Transkripční a imminové parametry odpovědi na Belinumab

Nadbytek aktivačního faktoru B-buněk (BAFF) způsobuje onemocnění lupus tím, že má kostimulační účinky na kompartment B-buněk, ale také na různé podskupiny jiných než B-buněk, jako jsou T-pomocné buňky a monocyty/dendritické buňky. Aktualizovaná doporučení Evropské ligy proti revmatismu (EULAR) pro SLE z roku 2019 doporučují použití belimumabu (anti-BAFF mAb) u perzistentně aktivních nebo propukajících onemocnění na základě důkazů o účinnosti, snížení vzplanutí a nárůstu poškození orgánů bez zvýšení rizika infekcí. Přesto je belimumab obvykle vyhrazen pro prokázané, refrakterní případy. Je možné, že dřívější použití může zastavit progresi onemocnění, zejména zabránit vzplanutí a dysfunkci hlavních orgánů. Výzkumníci dokončili kombinovanou genetickou a transkriptomickou analýzu v periferní krvi pacientů se SLE a charakterizovali odlišné genové podpisy pro aktivitu/vzplanutí onemocnění a závažnost. Pomocí technik strojového učení mohou vyšetřovatelé předpovídat pacienty se SLE, u kterých je pravděpodobné, že se u nich rozvine postižení velkých orgánů. Studie in vitro a genového profilování na purifikovaných lupus monocytech naznačují, že tyto buňky existují – pod účinkem interferonu typu I – ve „vysokém pohotovostním“ autoreaktivním a metabolickém stavu (připomínajícím „trénovanou imunitu“), což může přispívat k riziku vzplanutí poškození tkáně, ale také hlavní komorbidity pozorované u SLE, zejména akcelerovaná ateroskleróza a infekce. Na základě dosud nashromážděných klinických zkušeností je pravděpodobné, že belimumab může neutralizovat tyto molekulární signatury pro vzplanutí a progresi onemocnění, aniž by interferoval s imunitními cestami obrany hostitele.

Vyšetřovatelé navrhují provést nejprve sekvenování RNA z plné krve u kohorty 80 pacientů se SLE, kteří budou dostávat belimumab jako součást standardní klinické praxe, aby bylo možné vyhodnotit intra-pacientův longitudinální průběh (výchozí stav, 1, 3 a 6 měsíců) změny transkriptomu a zkoumat, zda léčba může zlepšit zjištěnou aktivitu/vzplanutí, závažnost a příznaky onemocnění hlavních orgánů. Výzkumníci také získají předběžné informace o molekulárních signaturách predikujících klinické odpovědi a dopadu belimumabu na genové signatury obrany hostitele proti virovým a bakteriálním (včetně mykobakteriálním) patogenům. Pomocí modulů genů specifických pro buněčný typ a koexpresních genových sítí vědci rozloží naše data, aby definovali příslušné molekulární změny ve specifických typech imunitních buněk. Výsledky budou validovány a funkčně charakterizovány pomocí jednobuněčné hmotnostní cytometrie (prováděné ve výše uvedených časových bodech), která umožňuje zkoumat identitu buněk (včetně podskupin B-buněk a myeloidních buněk, které mají zvláštní význam pro onemocnění) a stav aktivace při hladina bílkovin (např. fosforylace) prostřednictvím vysokorozměrné průtokové cytometrie nové generace. Prostřednictvím cílené analýzy dekonvolutované RNA-seq a dat z hmotnostní cytometrie následované cílenými studiemi genové exprese a funkce v purifikovaných monocytech vědci určí, zda belimumab dokáže obnovit monocyty „primované SLE“ a zmírnit tak jejich zánětlivý a proaterogenní fenotyp. a zvýšení jejich baktericidní aktivity. Souhrnně tyto studie poskytnou nové mechanické poznatky o prospěšném poměru účinnosti/toxicity terapie belimumabem u SLE a zároveň podpoří rané použití léku.