen elinympäristön ominaisuuksiin, jotta voidaan ehdottaa toimia ihmisten sairauksien riskin vähentämiseksi.
Aikaikkuna: jopa 24 kuukautta
jopa 24 kuukautta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Torstai 1. syyskuuta 2016

Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)

Tiistai 10. huhtikuuta 2018

Opintojen valmistuminen (Todellinen)

Maanantai 31. joulukuuta 2018

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Torstai 18. elokuuta 2016

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Maanantai 22. elokuuta 2016

Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)

Tiistai 23. elokuuta 2016

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Keskiviikko 29. syyskuuta 2021

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 28. syyskuuta 2021

Viimeksi vahvistettu

Keskiviikko 1. syyskuuta 2021

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

Joo

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Scrub Typhus

Tilaa