ヒト、ツツガムシ、げっ歯類における発疹チフスの臨床疫学
調査の概要
状態
条件
詳細な説明
研究デザイン:
このプロジェクトは、発疹チフスの危険にさらされている 1 つの人間のコミュニティとその環境の詳細な調査を行います。
ツツガムシ、げっ歯類、生息地の研究:
ツツガムシとげっ歯類の種の空間分布を決定する多様な生息地を横断します。 これは、年に 3 回実行されます。
高解像度の生息地マッピング。 試行された WGS を使用して、異なる環境で検出された O. tsutsugamushi のゲノムの比較。
村のコホート研究:
村人のコホートを 2 年以上追跡し、発疹チフスについてすべての熱性患者をスクリーニングし、セロコンバージョン率を決定し、O. tsutsugamushi 遺伝子型に感染します。
手順:
- ダニ:
エコロジー/GIS の協力者と協力して、コミュニティの環境がマッピングされ、コミュニティが使用する多様な生息地にトランセクトが配置されます。 自由生活ダニは、黒いプラスチック プレートと黒い布で収集されます21、ベルレーズ漏斗を使用して土壌から、およびげっ歯類から。 Trombiculid ダニは属に分類され、サブセットは種に分類されます。
個々のツツガムシから DNA を抽出し、O. tsutsugamushi 陽性の qPCR スクリーニングを行います (47kDa 遺伝子をターゲットとするリアルタイム PCR)。 確認された陽性者の一部は、試行された全ゲノム配列決定 (WGS) によるジェノタイピングを受けます。
- げっ歯類:
げっ歯類は、トランセクトに沿って生きたまま捕獲され、モンペリエ大学と共同で識別されます24。 すべてのダニをげっ歯類から除去し、げっ歯類を殺し、げっ歯類の脾臓と肝臓を O. tsutsugamushi qPCR スクリーニング用に収集します。 O. tsutsugamushi 陽性サンプルの一部は、試行された WGS または拡張 MLST 分析によるジェノタイピングを受けます。
- 人間のコホート:
コミュニティ内のすべての人 (10 歳以上) にアプローチし、参加の同意を求めます。 登録された全員が発疹チフス ELISA/IFA (指を刺したろ紙の血液スポットから) を 2 年間にわたって 4 か月ごとに実行し、セロコンバージョンの速度とダイナミクスを推定します。 参加者が過去4か月間に熱性疾患を患っていたかどうかを判断するために、訪問ごとに簡単なアンケートが実施されます。
地元の医療施設に熱性疾患を呈している患者は、臨床的に評価され、現場で発疹チフス IgM 迅速診断検査 (RDT) が実施されます。 RDT 陽性患者を研究に募集し、ELISA、qPCR、および BSL3 培養のために LOMWRU にペアの急性/回復期サンプルを送った後、WGS によるジェノタイピングを試みます。 募集された患者にアンケートを実施して、記録された症状およびバイタルサインを判断します。
疫学と生態学:
正確なサンプル収集場所と生息地の詳細が記録されます。
ゲノム解析:
複数の菌株/遺伝子型感染宿主における非常に多様な O. tsutsugamushi 遺伝子型間の関係を特徴付けるために、qPCR 陽性の割合 (約 480 サンプル) は、オックスフォードの WTCHG で全ゲノム配列決定によって分析されます。
研究の種類
入学 (予想される)
参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
グループ1 発熱のある10歳以上の男性または女性
グループ 2 男性または女性、10 歳以上、確認された発疹チフス環境に住んでいる
説明
包含基準:
急性発疹チフス (グループ 1)
- 38℃を超える発熱があり、発疹チフスRDTによる検査で陽性。
- 10歳以上の男性または女性。
- -参加者は、研究への参加についてインフォームドコンセントを喜んで提供することができます。
発疹チフス血清調査 (グループ 2)
- 発疹チフスが存在することが知られている環境に住んでいる無症状の村人。
- 10歳以上の男性または女性。
- -参加者は、研究への参加についてインフォームドコンセントを喜んで提供することができます。
除外基準:
急性発疹チフス (グループ 1)
- 10歳未満の村人/患者。
- -書面によるインフォームドコンセントを提供したくない人。
発疹チフス血清調査 (グループ 2)
- 10歳未満の村人/患者。
- -書面によるインフォームドコンセントを提供したくない人。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:コホート
- 時間の展望:見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
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急性発疹チフス (グループ 1)
熱を呈している参加者は、発疹チフスRDTに口頭で同意します。
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発疹チフス血清調査 (グループ 2)
特定された発疹チフス環境に住んでいる村人は、調査について通知され、書面によるインフォームド コンセントを提供するよう求められます。
彼らが研究に参加することに同意した場合、発疹チフス ELISA および IFA が実行される指刺し乾燥血液スポット (DBS) テストを行うように求められます。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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げっ歯類やダニに感染するツツガムシ属の遺伝子型の多様性を決定し、それらの地理的分布と関連する生息地の特徴と関連付けます。
時間枠:24ヶ月まで
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24ヶ月まで
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ダニおよびげっ歯類における O. tsutsugamushi の頻度を生息地の特性と関連付けて、分布と伝達のダイナミクス間の相互作用を定義します。
時間枠:24ヶ月まで
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24ヶ月まで
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発疹チフスの自然史、人への感染、病気の病原性に関与する主要なダニ媒介動物とげっ歯類宿主を特定する
時間枠:24ヶ月まで
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24ヶ月まで
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二次結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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発疹チフスの抗体価の経時変化を測定し、急性感染した発疹チフスの症例を特定します
時間枠:24ヶ月まで
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24ヶ月まで
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ヒト由来の O. tsutsugamushi 遺伝子型を特定して、ヒト、げっ歯類、およびダニ由来の遺伝子型間のゲノム関係を定義します。
時間枠:24ヶ月まで
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24ヶ月まで
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ヒト感染/病原性の推定決定要因を特定する
時間枠:24ヶ月まで
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24ヶ月まで
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O. tsutsugamushi 陽性のダニ、げっ歯類、およびヒトの分布を生息地の特性と結び付けて、ヒトの病気のリスクを軽減するための介入を提案する。
時間枠:24ヶ月まで
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24ヶ月まで
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協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (見積もり)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- OxTREC no. 48-15
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
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