Den kliniske epidemiologi af krattyfus hos mennesker, chiggers og gnavere
Studieoversigt
Status
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
Studere design:
Projektet vil foretage en detaljeret undersøgelse af et menneskeligt samfund og dets miljø med risiko for krattyfus:
Chiggers, gnavere og habitatundersøgelse:
Transekter på tværs af forskellige levesteder, der bestemmer den rumlige fordeling af arter af chiggers og gnavere. Dette vil blive udført 3 gange om året.
Kortlægning af habitat i høj opløsning. Sammenligning af genomer af O. tsutsugamushi påvist i forskellige miljøer ved hjælp af forsøg på WGS.
Landsbykohorteundersøgelse:
Følg en kohorte af landsbyboere over 2 år, der screener alle febrile patienter for krattyfus og bestemmer serokonversionsrater og inficerer O. tsutsugamushi genotyper.
Procedurer:
- Mider:
I samarbejde med økologi/GIS-samarbejdspartnere vil miljøet i samfundet blive kortlagt og transekter lagt på tværs af de forskellige habitater, der bruges af samfundet. Fritlevende mider vil blive indsamlet med sorte plastikplader og sort klæde21, fra jord ved hjælp af Berlese-tragte og fra gnavere. Trombiculid mider vil blive identificeret til slægt og en undergruppe til arter.
DNA vil blive ekstraheret fra individuelle chiggere, og qPCR-screening for O. tsutsugamushi-positivitet udføres (real-time PCR målrettet 47kDa-gen). En andel af bekræftede positive vil gennemgå genotypebestemmelse ved forsøg på hel-genom-sekventering (WGS).
- Gnavere:
Gnavere vil blive fanget levende langs transekter og identificeret i samarbejde med University of Montpellier24. Alle mider vil blive fjernet fra gnavere, gnaverne bliver dræbt og gnaverens milt og lever indsamlet til O. tsutsugamushi qPCR-screening. En del af O. tsutsugamushi-positive prøver vil gennemgå genotypebestemmelse ved forsøg på WGS eller udvidet MLST-analyse.
- Menneskelig kohorte:
Alle i samfundet (>10 år) vil blive kontaktet og bedt om samtykke til at deltage. Alle tilmeldte vil have scrub tyfus ELISA/IFA (fra fingerprikkede filterpapirblodpletter) udført hver 4. måned over 2 år for at estimere hastigheden og dynamikken af serokonversion. Et kort spørgeskema vil blive administreret ved hvert besøg for at afgøre, om deltageren har haft febersygdom i de foregående 4 måneder.
Patienter, der præsenterer sig med en febril sygdom til lokale sundhedsfaciliteter, vil blive klinisk vurderet, og en on-site scrub tyfus IgM hurtig diagnostisk test (RDT) vil blive udført. RDT-positive patienter vil blive rekrutteret til undersøgelsen, og parrede akutte/rekonvalescente prøver sendes til LOMWRU til ELISA, qPCR og BSL3 kultur, efterfulgt af genotypebestemmelse ved forsøg med WGS. Et spørgeskema vil blive administreret til rekrutterede patienter for at bestemme symptomatologi og registrerede vitale tegn.
Epidemiologi og økologi:
De nøjagtige prøveindsamlingssteder og habitatdetaljer vil blive registreret.
Genomiske analyser:
For at karakterisere forholdet mellem meget forskellige O. tsutsugamushi-genotyper i multiple stamme-/genotype-inficerede værter en andel af qPCR-positive (ca. 480 prøver) vil blive analyseret ved hel-genom-sekventering ved WTCHG i Oxford.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Gruppe 1 Mand eller Kvinde, 10 år eller derover, med feber
Gruppe 2 Mand eller Kvinde, i alderen 10 år eller derover, der bor i et identificeret krattyfus-miljø
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
Akut krattyfus (gruppe 1)
- Viser sig med feber >38 C og tester positiv ved scrub tyfus RDT.
- Mand eller kvinde, i alderen 10 år eller derover.
- Deltageren er villig og i stand til at give informeret samtykke til deltagelse i undersøgelsen.
Skrubtyfus serosurvey (gruppe 2)
- Landsbyboere, der bor i et miljø, hvor krattyfus er kendt for at være til stede, som er asymptomatiske.
- Mand eller kvinde, i alderen 10 år eller derover.
- Deltageren er villig og i stand til at give informeret samtykke til deltagelse i undersøgelsen.
Ekskluderingskriterier:
Akut krattyfus (gruppe 1)
- Landsbyboere/patienter under 10 år.
- Dem, der ikke er villige til at give skriftligt informeret samtykke.
Skrubtyfus serosurvey (gruppe 2)
- Landsbyboere/patienter under 10 år.
- Dem, der ikke er villige til at give skriftligt informeret samtykke.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
|---|
|
Akut krattyfus (gruppe 1)
Deltagere, der præsenterer sig med feber, vil blive mundtligt givet samtykke til en scrub tyfus RDT, vha
|
|
Skrubtyfus serosurvey (gruppe 2)
Landsbyboere, der bor i et identificeret krattyfus-miljø, vil blive informeret om undersøgelsen og bedt om at give skriftligt informeret samtykke.
Hvis de accepterer at deltage i undersøgelsen, vil de blive bedt om at give en fingerprikket tørret blodplet (DBS) test, hvorpå scrub tyfus ELISA og IFA vil blive udført.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
bestemme mangfoldigheden af O. tsutsugamushi genotyper, der inficerer gnavere og mider og knytte disse til deres geografiske udbredelse og tilhørende habitatkarakteristika.
Tidsramme: op til 24 måneder
|
op til 24 måneder
|
|
Korreler hyppigheden af O. tsutsugamushi i mider og gnavere med habitatkarakteristika for at definere interaktioner mellem distribution og transmissionsdynamik.
Tidsramme: op til 24 måneder
|
op til 24 måneder
|
|
Identificer nøglemidevektorer og gnaverværter involveret i krattyfus naturhistorie, menneskelig infektion og sygdomsvirulens
Tidsramme: op til 24 måneder
|
op til 24 måneder
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Bestem ændringer i scrub tyfus antistof titre over tid og identificer akut inficerede scrub tyfus tilfælde
Tidsramme: op til 24 måneder
|
op til 24 måneder
|
|
Identificer human-afledte O. tsutsugamushi genotyper for at definere genomiske forhold mellem humane, gnavere og mide-afledte genotyper.
Tidsramme: op til 24 måneder
|
op til 24 måneder
|
|
Identificer formodede determinanter for human infektion/virulens
Tidsramme: op til 24 måneder
|
op til 24 måneder
|
|
At sammenkæde fordelingen af O. tsutsugamushi positive mider, gnavere og mennesker med habitatkarakteristika for at foreslå indgreb for at reducere risikoen for menneskelig sygdom.
Tidsramme: op til 24 måneder
|
op til 24 måneder
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Studieafslutning (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Skøn)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- OxTREC no. 48-15
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .