Parametri trascrizionali e immini di risposta a Belinumab

L'eccesso di fattore di attivazione delle cellule B (BAFF) causa la malattia del lupus esercitando effetti di costimolazione sul compartimento delle cellule B ma anche su una varietà di sottoinsiemi di cellule non B come le cellule T-helper e i monociti/cellule dendritiche. Le raccomandazioni aggiornate del 2019 della European League Against Rheumatism (EULAR) per il LES raccomandano l'uso di belimumab (anti-BAFF mAb) nella malattia persistentemente attiva o riacutizzata sulla base di prove di efficacia, riduzione delle riacutizzazioni e accumulo di danno d'organo senza aumentare il rischio di infezioni. Tuttavia, belimumab è solitamente riservato a casi consolidati e refrattari. È concepibile che l'uso precedente possa arrestare la progressione della malattia, in particolare prevenire riacutizzazioni e disfunzioni nei principali organi. I ricercatori hanno completato un'analisi genetica e trascrittomica combinata nel sangue periferico dei pazienti affetti da LES e hanno caratterizzato firme genetiche distinte per attività/riacutizzazione della malattia e gravità. Utilizzando tecniche di apprendimento automatico, i ricercatori possono prevedere che i pazienti affetti da LES probabilmente svilupperanno un coinvolgimento di organi importanti. Studi in vitro e di profilazione genica nei monociti di lupus purificati indicano che queste cellule esistono - sotto l'effetto dell'interferone di tipo I - in uno stato autoreattivo e metabolico di "alto livello di allerta" (che ricorda l'"immunità allenata"), che può contribuire al rischio di riacutizzazioni , lesioni tissutali ma anche importanti comorbilità osservate nel LES, in particolare aterosclerosi accelerata e infezioni. Sulla base dell'esperienza clinica accumulata finora, è probabile che belimumab possa neutralizzare queste firme molecolari per le riacutizzazioni e la progressione della malattia senza interferire con le vie immunitarie di difesa dell'ospite.

I ricercatori propongono di eseguire inizialmente il sequenziamento dell'RNA del sangue intero, in una coorte di 80 pazienti affetti da LES che riceveranno belimumab come parte della pratica clinica standard, al fine di valutare l'analisi longitudinale intra-paziente (basale, 1, 3 e 6 mesi) cambiamenti del trascrittoma ed esaminare se il trattamento può migliorare l'attività/riacutizzazione identificata, la gravità e le principali firme della malattia d'organo. I ricercatori otterranno anche informazioni preliminari sulle firme molecolari che prevedono le risposte cliniche e l'impatto di belimumab sulle firme geniche della difesa dell'ospite contro i patogeni virali e batterici (compresi i micobatteri). Utilizzando moduli di geni specifici del tipo di cellula e reti di geni di coespressione, i ricercatori deconvoluteranno i nostri dati per definire le alterazioni molecolari pertinenti in specifici tipi di cellule immunitarie. I risultati saranno convalidati e funzionalmente caratterizzati mediante citometria di massa a singola cellula (eseguita nei punti temporali di cui sopra), che consente di indagare l'identità cellulare (inclusi sottogruppi di cellule B e cellule mieloidi di particolare rilevanza per la malattia) e lo stato di attivazione a livello proteico (es. fosforilazione) attraverso la citometria a flusso ad alta dimensione di nuova generazione. Attraverso un'analisi mirata dell'RNA-seq deconvoluto e dei dati di citometria di massa seguiti da studi di espressione e funzione genica mirati in monociti purificati, i ricercatori determineranno se belimumab può ripristinare i monociti "SLE-innescati", alleviando così il loro fenotipo infiammatorio e pro-aterogeno e migliorare la loro attività battericida. Collettivamente, questi studi forniranno nuove intuizioni meccanicistiche sul rapporto beneficio efficacia/tossicità della terapia con belimumab nel LES, supportando al contempo l'uso precoce del farmaco.