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Istituzione della Biobanca del Microbiota Intestinale e Salivare Umano - Malattie Gastrointestinali (BIOMIS-Gastr)

Costituzione Della Biobanca Del Microbiota Intestinale e Salivare Umano: Dalla Disbiosi Alla Simbiosi

Si tratta di uno studio prospettico, clinico, multicentrico finalizzato alla raccolta di campioni biologici e allo studio del microbiota da soggetti con Clostridium Difficile (CDI), soggetti affetti da infezione da Multi Drug Resistant Organisms (MDRO), soggetti con Malattia Infiammatoria Cronica Intestinale (IBD), soggetti con Sindrome dell'intestino irritabile (IBS), soggetti con encefalopatia epatica e da volontari sani. Il microbiota è un complesso consorzio di microrganismi, localizzati a livello delle mucose (in particolare intestinale, orale e vaginale) che hanno un ruolo chiave nella salute umana e nell'insorgenza di numerose malattie. Alterazioni del microbiota sono state riscontrate in diverse patologie (intestinali, metaboliche, renali, oncologiche, ginecologiche)

Lo studio consentirà di:

  • Fornire campioni biologici (feci, saliva, sangue, urine) di volontari sani e pazienti alla prima biobanca italiana di microbiota;
  • Studiare i microrganismi utilizzando diverse tecniche in vitro e in vivo;
  • Studia il legame tra il microbiota e la malattia. Questo studio fa parte del progetto BIOMIS (Project Code: ARS01_01220), presentato nell'ambito dell'Avviso per la presentazione di progetti di ricerca industriale e sviluppo sperimentale nelle 12 aree di specializzazione individuate dal PNR 2015-2020 e ammesso a finanziamento ai sensi il Programma Operativo Nazionale "Ricerca e Innovazione" 2014-2020 con decreto direttoriale del MIUR - Dipartimento per l'Istruzione Superiore e la Ricerca - n. 2298 del 12 settembre 2018. BIOMIS comprende diversi studi clinici che arruolano pazienti con diverse patologie per raccogliere e conservare campioni biologici e studiare il microbiota.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

L'obiettivo primario di questo studio multicentrico è quello di popolare la prima biobanca nazionale di microbiomi con campioni biologici (fecali, salivari, urinari e campioni di sangue) soggetti affetti da malattie selezionate (CDI, MDRO, IBD, IBS ed encefalopatia epatica) e volontari sani.

L'obiettivo secondario è la caratterizzazione dei microrganismi della biobanca e lo studio della relazione microbiota-patologia utilizzando approcci meta-omici, in vitro e in vivo.

Lo studio prevede di arruolare 225 soggetti presso il Policlinico di Bari, l'Università di Perugia e il Policlinico Agostino Gemelli di Roma, secondo i criteri di inclusione/esclusione. La partecipazione allo studio è volontaria e i soggetti hanno il diritto di ritirarsi dallo studio in qualsiasi momento e per qualsiasi motivo.

Durante lo studio sono previste 3 visite:

  • Visita 0 (V0), comprensiva di descrizione degli obiettivi e delle modalità dello studio, firma del consenso informato scritto, valutazione dei criteri di inclusione/esclusione, visita medica (misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico), compilazione del questionario anamnestico, consegna del kit di coprocoltura, consegna dei kit per la raccolta del materiale fecale, salivare e urinario da refertare alla Visita 1 e consegna di un diario alimentare di 3 giorni, da compilare in autonomia nei giorni precedenti la Visita 1.
  • Visita 1 (V1) - almeno 4 giorni dopo la V0, comprensiva di consegna del materiale biologico raccolto (feci, saliva, urine), e di un diario alimentare di 3 giorni, compilazione del questionario anamnestico dei nuovi segni e sintomi e prelievo di sangue da parte del personale medico. Per pazienti con MDRO raccolta di tamponi rettali.
  • Valutazione telefonica: somministrazione di un "Food Frequency Questionnaire" per valutare le abitudini alimentari dei soggetti.

Saranno adottate procedure operative standard (SOP) per la conservazione, il trasporto e il trattamento dei campioni per garantire la stabilità dei campioni e garantire la validità e la qualità dei risultati.

A seguito dei prelievi, i campioni verranno processati in diverse aliquote che verranno utilizzate per:

  • screening di routine;
  • conservazione nella prima biobanca italiana di microbioti umani (I.R.C.C.S. - Istituto Tumori "Giovanni Paolo II", Bari);
  • valutazione del profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico;
  • Valutazione del profilo trascrittomico delle PBMC di soggetti sani e soggetti affetti da patologie selezionate e valutazione del profilo proteomico sierico Sarà inoltre condotta la caratterizzazione molecolare dei microrganismi patogeni e dei biotipi patogeni (patovar) di specie commensali di soggetti con patologie selezionate.

Parte del materiale biologico sarà utilizzato per studi su animali sul ruolo fisiopatologico del microbiota intestinale umano trapiantato in modelli murini di patologia e modelli murini germ free (sviluppato protocollo specifico di studio animale).

Saranno inoltre condotti studi in vitro su modelli di mucosa per valutare l'interazione tra il microbiota e la mucosa intestinale.

Lo studio prevede solo un rischio minimo associato alle procedure di prelievo di sangue. Saranno prese tutte le misure necessarie per evitare eventuali rischi/inconvenienti derivanti dalla partecipazione del soggetto oggetto di studio.

Lo studio è conforme alla Buona Pratica Clinica. Il protocollo dello studio e tutti i relativi documenti sono stati approvati dai Comitati Etici Indipendenti (IEC) dei siti clinici coinvolti.

Per garantire la protezione e la riservatezza dei dati dei partecipanti, tutte le attività di studio saranno svolte in conformità al Regolamento generale europeo sulla protezione dei dati, Regolamento (UE) 2016/679, che abroga la Direttiva 95/46/CE.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

225

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

      • Bari, Italia
        • Azienda Ospedaliera Universitaria Policlinico di Bari - Sezione di Malattie dell'Apparato Digerente, Endoscopia e Trapianto di Fegato (D.E.T.O.)
      • Perugia, Italia
        • Università degli Studi di Perugia - Dipartimento di Medicina
      • Roma, Italia
        • Centro Malattie Apparato Digerente - CEMAD, Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS - Università Cattolica del Sacro Cuore

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 18 anni a 60 anni (ADULTO)

Accetta volontari sani

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Soggetti con C. Difficile (CDI), soggetti affetti da infezione da Organismi Multifarmacoresistenti (MDRO), soggetti con Malattia Infiammatoria Cronica Intestinale (IBD), soggetti affetti da Sindrome dell'Intestino Irritabile (IBS) e soggetti con Encefalopatia Epatica che frequentano una delle cliniche centri coinvolti nello studio.

I volontari sani saranno reclutati su invito. I soggetti iscritti non devono avere alcun rapporto di parentela e di subordinazione gerarchica con le strutture ospedaliere presso le quali verranno prelevati i campioni biologici.

Descrizione

Criterio di inclusione:

VOLONTARI IN SALUTE

  • soggetti sani di età compresa tra 18 e 60 anni
  • BMI tra 18,5 e 30
  • dieta onnivora
  • firma del consenso informato

PAZIENTI CON CDI

  • soggetti con CDI > 18 anni
  • Infezione CDI ricorrente sintomatica, diagnosticata mediante ricerca di tossine (ELISA)
  • Soggetti idonei al trattamento antibiotico secondo le linee guida europee
  • Possibilità di essere sottoposto alle procedure diagnostiche e terapeutiche dello studio
  • Esame parassitologico negativo delle feci per Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum e altri parassiti.
  • Negatività della co-coltura per Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, Escherichia coli enteropatogeno e altri microrganismi ad eccezione di Clostridium difficile
  • Negatività dei seguenti test sierologici: HAV-IgM, HBsAg, Anti-HCV, Anti-HIV1-2, VDRL
  • Firma del consenso informato

PAZIENTI CON MDRO

  • Soggetti > 18 anni
  • Soggetti colonizzati per MDRO con diagnosi di tampone rettale
  • Coltura fecale parassitologica negativa per Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum e altri parassiti.
  • Coltura delle feci negativa per C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogeni Escherichia coli
  • Firma del consenso informato.

PAZIENTI CON IBD

  • Età> 18 anni.
  • Individui disponibili per visite programmate, piano di trattamento, test di laboratorio, linee guida sullo stile di vita e altre procedure di studio.
  • Soggetti con diagnosi documentata di colite ulcerosa o di Crohn almeno 6 mesi prima dello screening.
  • Firma del consenso informato.

PAZIENTI CON IBS

  • Soggetti con diagnosi di IBS secondo i criteri di Roma IV
  • Età compresa tra i 18 e i 60 anni
  • BMI tra 18,5 e 30
  • Dieta onnivora
  • Firma del consenso informato

PAZIENTI CON ENCEFALOPATIA EPATICA

  • Soggetti con encefalopatia epatica
  • Età compresa tra i 18 e i 60 anni
  • BMI tra 18,5 e 30
  • Dieta onnivora
  • Firma del consenso informato

Criteri di esclusione:

Volontari sani

  • Malattie infettive in atto o pregresse (HAV, HBV, HCV, HIV, Cytomegalovirus, virus di Epstein-Barr)
  • Malattia epatica cronica
  • Storia di infezioni da Clostridium difficile
  • Terapia recente (<3 mesi) con antibiotici, farmaci immunosoppressori, chemioterapia
  • Terapia cronica con inibitori della pompa protonica
  • Uso recente (<3 mesi) di probiotici, lassativi o altri coadiuvanti (farmaci/integratori) per la regolazione dell'attività gastrointestinale
  • Pregressa storia di trapianto di organi/tessuti
  • Recente insorgenza di diarrea
  • Diarrea cronica
  • Costipazione cronica
  • Precedenti interventi chirurgici gastrointestinali (es. bypass gastrico)
  • Infezioni ricorrenti delle vie urinarie (3 casi all'anno)
  • Precedenti malattie cardiovascolari acute maggiori (infarto del miocardio, ictus)
  • Diabete mellito di tipo 2
  • Ipertensione
  • eGFR (velocità di filtrazione glomerulare stimata) inferiore a 60 ml/minuto e/o diagnosi di nefropatia
  • Disturbi gastrointestinali cronici
  • Malattie infiammatorie sistemiche
  • Sospetto, diagnosi clinica o precedente storia di cancro (<5 anni)
  • Malattie autoimmuni o anamnesi di malattie autoimmuni croniche e sistemiche
  • Malattie neurodegenerative
  • Gravidanza e allattamento
  • Operatore sanitario
  • Gli operatori lavorano con gli animali
  • Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo.

Pazienti con CDI

  • Età <18 anni
  • Rilevazione negativa della tossina di Clostridium difficile nelle feci mediante metodo ELISA
  • Gravi condizioni cliniche (sepsi, grave disidratazione, importanti comorbilità)
  • Precedente i.c. colectomia totale o parziale
  • Alto rischio di complicanze post-colonscopia
  • Altre cause di sintomi simili a quelli causati da CDI, come altre infezioni, malattie infiammatorie intestinali o sindrome dell'intestino irritabile
  • Esame parassitologico positivo delle feci per Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum e altri parassiti
  • Coprocoltura positiva per Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, Escherichia coli enteropatogeno e altri microrganismi ad eccezione di Clostridium difficile
  • Positività dei seguenti test sierologici: HAV-IgM, HBsAg, Anti-HCV, Anti-HIV1-2, VDRL
  • Gravidanza o allattamento
  • Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo

Pazienti con MDRO

  • Soggetti <18
  • Soggetti impossibilitati ad eseguire o intolleranti all'endoscopia inferiore
  • Soggetti negativi al tampone rettale MDRO
  • Positività per coltura fecale parassitologica per Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum e altri parassiti.
  • Coltura fecale positiva per C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogeni Escherichia coli.
  • Soggetti in trattamento con ciclosporina, micofenolato o tacrolimus
  • Donne in gravidanza o allattamento
  • Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo

Pazienti con IBD

  • Soggetti <18 anni.
  • Soggetti con diagnosi di colite non determinata
  • Pazienti con comorbidità significative (sepsi, trauma grave nelle ultime 4 settimane, insufficienza cardiaca di classe NYHA IV)
  • Pazienti con sintomi compatibili con quelli causati da IBD, come colite infettiva, sindrome dell'intestino irritabile, colite ischemica, colite attinica.
  • Soggetti che ricevono o che dovrebbero ricevere ciclosporina, micofenolato o tacrolimus entro 4 settimane dalla visita di studio del primo giorno.
  • Positività per coltura fecale parassitologica per Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum e altri parassiti.
  • Coltura fecale positiva per C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogeni Escherichia coli.
  • Pazienti con diagnosi di colangite sclerosante primitiva.
  • Donne in gravidanza o allattamento.
  • Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo

Pazienti con IBS

  • Malattie infettive in atto o pregresse (HAV, HBV, HCV, HIV, Cytomegalovirus, virus di Epstein-Barr)
  • Malattia epatica cronica
  • Storia di infezioni da C. difficile
  • Terapia recente (<3 mesi) con antibiotici, farmaci immunosoppressori, chemioterapia
  • Terapia cronica con inibitori della pompa protonica
  • Pregressa storia di trapianto di organi/tessuti
  • Precedenti interventi chirurgici gastrointestinali (es. bypass gastrico)
  • Infezioni ricorrenti delle vie urinarie (3 casi all'anno)
  • Precedenti malattie cardiovascolari acute maggiori (infarto del miocardio, ictus)
  • Diabete mellito di tipo 2
  • eGFR inferiore a 60ml/minuto e/o diagnosi di nefropatia
  • Malattie infiammatorie sistemiche
  • Sospetto, diagnosi clinica o precedente storia di cancro (<5 anni)
  • Malattie autoimmuni o anamnesi di malattie autoimmuni croniche e sistemiche
  • Malattie neurodegenerative
  • Gravidanza e allattamento
  • Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo.

Pazienti con encefalopatia epatica

  • Storia di infezioni da C. difficile
  • Terapia cronica con inibitori della pompa protonica
  • Pregressa storia di trapianto di organi/tessuti
  • Recente comparsa di diarrea
  • Diarrea cronica
  • Precedenti interventi chirurgici gastrointestinali (es. bypass gastrico)
  • Infezioni ricorrenti delle vie urinarie (3 casi all'anno)
  • Precedenti malattie cardiovascolari acute maggiori (infarto del miocardio, ictus)
  • Diabete mellito di tipo 2
  • eGFR inferiore a 60ml/minuto e/o diagnosi di nefropatia
  • Malattie infiammatorie sistemiche
  • Sospetto, diagnosi clinica o precedente storia di cancro (<5 anni)
  • Malattie autoimmuni o anamnesi di malattie autoimmuni croniche e sistemiche
  • Gravidanza e allattamento
  • Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
volontari sani
Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine. Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
Pazienti CDI
Pazienti con infezione difficile da Clostridium
Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine. Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
Pazienti MDRO
Pazienti con infezione da organismi multiresistenti ai farmaci
Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine. Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
Pazienti con IBD
Pazienti con malattia infiammatoria cronica intestinale
Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine. Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
Pazienti con IBS
Pazienti con sindrome dell'intestino irritabile
Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine. Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
Pazienti con encefalopatia epatica
Pazienti con Encefalopatia Epatica
Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine. Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Raccolta di campioni biologici per la costituzione della prima Biobanca Nazionale del Microbioma
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 1 anno
Reclutamento di 225 soggetti (pazienti CDI, MDRO, IBD, IBS, Encefalopatia Epatica e volontari sani) per la raccolta di campioni biologici per la costituzione della prima Biobanca Nazionale del Microbioma
attraverso il completamento degli studi, una media di 1 anno

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (EFFETTIVO)

8 febbraio 2021

Completamento primario (EFFETTIVO)

10 maggio 2022

Completamento dello studio (EFFETTIVO)

10 maggio 2022

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

17 dicembre 2020

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

5 gennaio 2021

Primo Inserito (EFFETTIVO)

6 gennaio 2021

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (EFFETTIVO)

4 agosto 2022

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

3 agosto 2022

Ultimo verificato

1 gennaio 2022

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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