Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Založení biobanky lidské střevní a slinné mikrobioty - Gastrointestinální onemocnění (BIOMIS-Gastr)

Náklady na Della Biobanca Del Microbiota Intestinale a Salivare Umano: Dalla Disbiosi Alla Simbiosi

Jedná se o prospektivní, klinickou, multicentrickou studii zaměřenou na odběr biologických vzorků a studium mikrobioty od subjektů s Clostridium Difficile (CDI), subjektů postižených infekcí multirezistentními organismy (MDRO), subjektů s chronickým zánětlivým střevním onemocněním (IBD), subjektů s Syndrom dráždivého tračníku (IBS), subjekty s jaterní encefalopatií a od zdravých dobrovolníků. Microbiota je komplexní konsorcium mikroorganismů nacházející se na úrovni sliznic (zejména střevní, orální a vaginální), které mají klíčovou roli v lidském zdraví a při vzniku řady onemocnění. Změny mikroflóry byly zjištěny u několika onemocnění (gastrointestinálních, metabolických, ledvinových, onkologických, gynekologických)

Studie umožní:

  • Poskytnout biologické vzorky (trus, sliny, krev, moč) od zdravých dobrovolníků a pacientů první italské biobance mikrobioty;
  • Studium mikroorganismů pomocí různých technik in vitro a in vivo;
  • Studujte souvislost mezi mikrobiotou a nemocí. Tato studie je součástí projektu BIOMIS (kód projektu: ARS01_01220), prezentovaného jako součást „Avviso per la presentazione di progetti di ricerca industriale e sviluppo sperimentale nelle 12 aree di specializzazione individuate dal PNR 2015-2020 přijatého financování v rámci PNR 2015-2020 Národní operační program "Ricerca e Innovazione" 2014-2020 ředitelským výnosem MIUR - Odbor pro vysoké školství a výzkum - č. 2298 ze dne 12. září 2018. BIOMIS zahrnuje několik klinických studií, které zahrnují pacienty s různými patologickými stavy, aby sbírali a uchovávali biologické vzorky a studovali mikroflóru.

Přehled studie

Detailní popis

Primárním cílem této multicentrické studie je naplnit první národní biobanku mikrobiomů biologickými vzorky (fekální, slinné, močové a krevní vzorky), subjekty trpícími vybraným onemocněním (CDI, MDRO, IBD, IBS a jaterní encefalopatie) a zdravými dobrovolníky.

Sekundárním cílem je charakterizace mikroorganismů biobanky a studium vztahu mikrobiota-patologie pomocí meta-omických, in vitro a in vivo přístupů.

Studie plánuje zapsat 225 subjektů na Policlinico of Bari, University of Perugia a Policlinico Agostino Gemelli Rome podle kritérií pro zařazení/vyloučení. Účast ve studii je dobrovolná a subjekty mají právo ze studie kdykoli a z jakéhokoli důvodu odstoupit.

Během studie jsou plánovány 3 návštěvy:

  • Návštěva 0 (V0), včetně popisu cílů a postupů studie, podpis písemného informovaného souhlasu, vyhodnocení kritérií zařazení/vyloučení, lékařské vyšetření (měření krevního tlaku, fyzikální vyšetření břicha a hrudníku), vyplnění anamnestického dotazníku, doručení koprodultivační soupravu, dodání souprav pro odběr fekálního, slinného a močového materiálu, které mají být hlášeny při návštěvě 1, a dodání 3denního potravinového deníku, který se má vyplnit samostatně ve dnech předcházejících návštěvě 1.
  • Návštěva 1 (V1) - minimálně 4 dny po V0, včetně dodání odebraného biologického materiálu (trus, sliny, moč) a 3denního stravovacího deníku, vyplnění anamnestického dotazníku nových příznaků a příznaků a odběr krve zdravotnickým personálem. Pro pacienty s MDRO odběr rektálního výtěru.
  • Telefonické vyhodnocení: administrace "Food Frequency Questionnaire" k posouzení stravovacích návyků subjektů.

Pro zajištění stability vzorků a potvrzení platnosti a kvality výsledků budou přijaty standardní operační postupy (SOP) pro skladování, přepravu a zpracování vzorků.

Následující odběry budou vzorky zpracovány v různých alikvotech, které budou použity pro:

  • rutinní screening;
  • uložení v první italské biobance lidských mikrobiotů (I.R.C.C.S. - Istituto Tumori "Giovanni Paolo II", Bari);
  • hodnocení proteomického, metascriptomického, metabolomického, metagenomického a metagenetického profilu;
  • Hodnocení transkriptomického profilu PBMC zdravých subjektů a subjektů postižených vybranými patologiemi a hodnocení sérového proteomického profilu Dále bude provedena molekulární charakterizace patogenních mikroorganismů a patogenních biotypů (patovarů) komenzálních druhů subjektů s vybranými patologiemi.

Část biologického materiálu bude použita pro studie na zvířatech o fyziopatologické úloze lidské střevní mikroflóry transplantované do myších modelů patologie a myších modelů bez zárodků (vypracován specifický protokol studie na zvířatech).

Rovněž budou provedeny in vitro studie na slizničních modelech za účelem vyhodnocení interakce mezi mikrobiotou a střevní sliznicí.

Studie nepředpokládá více než minimální riziko spojené s postupy odběru krve. Budou přijata veškerá nezbytná opatření k zamezení jakýchkoli rizik/nepříjemností vyplývajících z účasti studovaného subjektu.

Studie je v souladu se správnou klinickou praxí. Protokol studie a všechny související dokumenty byly schváleny nezávislými etickými komisemi (IEC) příslušných klinických pracovišť.

Pro zajištění ochrany a důvěrnosti dat účastníků budou veškeré studijní aktivity prováděny v souladu s evropským obecným nařízením o ochraně osobních údajů, nařízení (EU) 2016/679, které ruší směrnici 95/46/ES.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Aktuální)

225

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

      • Bari, Itálie
        • Azienda Ospedaliera Universitaria Policlinico di Bari - Sezione di Malattie dell'Apparato Digerente, Endoscopia e Trapianto di Fegato (D.E.T.O.)
      • Perugia, Itálie
        • Università degli Studi di Perugia - Dipartimento di Medicina
      • Roma, Itálie
        • Centro Malattie Apparato Digerente - CEMAD, Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS - Università Cattolica del Sacro Cuore

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let až 60 let (DOSPĚLÝ)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ano

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Subjekty s C. difficile (CDI), subjekty postižené infekcí multirezistentními organismy (MDRO), subjekty s chronickým zánětlivým střevním onemocněním (IBD), subjekty trpící syndromem dráždivého tračníku (IBS) a subjekty s jaterní encefalopatií navštěvující jednu z klinických centra zapojená do studie.

Zdraví dobrovolníci budou přijímáni na základě pozvání. Zapsané subjekty nesmí mít žádný rodinný vztah a hierarchickou podřízenost s nemocnicemi, ve kterých budou odebírány biologické vzorky.

Popis

Kritéria pro zařazení:

ZDRAVÍ DOBROVOLNÍCI

  • zdravých jedinců ve věku od 18 do 60 let
  • BMI mezi 18,5-30
  • všežravá strava
  • podpis informovaného souhlasu

PACIENTI S CDI

  • subjekty s CDI > 18 let
  • Symptomatická rekurentní infekce CDI, diagnostikovaná vyhledáváním toxinů (ELISA)
  • Subjekty způsobilé pro léčbu antibiotiky v souladu s evropskými směrnicemi
  • Možnost podrobit se diagnostickým a terapeutickým postupům studia
  • Negativní parazitologické vyšetření stolice na Giardia lamblia, Entamoeba histolytica / dispar, Cryptosporidium parvum a další parazity.
  • Negativita společné kultury na Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogenní Escherichia coli a další mikroorganismy s výjimkou Clostridium difficile
  • Negativita následujících sérologických testů: HAV-IgM, HBsAg, Anti-HCV, Anti-HIV1-2, VDRL
  • Podpis informovaného souhlasu

PACIENTI S MDRO

  • Subjekty starší 18 let
  • Subjekty kolonizované na MDRO s diagnózou rektálního výtěru
  • Negativní parazitologická kultivace trusu pro Giardia lamblia, Entamoeba histolytica / dispar, Cryptosporidium parvum a další parazity.
  • Negativní kultivace stolice na C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogeny Escherichia coli
  • Podpis informovaného souhlasu.

PACIENTI S IBD

  • Věk > 18 let.
  • Jednotlivci k dispozici pro plánované návštěvy, plán léčby, laboratorní testy, pokyny pro životní styl a další studijní postupy.
  • Subjekty s dokumentovanou diagnózou ulcerózní kolitidy nebo Crohnovy choroby alespoň 6 měsíců před screeningem.
  • Podpis informovaného souhlasu.

PACIENTI S IBS

  • Subjekty s diagnózou IBS podle kritérií Říma IV
  • Věk mezi 18 a 60 lety
  • BMI mezi 18,5-30
  • Všežravá dieta
  • Podpis informovaného souhlasu

PACIENTI S JATERNÍ ENCEFALOPATIÍ

  • Subjekty s jaterní encefalopatií
  • Věk mezi 18 a 60 lety
  • BMI mezi 18,5-30
  • Všežravá dieta
  • Podpis informovaného souhlasu

Kritéria vyloučení:

Zdraví dobrovolníci

  • Současná nebo předchozí infekční onemocnění (HAV, HBV, HCV, HIV, Cytomegalovirus, virus Epstein-Barrové)
  • Chronické onemocnění jater
  • Infekce Clostridium difficile v anamnéze
  • Nedávná (< 3 měsíce) terapie antibiotiky, imunosupresivy, chemoterapie
  • Chronická léčba inhibitory protonové pumpy
  • Nedávné (< 3 měsíce) užívání probiotik, laxativ nebo jiných pomůcek (léků / doplňků) pro regulaci gastrointestinální aktivity
  • Předchozí historie transplantace orgánů / tkání
  • Nedávný nástup průjmu
  • Chronický průjem
  • Chronická zácpa
  • Předchozí operace trávicího traktu (např. bypass žaludku)
  • Opakující se infekce močových cest (3 případy za rok)
  • Předchozí závažná akutní kardiovaskulární onemocnění (infarkt myokardu, mrtvice)
  • Diabetes mellitus 2. typu
  • Hypertenze
  • eGFR (odhadovaná rychlost glomerulární filtrace) nižší než 60 ml/min a/nebo diagnóza nefropatie
  • Chronické gastrointestinální poruchy
  • Systémová zánětlivá onemocnění
  • Podezření, klinická diagnóza nebo předchozí anamnéza rakoviny (< 5 let)
  • Autoimunitní poruchy nebo chronické a systémové autoimunitní poruchy v anamnéze
  • Neurodegenerativní poruchy
  • Těhotenství a kojení
  • Zdravotníci
  • Operátoři pracují se zvířaty
  • Psychiatrické stavy, které snižují dodržování protokolu.

Pacienti s CDI

  • Věk <18 let
  • Negativní průkaz toxinu Clostridium difficile ve stolici metodou ELISA
  • Závažný klinický stav (sepse, těžká dehydratace, důležitá přidružená onemocnění)
  • Předchozí i.c. celkovou nebo částečnou kolektomii
  • Vysoké riziko postkolonoskopických komplikací
  • Jiné příčiny příznaků podobných příznakům způsobeným CDI, jako jsou jiné infekce, zánětlivá onemocnění střev nebo syndrom dráždivého tračníku
  • Pozitivní parazitologické vyšetření stolice na Giardia lamblia, Entamoeba histolytica / dispar, Cryptosporidium parvum a další parazity
  • Koprokultivace pozitivní na Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogenní Escherichia coli a další mikroorganismy kromě Clostridium difficile
  • Pozitivita následujících sérologických testů: HAV-IgM, HBsAg, Anti-HCV, Anti-HIV1-2, VDRL
  • Těhotenství nebo kojení
  • Psychiatrické stavy, které snižují dodržování protokolu

Pacienti s MDRO

  • Předměty <18
  • Subjekty, které nejsou schopny provádět dolní endoskopii nebo ji netolerují
  • Subjekty negativní na rektální výtěr MDRO
  • Pozitivita na parazitologickou kultivaci trusu na Giardia lamblia, Entamoeba histolytica / dispar, Cryptosporidium parvum a další parazity.
  • Pozitivní kultura stolice na C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogeny Escherichia coli.
  • Subjekty léčené cyklosporinem, mykofenolátem nebo takrolimem
  • Ženy, které jsou těhotné nebo kojící
  • Psychiatrické stavy, které snižují dodržování protokolu

Pacienti s IBD

  • Subjekty <18 let.
  • Subjekty s diagnózou neurčené kolitidy
  • Pacienti s významnými komorbiditami (sepse, těžké trauma během posledních 4 týdnů, srdeční selhání NYHA IV. třídy)
  • Pacienti se symptomy kompatibilními s příznaky způsobenými IBD, jako je infekční kolitida, syndrom dráždivého tračníku, ischemická kolitida, aktinická kolitida.
  • Subjekty, které dostávají nebo očekávají, že budou dostávat cyklosporin, mykofenolát nebo takrolimus během 4 týdnů od první návštěvy ve studii.
  • Pozitivita na parazitologickou kultivaci trusu na Giardia lamblia, Entamoeba histolytica / dispar, Cryptosporidium parvum a další parazity.
  • Pozitivní kultura stolice na C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogeny Escherichia coli.
  • Pacienti s diagnózou primární sklerotizující cholangitidy.
  • Ženy, které jsou těhotné nebo kojící.
  • Psychiatrické stavy, které snižují dodržování protokolu

Pacienti s IBS

  • Současná nebo předchozí infekční onemocnění (HAV, HBV, HCV, HIV, Cytomegalovirus, virus Epstein-Barrové)
  • Chronické onemocnění jater
  • Infekce C. difficile v anamnéze
  • Nedávná (< 3 měsíce) terapie antibiotiky, imunosupresivy, chemoterapie
  • Chronická léčba inhibitory protonové pumpy
  • Předchozí historie transplantace orgánů / tkání
  • Předchozí operace trávicího traktu (např. bypass žaludku)
  • Opakované infekce močových cest (3 případy za rok)
  • Předchozí závažná akutní kardiovaskulární onemocnění (infarkt myokardu, mrtvice)
  • Diabetes mellitus 2. typu
  • eGFR nižší než 60 ml/min a/nebo diagnóza nefropatie
  • Systémová zánětlivá onemocnění
  • Podezření, klinická diagnóza nebo předchozí anamnéza rakoviny (< 5 let)
  • Autoimunitní poruchy nebo chronické a systémové autoimunitní poruchy v anamnéze
  • Neurodegenerativní poruchy
  • Těhotenství a kojení
  • Psychiatrické stavy, které snižují dodržování protokolu.

Pacienti s jaterní encefalopatií

  • Infekce C. difficile v anamnéze
  • Chronická léčba inhibitory protonové pumpy
  • Předchozí historie transplantace orgánů / tkání
  • Nedávný výskyt průjmu
  • Chronický průjem
  • Předchozí operace trávicího traktu (např. bypass žaludku)
  • Opakující se infekce močových cest (3 případy za rok)
  • Předchozí závažná akutní kardiovaskulární onemocnění (infarkt myokardu, mrtvice)
  • Diabetes mellitus 2. typu
  • eGFR nižší než 60 ml/min a/nebo diagnóza nefropatie
  • Systémová zánětlivá onemocnění
  • Podezření, klinická diagnóza nebo předchozí anamnéza rakoviny (< 5 let)
  • Autoimunitní poruchy nebo chronické a systémové autoimunitní poruchy v anamnéze
  • Těhotenství a kojení
  • Psychiatrické stavy, které snižují dodržování protokolu

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
zdravých dobrovolníků
Anamnestický dotazník, 3denní potravinový dotazník, Food Frequency Questionnaire
Měření krevního tlaku, fyzikální vyšetření břicha a hrudníku
Odběr stolice, koprokultivační vyšetření, moč, sliny, PBMC a krev pro biobanking, hodnocení proteomického, metascriptomického, metabolomického, metagenomického a metagenetického profilu a provádění rutinního screeningu. Analýza pro identifikaci, kvantifikaci a charakterizaci zdraví prospěšných bakterií
Pacientů s CDI
Pacienti s infekcí Clostridium Difficile
Anamnestický dotazník, 3denní potravinový dotazník, Food Frequency Questionnaire
Měření krevního tlaku, fyzikální vyšetření břicha a hrudníku
Odběr stolice, koprokultivační vyšetření, moč, sliny, PBMC a krev pro biobanking, hodnocení proteomického, metascriptomického, metabolomického, metagenomického a metagenetického profilu a provádění rutinního screeningu. Analýza pro identifikaci, kvantifikaci a charakterizaci zdraví prospěšných bakterií
MDRO pacientů
Pacienti s infekcí multirezistentními organismy
Anamnestický dotazník, 3denní potravinový dotazník, Food Frequency Questionnaire
Měření krevního tlaku, fyzikální vyšetření břicha a hrudníku
Odběr stolice, koprokultivační vyšetření, moč, sliny, PBMC a krev pro biobanking, hodnocení proteomického, metascriptomického, metabolomického, metagenomického a metagenetického profilu a provádění rutinního screeningu. Analýza pro identifikaci, kvantifikaci a charakterizaci zdraví prospěšných bakterií
Pacientů s IBD
Pacienti s chronickým zánětlivým onemocněním střev
Anamnestický dotazník, 3denní potravinový dotazník, Food Frequency Questionnaire
Měření krevního tlaku, fyzikální vyšetření břicha a hrudníku
Odběr stolice, koprokultivační vyšetření, moč, sliny, PBMC a krev pro biobanking, hodnocení proteomického, metascriptomického, metabolomického, metagenomického a metagenetického profilu a provádění rutinního screeningu. Analýza pro identifikaci, kvantifikaci a charakterizaci zdraví prospěšných bakterií
Pacienti s IBS
Pacienti se syndromem dráždivého tračníku
Anamnestický dotazník, 3denní potravinový dotazník, Food Frequency Questionnaire
Měření krevního tlaku, fyzikální vyšetření břicha a hrudníku
Odběr stolice, koprokultivační vyšetření, moč, sliny, PBMC a krev pro biobanking, hodnocení proteomického, metascriptomického, metabolomického, metagenomického a metagenetického profilu a provádění rutinního screeningu. Analýza pro identifikaci, kvantifikaci a charakterizaci zdraví prospěšných bakterií
Pacienti s jaterní encefalopatií
Anamnestický dotazník, 3denní potravinový dotazník, Food Frequency Questionnaire
Měření krevního tlaku, fyzikální vyšetření břicha a hrudníku
Odběr stolice, koprokultivační vyšetření, moč, sliny, PBMC a krev pro biobanking, hodnocení proteomického, metascriptomického, metabolomického, metagenomického a metagenetického profilu a provádění rutinního screeningu. Analýza pro identifikaci, kvantifikaci a charakterizaci zdraví prospěšných bakterií

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Odběr biologických vzorků pro zřízení první národní biobanky mikrobiomu
Časové okno: ukončením studia v průměru 1 rok
Nábor 225 subjektů (CDI, MDRO, IBD, IBS, pacienti s jaterní encefalopatií a zdraví dobrovolníci) k odběru biologických vzorků pro zřízení první Národní biobanky mikrobiomů
ukončením studia v průměru 1 rok

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (AKTUÁLNÍ)

8. února 2021

Primární dokončení (AKTUÁLNÍ)

10. května 2022

Dokončení studie (AKTUÁLNÍ)

10. května 2022

Termíny zápisu do studia

První předloženo

17. prosince 2020

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

5. ledna 2021

První zveřejněno (AKTUÁLNÍ)

6. ledna 2021

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (AKTUÁLNÍ)

4. srpna 2022

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

3. srpna 2022

Naposledy ověřeno

1. ledna 2022

Více informací

Termíny související s touto studií

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NE

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Předplatit