Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Создание биобанка кишечной и слюнной микробиоты человека - Желудочно-кишечные заболевания (BIOMIS-Gastr)

3 августа 2022 г. обновлено: Azienda Ospedaliero-Universitaria Consorziale Policlinico di Bari

Costituzione Della Biobanca Del Microbiota Intestinale e Salivare Umano: Dalla Disbiosi Alla Simbiosi

Это проспективное клиническое многоцентровое исследование, направленное на сбор биологических образцов и изучение микробиоты у субъектов с Clostridium Difficile (CDI), субъектов, пораженных инфекцией с множественной лекарственной устойчивостью (MDRO), субъектов с хроническим воспалительным заболеванием кишечника (IBD), субъектов с Синдром раздраженного кишечника (СРК), у субъектов с печеночной энцефалопатией и у здоровых добровольцев. Микробиота представляет собой сложный консорциум микроорганизмов, расположенных на уровне слизистых оболочек (в частности, кишечника, полости рта и влагалища), играющих ключевую роль в здоровье человека и в возникновении ряда заболеваний. Изменения микробиоты обнаружены при ряде заболеваний (желудочно-кишечных, метаболических, почечных, онкологических, гинекологических)

Исследование позволит:

  • Предоставить биологические образцы (фекалии, слюна, кровь, моча) здоровых добровольцев и пациентов в первый итальянский биобанк микробиоты;
  • Изучать микроорганизмы с использованием различных методов in vitro и in vivo;
  • Изучите связь между микробиотой и заболеванием. Это исследование является частью проекта BIOMIS (код проекта: ARS01_01220), представленного в рамках «Avviso per la Presentazione di progetti di ricerca Industriale e sviluppo sperimental nelle 12 aree di specializzazione individuate dal PNR 2015-2020» и допущенного к финансированию в соответствии с Национальная операционная программа «Ricerca e Innovazione» на 2014-2020 гг. по указу директора MIUR - Департамента высшего образования и исследований - n. № 2298 от 12.09.2018. БИОМИС включает в себя несколько клинических исследований, в которых принимают участие пациенты с различной патологией для сбора и хранения биологических образцов и изучения микробиоты.

Обзор исследования

Подробное описание

Основной целью этого многоцентрового исследования является заполнение первого национального биобанка микробиомы биологическими образцами (фекалиями, слюной, мочой и кровью) субъектов, страдающих определенным заболеванием (ИКД, МДРО, ВЗК, СРК и печеночная энцефалопатия), и здоровых добровольцев.

Второстепенной целью является характеристика микроорганизмов биобанка и изучение взаимосвязи между микробиотой и патологией с использованием подходов метаомики, in vitro и in vivo.

В исследовании планируется зачислить 225 человек в Поликлинику Бари, Университет Перуджи и Поликлинику Агостино Джемелли в Риме в соответствии с критериями включения/исключения. Участие в исследовании является добровольным, и субъекты имеют право выйти из исследования в любое время и по любой причине.

В ходе исследования планируется 3 визита:

  • Визит 0 (V0), включая описание целей и процедур исследования, подписание письменного информированного согласия, оценку критериев включения/исключения, медицинское обследование (измерение артериального давления, абдоминальное и грудное физикальное обследование), заполнение анамнестической анкеты, сдачу набор для копрокультуры, доставка наборов для сбора фекального, слюнного и мочевого материала, о котором следует сообщить при посещении 1, и доставка 3-дневного дневника питания, который должен быть завершен автономно в дни, предшествующие посещению 1.
  • Визит 1 (V1) - не позднее 4 дней после V0, включающий сдачу собранного биологического материала (кал, слюна, моча), 3-дневного пищевого дневника, заполнение анамнестической анкеты новых признаков и симптомов и забор крови медицинским персоналом. Сбор ректальных мазков у пациентов с МДРО.
  • Оценка по телефону: введение «Опросника частоты приема пищи» для оценки пищевых привычек испытуемых.

Будут приняты стандартные операционные процедуры (СОП) для хранения, транспортировки и обработки образцов, чтобы обеспечить стабильность образцов и обеспечить достоверность и качество результатов.

После сбора пробы будут обрабатываться в виде разных аликвот, которые будут использоваться для:

  • рутинный скрининг;
  • хранение в первом итальянском биобанке человеческих микробиотов (IRCCS - Istituto Tumori "Giovanni Paolo II", Бари);
  • оценка протеомного, метаскриптомного, метаболомного, метагеномного и метагенетического профиля;
  • Оценка транскриптомного профиля РВМС здоровых субъектов и субъектов, пораженных выбранными патологиями, и оценка протеомного профиля сыворотки. Кроме того, будет проведена молекулярная характеристика патогенных микроорганизмов и патогенных биотипов (патоваров) комменсальных видов субъектов с выбранными патологиями.

Часть биологического материала будет использована для исследований на животных физиопатологической роли кишечной микробиоты человека, трансплантированной в мышиные модели патологии и безмикробные мышиные модели (разработан специальный протокол исследования на животных).

Кроме того, будут проведены исследования in vitro на моделях слизистой оболочки для оценки взаимодействия между микробиотой и слизистой оболочкой кишечника.

Исследование предусматривает не более чем минимальный риск, связанный с процедурами забора крови. Будут предприняты все необходимые меры для избежания каких-либо рисков/неудобств, связанных с участием исследуемого субъекта.

Исследование соответствует требованиям надлежащей клинической практики. Протокол исследования и все сопутствующие документы были одобрены независимыми комитетами по этике (НЭК) участвующих клинических центров.

Чтобы обеспечить защиту и конфиденциальность данных участников, вся исследовательская деятельность будет осуществляться в соответствии с Европейским общим регламентом защиты данных, Регламентом (ЕС) 2016/679, который отменяет Директиву 95/46/ЕС.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Действительный)

225

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

      • Bari, Италия
        • Azienda Ospedaliera Universitaria Policlinico di Bari - Sezione di Malattie dell'Apparato Digerente, Endoscopia e Trapianto di Fegato (D.E.T.O.)
      • Perugia, Италия
        • Università degli Studi di Perugia - Dipartimento di Medicina
      • Roma, Италия
        • Centro Malattie Apparato Digerente - CEMAD, Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS - Università Cattolica del Sacro Cuore

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

От 18 лет до 60 лет (ВЗРОСЛЫЙ)

Принимает здоровых добровольцев

Да

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Субъекты с C. Difficile (CDI), субъекты, пораженные инфекцией с множественной лекарственной устойчивостью (MDRO), субъекты с хроническим воспалительным заболеванием кишечника (IBD), субъекты, страдающие синдромом раздраженного кишечника (IBS), и субъекты с печеночной энцефалопатией, посещающие один из клинических центры, участвующие в исследовании.

Здоровые добровольцы будут набраны по приглашению. Зарегистрированные субъекты не должны иметь никаких родственных связей и иерархической подчиненности с больницами, в которых будут собираться биологические образцы.

Описание

Критерии включения:

ЗДОРОВЫЕ ДОБРОВОЛЬЦЫ

  • здоровые люди в возрасте от 18 до 60 лет
  • ИМТ между 18,5-30
  • всеядная диета
  • подписание информированного согласия

ПАЦИЕНТЫ С ИКД

  • субъекты с ИКД > 18 лет
  • Симптоматическая рецидивирующая инфекция ИКД, диагностированная с помощью поиска токсинов (ELISA)
  • Субъекты, имеющие право на лечение антибиотиками в соответствии с европейскими рекомендациями
  • Возможность прохождения диагностических и лечебных процедур исследования
  • Отрицательное паразитологическое исследование стула на наличие Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum и других паразитов.
  • Отрицательность кокультуры на Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, энтеропатогенные Escherichia coli и другие микроорганизмы, за исключением Clostridium difficile
  • Отрицательные результаты следующих серологических тестов: HAV-IgM, HBsAg, Anti-HCV, Anti-HIV1-2, VDRL
  • Подпись информированного согласия

ПАЦИЕНТЫ С МДР

  • Субъекты > 18 лет
  • Субъекты, колонизированные для MDRO с диагнозом ректального мазка
  • Отрицательный паразитологический посев фекалий на Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum и других паразитов.
  • Отрицательный посев фекалий на C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, энтеропатогены Escherichia coli
  • Подпись информированного согласия.

ПАЦИЕНТЫ С ВЗК

  • Возраст > 18 лет.
  • Лица, доступные для запланированных посещений, плана лечения, лабораторных анализов, рекомендаций по образу жизни и других процедур исследования.
  • Субъекты с документально подтвержденным диагнозом язвенного колита или болезни Крона по крайней мере за 6 месяцев до скрининга.
  • Подпись информированного согласия.

ПАЦИЕНТЫ С СРК

  • Субъекты с диагнозом СРК в соответствии с Римскими критериями IV
  • Возраст от 18 до 60 лет
  • ИМТ между 18,5-30
  • Всеядная диета
  • Подпись информированного согласия

ПАЦИЕНТЫ С ПЕЧЕНОЧНОЙ ЭНЦЕФАЛОПАТИИ

  • Субъекты с печеночной энцефалопатией
  • Возраст от 18 до 60 лет
  • ИМТ между 18,5-30
  • Всеядная диета
  • Подпись информированного согласия

Критерий исключения:

Здоровые добровольцы

  • Текущие или перенесенные инфекционные заболевания (ВГА, ВГВ, ВГС, ВИЧ, цитомегаловирус, вирус Эпштейна-Барр)
  • Хроническое заболевание печени
  • Инфекции Clostridium difficile в анамнезе
  • Недавняя (<3 месяцев) терапия антибиотиками, иммунодепрессантами, химиотерапией
  • Хроническая терапия ингибиторами протонной помпы
  • Недавнее (<3 месяцев) использование пробиотиков, слабительных или других вспомогательных средств (лекарств/добавок) для регуляции желудочно-кишечной активности
  • Предыдущая история трансплантации органов / тканей
  • Недавнее начало диареи
  • Хроническая диарея
  • Хронический запор
  • Предыдущие операции на желудочно-кишечном тракте (например, желудочное шунтирование)
  • Рецидивирующие инфекции мочевыводящих путей (3 случая в год)
  • Перенесенные серьезные острые сердечно-сосудистые заболевания (инфаркт миокарда, инсульт)
  • Сахарный диабет 2 типа
  • Гипертония
  • рСКФ (расчетная скорость клубочковой фильтрации) ниже 60 мл/мин и/или диагноз нефропатии
  • Хронические желудочно-кишечные расстройства
  • Системные воспалительные заболевания
  • Подозрение, клинический диагноз или рак в анамнезе (<5 лет)
  • Аутоиммунные заболевания или наличие в анамнезе хронических и системных аутоиммунных заболеваний
  • Нейродегенеративные расстройства
  • Беременность и кормление грудью
  • Работники здравоохранения
  • Операторы работают с животными
  • Психиатрические состояния, снижающие соблюдение протокола.

Пациенты с ИКД

  • Возраст <18 лет
  • Отрицательное обнаружение токсина Clostridium difficile в фекалиях методом ИФА
  • Тяжелое клиническое состояние (сепсис, тяжелое обезвоживание, серьезные сопутствующие заболевания)
  • Предыдущий i.c. тотальная или частичная колэктомия
  • Высокий риск осложнений после колоноскопии
  • Другие причины симптомов, сходных с симптомами, вызываемыми ИКД, например, другие инфекции, воспалительные заболевания кишечника или синдром раздраженного кишечника.
  • Положительное паразитологическое исследование кала на Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum и другие паразиты.
  • Положительная копрокультура на Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, энтеропатогенную Escherichia coli и другие микроорганизмы, кроме Clostridium difficile
  • Положительные результаты следующих серологических тестов: HAV-IgM, HBsAg, Anti-HCV, Anti-HIV1-2, VDRL
  • Беременность или кормление грудью
  • Психиатрические состояния, снижающие соблюдение протокола

Пациенты с МДРО

  • Субъекты <18
  • Субъекты, неспособные выполнять или не переносящие нижнюю эндоскопию
  • Субъекты с отрицательным результатом ректального мазка MDRO
  • Положительный результат посева фекалий на Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum и других паразитов.
  • Положительный посев кала на C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, энтеропатогены Escherichia coli.
  • Субъекты, получающие лечение циклоспорином, микофенолатом или такролимусом
  • Женщины, которые беременны или кормят грудью
  • Психиатрические состояния, снижающие соблюдение протокола

Пациенты с ВЗК

  • Субъекты <18 лет.
  • Субъекты с диагнозом неопределенный колит
  • Пациенты с тяжелыми сопутствующими заболеваниями (сепсис, тяжелая травма в течение последних 4 недель, сердечная недостаточность IV класса по NYHA)
  • Пациенты с симптомами, совместимыми с симптомами, вызванными ВЗК, такими как инфекционный колит, синдром раздраженного кишечника, ишемический колит, актинический колит.
  • Субъекты, получающие или ожидаемые приемы циклоспорина, микофенолата или такролимуса в течение 4 недель после первого дня исследования.
  • Положительный результат посева фекалий на Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum и других паразитов.
  • Положительный посев кала на C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, энтеропатогены Escherichia coli.
  • Пациенты с диагнозом первичный склерозирующий холангит.
  • Женщины, которые беременны или кормят грудью.
  • Психиатрические состояния, снижающие соблюдение протокола

Пациенты с СРК

  • Текущие или перенесенные инфекционные заболевания (ВГА, ВГВ, ВГС, ВИЧ, цитомегаловирус, вирус Эпштейна-Барр)
  • Хроническое заболевание печени
  • История инфекций C. difficile
  • Недавняя (<3 месяцев) терапия антибиотиками, иммунодепрессантами, химиотерапией
  • Хроническая терапия ингибиторами протонной помпы
  • Предыдущая история трансплантации органов / тканей
  • Предыдущие операции на желудочно-кишечном тракте (например, желудочное шунтирование)
  • Рецидивирующие инфекции мочевыводящих путей (3 случая в год)
  • Перенесенные серьезные острые сердечно-сосудистые заболевания (инфаркт миокарда, инсульт)
  • Сахарный диабет 2 типа
  • рСКФ ниже 60 мл/мин и/или диагноз нефропатии
  • Системные воспалительные заболевания
  • Подозрение, клинический диагноз или рак в анамнезе (<5 лет)
  • Аутоиммунные заболевания или наличие в анамнезе хронических и системных аутоиммунных заболеваний
  • Нейродегенеративные расстройства
  • Беременность и кормление грудью
  • Психиатрические состояния, снижающие соблюдение протокола.

Больные печеночной энцефалопатией

  • История инфекций C. difficile
  • Хроническая терапия ингибиторами протонной помпы
  • Предыдущая история трансплантации органов / тканей
  • Недавнее появление диареи
  • Хроническая диарея
  • Предыдущие операции на желудочно-кишечном тракте (например, желудочное шунтирование)
  • Рецидивирующие инфекции мочевыводящих путей (3 случая в год)
  • Перенесенные серьезные острые сердечно-сосудистые заболевания (инфаркт миокарда, инсульт)
  • Сахарный диабет 2 типа
  • рСКФ ниже 60 мл/мин и/или диагноз нефропатии
  • Системные воспалительные заболевания
  • Подозрение, клинический диагноз или рак в анамнезе (<5 лет)
  • Аутоиммунные заболевания или наличие в анамнезе хронических и системных аутоиммунных заболеваний
  • Беременность и кормление грудью
  • Психиатрические состояния, снижающие соблюдение протокола

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
здоровые добровольцы
Анамнестический опросник, трехдневный пищевой опросник, опросник частоты приема пищи
Измерение артериального давления, абдоминальное и грудное физическое обследование
Сбор фекалий, исследование копрокультуры, мочи, слюны, РВМС и крови для биобанкирования, для оценки протеомного, метаскриптомного, метаболомного, метагеномного и метагенетического профиля, а также для проведения рутинного скрининга. Анализ для идентификации, количественного определения и характеристики полезных для здоровья бактерий
Пациенты с ИКД
Пациенты с инфекцией Clostridium difficile
Анамнестический опросник, трехдневный пищевой опросник, опросник частоты приема пищи
Измерение артериального давления, абдоминальное и грудное физическое обследование
Сбор фекалий, исследование копрокультуры, мочи, слюны, РВМС и крови для биобанкирования, для оценки протеомного, метаскриптомного, метаболомного, метагеномного и метагенетического профиля, а также для проведения рутинного скрининга. Анализ для идентификации, количественного определения и характеристики полезных для здоровья бактерий
Пациенты с МРО
Пациенты с инфекцией, вызванной мультирезистентными микроорганизмами
Анамнестический опросник, трехдневный пищевой опросник, опросник частоты приема пищи
Измерение артериального давления, абдоминальное и грудное физическое обследование
Сбор фекалий, исследование копрокультуры, мочи, слюны, РВМС и крови для биобанкирования, для оценки протеомного, метаскриптомного, метаболомного, метагеномного и метагенетического профиля, а также для проведения рутинного скрининга. Анализ для идентификации, количественного определения и характеристики полезных для здоровья бактерий
Пациенты с ВЗК
Пациенты с хроническим воспалительным заболеванием кишечника
Анамнестический опросник, трехдневный пищевой опросник, опросник частоты приема пищи
Измерение артериального давления, абдоминальное и грудное физическое обследование
Сбор фекалий, исследование копрокультуры, мочи, слюны, РВМС и крови для биобанкирования, для оценки протеомного, метаскриптомного, метаболомного, метагеномного и метагенетического профиля, а также для проведения рутинного скрининга. Анализ для идентификации, количественного определения и характеристики полезных для здоровья бактерий
Пациенты с СРК
Пациенты с синдромом раздраженного кишечника
Анамнестический опросник, трехдневный пищевой опросник, опросник частоты приема пищи
Измерение артериального давления, абдоминальное и грудное физическое обследование
Сбор фекалий, исследование копрокультуры, мочи, слюны, РВМС и крови для биобанкирования, для оценки протеомного, метаскриптомного, метаболомного, метагеномного и метагенетического профиля, а также для проведения рутинного скрининга. Анализ для идентификации, количественного определения и характеристики полезных для здоровья бактерий
Больные печеночной энцефалопатией
Пациенты с печеночной энцефалопатией
Анамнестический опросник, трехдневный пищевой опросник, опросник частоты приема пищи
Измерение артериального давления, абдоминальное и грудное физическое обследование
Сбор фекалий, исследование копрокультуры, мочи, слюны, РВМС и крови для биобанкирования, для оценки протеомного, метаскриптомного, метаболомного, метагеномного и метагенетического профиля, а также для проведения рутинного скрининга. Анализ для идентификации, количественного определения и характеристики полезных для здоровья бактерий

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Сбор биологических образцов для создания первого Национального биобанка микробиомов
Временное ограничение: через завершение обучения, в среднем 1 год
Набор 225 субъектов (CDI, MDRO, IBD, IBS, пациентов с печеночной энцефалопатией и здоровых добровольцев) для сбора биологических образцов для создания первого Национального микробиомного биобанка.
через завершение обучения, в среднем 1 год

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Публикации и полезные ссылки

Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

8 февраля 2021 г.

Первичное завершение (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

10 мая 2022 г.

Завершение исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

10 мая 2022 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

17 декабря 2020 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

5 января 2021 г.

Первый опубликованный (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

6 января 2021 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

4 августа 2022 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

3 августа 2022 г.

Последняя проверка

1 января 2022 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Другие идентификационные номера исследования

  • BIOMIS-Gastr

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

НЕТ

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Клинические исследования Анкета

Подписаться