人类肠道和唾液微生物群生物库的建立 - 胃肠道疾病 (BIOMIS-Gastr)
Costituzione Della Biobanca Del Microbiota Intestinale e Salivare Umano: Dalla Disbiosi Alla Simbiosi
这是一项前瞻性、临床、多中心研究，旨在从艰难梭菌 (CDI) 受试者、受多重耐药菌 (MDRO) 感染的受试者、患有慢性炎症性肠病 (IBD) 的受试者、患有肠易激综合征 (IBS)，肝性脑病患者和健康志愿者。 微生物群是微生物的复杂联合体，位于粘膜水平（特别是肠道、口腔和阴道），在人类健康和多种疾病的发病中起着关键作用。 已在多种疾病（胃肠道、代谢、肾脏、肿瘤、妇科）中发现微生物群改变
该研究将允许：
- 将健康志愿者和患者的生物样本（粪便、唾液、血液、尿液）提供给意大利第一个微生物群生物库；
- 使用不同的体外和体内技术研究微生物；
- 研究微生物群与疾病之间的联系。 本研究是 BIOMIS 项目（项目代码：ARS01_01220）的一部分，作为“Avviso per la presentazione di progetti di ricerca industriale e sviluppo sperimentale nelle 12 aree di specializzazione individuate dal PNR 2015-2020”的一部分提出，并获得资助国家运营计划“Ricerca e Innovazione” 2014-2020 由 MIUR - 高等教育和研究部 - n。 2018 年 9 月 12 日第 2298 号法令。 BIOMIS 包括多项临床研究，这些研究招募患有不同病理的患者来收集和储存生物样本并研究微生物群。
研究概览
详细说明
这项多中心研究的主要目的是用生物样本（粪便、唾液、尿液和血液样本）、患有特定疾病（CDI、MDRO、IBD、IBS 和肝性脑病）的受试者和健康志愿者填充第一个国家微生物组生物库。
次要目标是使用元组学、体外和体内方法对生物库中的微生物进行表征和研究微生物群-病理学关系。
根据纳入/排除标准，该研究计划在 Policlinico of Bari、University of Perugia 和 Policlinico Agostino Gemelli Rome 招募 225 名受试者。 研究参与是自愿的，受试者有权随时以任何理由退出研究。
在研究期间，计划进行 3 次访问：
- 第 0 次访视（V0），包括研究目的和程序的描述、签署书面知情同意书、纳入/排除标准评估、体格检查（血压测量、腹部和胸部体格检查）、回忆问卷的填写、送达共培养套件、用于收集粪便、唾液和尿液材料的套件的交付将在访问 1 时报告，并交付 3 天的食物日记，在访问 1 之前的几天内自主完成。
- 访问 1 (V1) - V0 后至少 4 天，包括提供收集的生物材料（粪便、唾液、尿液）和 3 天的食物日记，填写新的体征和症状回忆问卷和医护人员抽血。 对于MDRO患者直肠拭子采集。
- 电话评估：实施“食物频率问卷”以评估受试者的饮食习惯。
样品储存、运输和处理将采用标准操作程序（SOP），以确保样品的稳定性和结果的有效性和质量。
收集后，样本将分装成不同的等份，用于：
- 常规筛查；
- 存储在第一个意大利人类微生物生物库（I.R.C.C.S. - Istituto Tumori“Giovanni Paolo II”，巴里）；
- 蛋白质组学、代谢组学、代谢组学、宏基因组学和元遗传学概况的评估；
- 健康受试者和受选定病理影响的受试者的 PBMC 转录组学概况的评估和血清蛋白质组学概况的评估此外，将对具有选定病理学的受试者的共生物种的致病微生物和致病生物型（pathovars）进行分子表征。
部分生物材料将用于动物研究，研究移植到小鼠病理模型和无菌小鼠模型（已制定特定动物研究方案）的人类肠道微生物群的生理病理学作用。
此外，还将对粘膜模型进行体外研究，以评估微生物群与肠粘膜之间的相互作用。
该研究预计与采血程序相关的风险不会超过最低限度。 将采取所有必要措施来避免因参与研究对象而导致的任何风险/不便。
该研究符合良好临床实践。 研究方案和所有相关文件均已获得相关临床机构的独立伦理委员会 (IEC) 的批准。
为确保参与者数据的保护和机密性，所有研究活动都将根据欧洲通用数据保护条例 (EU) 2016/679 进行，该条例废除了指令 95/46/EC。
研究类型
观察性的
注册 (实际的)
225
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
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Bari、意大利
- Azienda Ospedaliera Universitaria Policlinico di Bari - Sezione di Malattie dell'Apparato Digerente, Endoscopia e Trapianto di Fegato (D.E.T.O.)
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Perugia、意大利
- Università degli Studi di Perugia - Dipartimento di Medicina
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Roma、意大利
- Centro Malattie Apparato Digerente - CEMAD, Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS - Università Cattolica del Sacro Cuore
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
18年 至 60年 (成人)
接受健康志愿者
是的
有资格学习的性别
全部
取样方法
非概率样本
研究人群
患有艰难梭菌 (CDI) 的受试者、受多重耐药菌 (MDRO) 感染影响的受试者、患有慢性炎症性肠病 (IBD) 的受试者、患有肠易激综合征 (IBS) 的受试者和患有肝性脑病的受试者参加其中一项临床参与研究的中心。
应邀招募健康志愿者。 入选受试者不得与采集生物样本的医院有任何亲属关系和等级隶属关系。
描述
纳入标准：
健康的志愿者
- 年龄在 18 至 60 岁之间的健康受试者
- BMI在18.5-30之间
- 杂食性饮食
- 签署知情同意书
CDI 患者
- CDI > 18 岁的受试者
- 有症状的复发性 CDI 感染，通过毒素搜索 (ELISA) 诊断
- 根据欧洲指南有资格接受抗生素治疗的受试者
- 接受研究的诊断和治疗程序的可能性
- 对粪便进行蓝氏贾第鞭毛虫、溶组织内阿米巴 / dispar、隐孢子虫和其他寄生虫的阴性寄生虫学检查。
- 沙门氏菌属、志贺氏菌属、小肠结肠炎耶尔森菌、弯曲杆菌、无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、致病性大肠杆菌和除艰难梭菌外的其他微生物共培养呈阴性
- 以下血清学测试呈阴性：HAV-IgM、HBsAg、抗-HCV、抗-HIV1-2、VDRL
- 签署知情同意书
多药耐药患者
- 对象 > 18 岁
- 被直肠拭子诊断为 MDRO 定植的受试者
- 贾第鞭毛虫、溶组织内阿米巴 / dispar、隐孢子虫和其他寄生虫的寄生虫粪便培养呈阴性。
- 艰难梭菌、沙门氏菌属、志贺氏菌属、小肠结肠炎耶尔森菌、弯曲杆菌、无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、肠病原体大肠杆菌的阴性粪便培养
- 签署知情同意书。
IBD 患者
- 年龄 > 18 岁。
- 可用于预定访问、治疗计划、实验室测试、生活方式指南和其他研究程序的个人。
- 筛选前至少 6 个月有溃疡性结肠炎或克罗恩氏病记录诊断的受试者。
- 签署知情同意书。
IBS 患者
- 根据罗马 IV 标准诊断为 IBS 的受试者
- 年龄在 18 至 60 岁之间
- BMI在18.5-30之间
- 杂食性饮食
- 签署知情同意书
肝性脑病患者
- 患有肝性脑病的受试者
- 年龄在 18 至 60 岁之间
- BMI在18.5-30之间
- 杂食性饮食
- 签署知情同意书
排除标准：
健康志愿者
- 当前或以前感染的疾病（HAV、HBV、HCV、HIV、巨细胞病毒、Epstein-Barr 病毒）
- 慢性肝病
- 艰难梭菌感染史
- 最近（<3 个月）使用抗生素、免疫抑制药物、化疗
- 质子泵抑制剂的慢性治疗
- 最近（<3 个月）使用益生菌、泻药或其他辅助药物（药物/补充剂）来调节胃肠活动
- 既往器官/组织移植史
- 最近出现腹泻
- 慢性腹泻
- 慢性便秘
- 以前的胃肠道手术（例如胃旁路术）
- 复发性尿路感染（每年 3 例）
- 既往主要急性心血管疾病（心肌梗塞、中风）
- 2型糖尿病
- 高血压
- eGFR（估计肾小球滤过率）低于 60ml/分钟和/或肾病诊断
- 慢性胃肠道疾病
- 全身炎症性疾病
- 怀疑、临床诊断或既往癌症病史（<5 年）
- 自身免疫性疾病或慢性和全身性自身免疫性疾病史
- 神经退行性疾病
- 怀孕和哺乳
- 医护人员
- 操作员与动物一起工作
- 降低协议依从性的精神疾病。
CDI患者
- 年龄 <18 岁
- ELISA法检测粪便中艰难梭菌毒素阴性
- 严重的临床状况（败血症、严重脱水、重要的合并症）
- 以前的我 全部或部分结肠切除术
- 结肠镜检查后并发症的高风险
- 与 CDI 引起的症状相似的其他原因，例如其他感染、炎症性肠病或肠易激综合征
- 对粪便进行蓝氏贾第鞭毛虫、溶组织内阿米巴 / dispar、隐孢子虫和其他寄生虫的阳性寄生虫检查
- 沙门氏菌属、志贺氏菌属、小肠结肠炎耶尔森氏菌、弯曲杆菌、无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、致肠病性大肠杆菌和除艰难梭菌外的其他微生物的共培养阳性
- 以下血清学检测呈阳性：HAV-IgM、HBsAg、抗-HCV、抗-HIV1-2、VDRL
- 怀孕或哺乳
- 降低协议依从性的精神疾病
多药耐药患者
- 受试者 <18
- 不能进行或不能耐受下消化道内窥镜检查的受试者
- 直肠拭子 MDRO 阴性的受试者
- 贾第鞭毛虫、溶组织内阿米巴 / dispar、隐孢子虫和其他寄生虫的寄生虫粪便培养呈阳性。
- 艰难梭菌、沙门氏菌属、志贺氏菌属、小肠结肠炎耶尔森菌、弯曲杆菌、无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、肠病原体大肠杆菌的阳性粪便培养。
- 接受环孢菌素、霉酚酸酯或他克莫司治疗的受试者
- 怀孕或哺乳的妇女
- 降低协议依从性的精神疾病
炎症性肠病患者
- 受试者 <18 岁。
- 被诊断患有未确定结肠炎的受试者
- 有严重合并症的患者（败血症、过去 4 周内的严重创伤、NYHA IV 级心力衰竭）
- 患有与IBD引起的症状相符的患者，例如感染性结肠炎、肠易激综合征、缺血性结肠炎、光化性结肠炎。
- 在第一天研究访视后的 4 周内接受或预期接受环孢菌素、霉酚酸酯或他克莫司的受试者。
- 贾第鞭毛虫、溶组织内阿米巴 / dispar、隐孢子虫和其他寄生虫的寄生虫粪便培养呈阳性。
- 艰难梭菌、沙门氏菌属、志贺氏菌属、小肠结肠炎耶尔森菌、弯曲杆菌、无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、肠病原体大肠杆菌的阳性粪便培养。
- 诊断为原发性硬化性胆管炎的患者。
- 怀孕或哺乳的妇女。
- 降低协议依从性的精神疾病
肠易激综合征患者
- 当前或以前感染的疾病（HAV、HBV、HCV、HIV、巨细胞病毒、Epstein-Barr 病毒）
- 慢性肝病
- 艰难梭菌感染史
- 最近（<3 个月）使用抗生素、免疫抑制药物、化疗
- 质子泵抑制剂的慢性治疗
- 既往器官/组织移植史
- 以前的胃肠道手术（例如胃旁路术）
- 复发性尿路感染（每年 3 例）
- 既往主要急性心血管疾病（心肌梗塞、中风）
- 2型糖尿病
- eGFR 低于 60ml/分钟和/或肾病诊断
- 全身炎症性疾病
- 怀疑、临床诊断或既往癌症病史（<5 年）
- 自身免疫性疾病或慢性和全身性自身免疫性疾病史
- 神经退行性疾病
- 怀孕和哺乳
- 降低协议依从性的精神疾病。
肝性脑病患者
- 艰难梭菌感染史
- 质子泵抑制剂的慢性治疗
- 既往器官/组织移植史
- 最近出现腹泻
- 慢性腹泻
- 以前的胃肠道手术（例如胃旁路术）
- 复发性尿路感染（每年 3 例）
- 既往主要急性心血管疾病（心肌梗塞、中风）
- 2型糖尿病
- eGFR 低于 60ml/分钟和/或肾病诊断
- 全身炎症性疾病
- 怀疑、临床诊断或既往癌症病史（<5 年）
- 自身免疫性疾病或慢性和全身性自身免疫性疾病史
- 怀孕和哺乳
- 降低协议依从性的精神疾病
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
|---|---|
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健康志愿者
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记忆问卷、3天食物问卷、食物频率问卷
血压测量、腹部和胸部体格检查
收集粪便、共培养检查、尿液、唾液、PBMC 和血液用于生物样本库，以评估蛋白质组学、代谢组学、代谢组学、宏基因组学和宏遗传学概况，并进行常规筛查。
促进健康细菌的鉴定、定量和表征分析
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CDI患者
艰难梭菌感染患者
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记忆问卷、3天食物问卷、食物频率问卷
血压测量、腹部和胸部体格检查
收集粪便、共培养检查、尿液、唾液、PBMC 和血液用于生物样本库，以评估蛋白质组学、代谢组学、代谢组学、宏基因组学和宏遗传学概况，并进行常规筛查。
促进健康细菌的鉴定、定量和表征分析
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多重耐药患者
多重耐药菌感染患者
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记忆问卷、3天食物问卷、食物频率问卷
血压测量、腹部和胸部体格检查
收集粪便、共培养检查、尿液、唾液、PBMC 和血液用于生物样本库，以评估蛋白质组学、代谢组学、代谢组学、宏基因组学和宏遗传学概况，并进行常规筛查。
促进健康细菌的鉴定、定量和表征分析
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炎症性肠病患者
慢性炎症性肠病患者
|
记忆问卷、3天食物问卷、食物频率问卷
血压测量、腹部和胸部体格检查
收集粪便、共培养检查、尿液、唾液、PBMC 和血液用于生物样本库，以评估蛋白质组学、代谢组学、代谢组学、宏基因组学和宏遗传学概况，并进行常规筛查。
促进健康细菌的鉴定、定量和表征分析
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肠易激综合征患者
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记忆问卷、3天食物问卷、食物频率问卷
血压测量、腹部和胸部体格检查
收集粪便、共培养检查、尿液、唾液、PBMC 和血液用于生物样本库，以评估蛋白质组学、代谢组学、代谢组学、宏基因组学和宏遗传学概况，并进行常规筛查。
促进健康细菌的鉴定、定量和表征分析
|
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肝性脑病患者
|
记忆问卷、3天食物问卷、食物频率问卷
血压测量、腹部和胸部体格检查
收集粪便、共培养检查、尿液、唾液、PBMC 和血液用于生物样本库，以评估蛋白质组学、代谢组学、代谢组学、宏基因组学和宏遗传学概况，并进行常规筛查。
促进健康细菌的鉴定、定量和表征分析
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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为建立第一个国家微生物组生物样本库收集生物样本
大体时间：通过学习完成，平均1年
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招募225名受试者（CDI、MDRO、IBD、IBS、肝性脑病患者和健康志愿者）采集生物样本，建立首个国家微生物组生物库
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通过学习完成，平均1年
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
合作者
调查人员
- 首席研究员：Giuseppe Losurdo, MD、Azienda Ospedaliera Universitaria Consorziale Policlinico di Bari
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Aira A, Feher C, Rubio E, Soriano A. The Intestinal Microbiota as a Reservoir and a Therapeutic Target to Fight Multi-Drug-Resistant Bacteria: A Narrative Review of the Literature. Infect Dis Ther. 2019 Dec;8(4):469-482. doi: 10.1007/s40121-019-00272-7. Epub 2019 Oct 25.
- Rivera-Flores R, Moran-Villota S, Cervantes-Barragan L, Lopez-Macias C, Uribe M. Manipulation of microbiota with probiotics as an alternative for treatment of hepatic encephalopathy. Nutrition. 2020 May;73:110693. doi: 10.1016/j.nut.2019.110693. Epub 2019 Dec 6.
- Yoon YK, Suh JW, Kang EJ, Kim JY. Efficacy and safety of fecal microbiota transplantation for decolonization of intestinal multidrug-resistant microorganism carriage: beyond Clostridioides difficile infection. Ann Med. 2019 Nov-Dec;51(7-8):379-389. doi: 10.1080/07853890.2019.1662477. Epub 2019 Sep 13.
- Ni J, Wu GD, Albenberg L, Tomov VT. Gut microbiota and IBD: causation or correlation? Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2017 Oct;14(10):573-584. doi: 10.1038/nrgastro.2017.88. Epub 2017 Jul 19.
- Rajilic-Stojanovic M, Jonkers DM, Salonen A, Hanevik K, Raes J, Jalanka J, de Vos WM, Manichanh C, Golic N, Enck P, Philippou E, Iraqi FA, Clarke G, Spiller RC, Penders J. Intestinal microbiota and diet in IBS: causes, consequences, or epiphenomena? Am J Gastroenterol. 2015 Feb;110(2):278-87. doi: 10.1038/ajg.2014.427. Epub 2015 Jan 27.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2021年2月8日
初级完成 (实际的)
2022年5月10日
研究完成 (实际的)
2022年5月10日
研究注册日期
首次提交
2020年12月17日
首先提交符合 QC 标准的
2021年1月5日
首次发布 (实际的)
2021年1月6日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2022年8月4日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2022年8月3日
最后验证
2022年1月1日
更多信息
与本研究相关的术语
关键字
其他相关的 MeSH 术语
其他研究编号
- BIOMIS-Gastr
计划个人参与者数据 (IPD)
计划共享个人参与者数据 (IPD)？
不
药物和器械信息、研究文件
研究美国 FDA 监管的药品
不
研究美国 FDA 监管的设备产品
不
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调查问卷的临床试验
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