- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT04698148
Istituzione della Biobanca del Microbiota Intestinale e Salivare Umano - Malattie Gastrointestinali (BIOMIS-Gastr)
Costituzione Della Biobanca Del Microbiota Intestinale e Salivare Umano: Dalla Disbiosi Alla Simbiosi
Si tratta di uno studio prospettico, clinico, multicentrico finalizzato alla raccolta di campioni biologici e allo studio del microbiota da soggetti con Clostridium Difficile (CDI), soggetti affetti da infezione da Multi Drug Resistant Organisms (MDRO), soggetti con Malattia Infiammatoria Cronica Intestinale (IBD), soggetti con Sindrome dell'intestino irritabile (IBS), soggetti con encefalopatia epatica e da volontari sani. Il microbiota è un complesso consorzio di microrganismi, localizzati a livello delle mucose (in particolare intestinale, orale e vaginale) che hanno un ruolo chiave nella salute umana e nell'insorgenza di numerose malattie. Alterazioni del microbiota sono state riscontrate in diverse patologie (intestinali, metaboliche, renali, oncologiche, ginecologiche)
Lo studio consentirà di:
- Fornire campioni biologici (feci, saliva, sangue, urine) di volontari sani e pazienti alla prima biobanca italiana di microbiota;
- Studiare i microrganismi utilizzando diverse tecniche in vitro e in vivo;
- Studia il legame tra il microbiota e la malattia. Questo studio fa parte del progetto BIOMIS (Project Code: ARS01_01220), presentato nell'ambito dell'Avviso per la presentazione di progetti di ricerca industriale e sviluppo sperimentale nelle 12 aree di specializzazione individuate dal PNR 2015-2020 e ammesso a finanziamento ai sensi il Programma Operativo Nazionale "Ricerca e Innovazione" 2014-2020 con decreto direttoriale del MIUR - Dipartimento per l'Istruzione Superiore e la Ricerca - n. 2298 del 12 settembre 2018. BIOMIS comprende diversi studi clinici che arruolano pazienti con diverse patologie per raccogliere e conservare campioni biologici e studiare il microbiota.
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
L'obiettivo primario di questo studio multicentrico è quello di popolare la prima biobanca nazionale di microbiomi con campioni biologici (fecali, salivari, urinari e campioni di sangue) soggetti affetti da malattie selezionate (CDI, MDRO, IBD, IBS ed encefalopatia epatica) e volontari sani.
L'obiettivo secondario è la caratterizzazione dei microrganismi della biobanca e lo studio della relazione microbiota-patologia utilizzando approcci meta-omici, in vitro e in vivo.
Lo studio prevede di arruolare 225 soggetti presso il Policlinico di Bari, l'Università di Perugia e il Policlinico Agostino Gemelli di Roma, secondo i criteri di inclusione/esclusione. La partecipazione allo studio è volontaria e i soggetti hanno il diritto di ritirarsi dallo studio in qualsiasi momento e per qualsiasi motivo.
Durante lo studio sono previste 3 visite:
- Visita 0 (V0), comprensiva di descrizione degli obiettivi e delle modalità dello studio, firma del consenso informato scritto, valutazione dei criteri di inclusione/esclusione, visita medica (misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico), compilazione del questionario anamnestico, consegna del kit di coprocoltura, consegna dei kit per la raccolta del materiale fecale, salivare e urinario da refertare alla Visita 1 e consegna di un diario alimentare di 3 giorni, da compilare in autonomia nei giorni precedenti la Visita 1.
- Visita 1 (V1) - almeno 4 giorni dopo la V0, comprensiva di consegna del materiale biologico raccolto (feci, saliva, urine), e di un diario alimentare di 3 giorni, compilazione del questionario anamnestico dei nuovi segni e sintomi e prelievo di sangue da parte del personale medico. Per pazienti con MDRO raccolta di tamponi rettali.
- Valutazione telefonica: somministrazione di un "Food Frequency Questionnaire" per valutare le abitudini alimentari dei soggetti.
Saranno adottate procedure operative standard (SOP) per la conservazione, il trasporto e il trattamento dei campioni per garantire la stabilità dei campioni e garantire la validità e la qualità dei risultati.
A seguito dei prelievi, i campioni verranno processati in diverse aliquote che verranno utilizzate per:
- screening di routine;
- conservazione nella prima biobanca italiana di microbioti umani (I.R.C.C.S. - Istituto Tumori "Giovanni Paolo II", Bari);
- valutazione del profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico;
- Valutazione del profilo trascrittomico delle PBMC di soggetti sani e soggetti affetti da patologie selezionate e valutazione del profilo proteomico sierico Sarà inoltre condotta la caratterizzazione molecolare dei microrganismi patogeni e dei biotipi patogeni (patovar) di specie commensali di soggetti con patologie selezionate.
Parte del materiale biologico sarà utilizzato per studi su animali sul ruolo fisiopatologico del microbiota intestinale umano trapiantato in modelli murini di patologia e modelli murini germ free (sviluppato protocollo specifico di studio animale).
Saranno inoltre condotti studi in vitro su modelli di mucosa per valutare l'interazione tra il microbiota e la mucosa intestinale.
Lo studio prevede solo un rischio minimo associato alle procedure di prelievo di sangue. Saranno prese tutte le misure necessarie per evitare eventuali rischi/inconvenienti derivanti dalla partecipazione del soggetto oggetto di studio.
Lo studio è conforme alla Buona Pratica Clinica. Il protocollo dello studio e tutti i relativi documenti sono stati approvati dai Comitati Etici Indipendenti (IEC) dei siti clinici coinvolti.
Per garantire la protezione e la riservatezza dei dati dei partecipanti, tutte le attività di studio saranno svolte in conformità al Regolamento generale europeo sulla protezione dei dati, Regolamento (UE) 2016/679, che abroga la Direttiva 95/46/CE.
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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Bari, Italia
- Azienda Ospedaliera Universitaria Policlinico di Bari - Sezione di Malattie dell'Apparato Digerente, Endoscopia e Trapianto di Fegato (D.E.T.O.)
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Perugia, Italia
- Università degli Studi di Perugia - Dipartimento di Medicina
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Roma, Italia
- Centro Malattie Apparato Digerente - CEMAD, Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS - Università Cattolica del Sacro Cuore
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Soggetti con C. Difficile (CDI), soggetti affetti da infezione da Organismi Multifarmacoresistenti (MDRO), soggetti con Malattia Infiammatoria Cronica Intestinale (IBD), soggetti affetti da Sindrome dell'Intestino Irritabile (IBS) e soggetti con Encefalopatia Epatica che frequentano una delle cliniche centri coinvolti nello studio.
I volontari sani saranno reclutati su invito. I soggetti iscritti non devono avere alcun rapporto di parentela e di subordinazione gerarchica con le strutture ospedaliere presso le quali verranno prelevati i campioni biologici.
Descrizione
Criterio di inclusione:
VOLONTARI IN SALUTE
- soggetti sani di età compresa tra 18 e 60 anni
- BMI tra 18,5 e 30
- dieta onnivora
- firma del consenso informato
PAZIENTI CON CDI
- soggetti con CDI > 18 anni
- Infezione CDI ricorrente sintomatica, diagnosticata mediante ricerca di tossine (ELISA)
- Soggetti idonei al trattamento antibiotico secondo le linee guida europee
- Possibilità di essere sottoposto alle procedure diagnostiche e terapeutiche dello studio
- Esame parassitologico negativo delle feci per Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum e altri parassiti.
- Negatività della co-coltura per Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, Escherichia coli enteropatogeno e altri microrganismi ad eccezione di Clostridium difficile
- Negatività dei seguenti test sierologici: HAV-IgM, HBsAg, Anti-HCV, Anti-HIV1-2, VDRL
- Firma del consenso informato
PAZIENTI CON MDRO
- Soggetti > 18 anni
- Soggetti colonizzati per MDRO con diagnosi di tampone rettale
- Coltura fecale parassitologica negativa per Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum e altri parassiti.
- Coltura delle feci negativa per C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogeni Escherichia coli
- Firma del consenso informato.
PAZIENTI CON IBD
- Età> 18 anni.
- Individui disponibili per visite programmate, piano di trattamento, test di laboratorio, linee guida sullo stile di vita e altre procedure di studio.
- Soggetti con diagnosi documentata di colite ulcerosa o di Crohn almeno 6 mesi prima dello screening.
- Firma del consenso informato.
PAZIENTI CON IBS
- Soggetti con diagnosi di IBS secondo i criteri di Roma IV
- Età compresa tra i 18 e i 60 anni
- BMI tra 18,5 e 30
- Dieta onnivora
- Firma del consenso informato
PAZIENTI CON ENCEFALOPATIA EPATICA
- Soggetti con encefalopatia epatica
- Età compresa tra i 18 e i 60 anni
- BMI tra 18,5 e 30
- Dieta onnivora
- Firma del consenso informato
Criteri di esclusione:
Volontari sani
- Malattie infettive in atto o pregresse (HAV, HBV, HCV, HIV, Cytomegalovirus, virus di Epstein-Barr)
- Malattia epatica cronica
- Storia di infezioni da Clostridium difficile
- Terapia recente (<3 mesi) con antibiotici, farmaci immunosoppressori, chemioterapia
- Terapia cronica con inibitori della pompa protonica
- Uso recente (<3 mesi) di probiotici, lassativi o altri coadiuvanti (farmaci/integratori) per la regolazione dell'attività gastrointestinale
- Pregressa storia di trapianto di organi/tessuti
- Recente insorgenza di diarrea
- Diarrea cronica
- Costipazione cronica
- Precedenti interventi chirurgici gastrointestinali (es. bypass gastrico)
- Infezioni ricorrenti delle vie urinarie (3 casi all'anno)
- Precedenti malattie cardiovascolari acute maggiori (infarto del miocardio, ictus)
- Diabete mellito di tipo 2
- Ipertensione
- eGFR (velocità di filtrazione glomerulare stimata) inferiore a 60 ml/minuto e/o diagnosi di nefropatia
- Disturbi gastrointestinali cronici
- Malattie infiammatorie sistemiche
- Sospetto, diagnosi clinica o precedente storia di cancro (<5 anni)
- Malattie autoimmuni o anamnesi di malattie autoimmuni croniche e sistemiche
- Malattie neurodegenerative
- Gravidanza e allattamento
- Operatore sanitario
- Gli operatori lavorano con gli animali
- Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo.
Pazienti con CDI
- Età <18 anni
- Rilevazione negativa della tossina di Clostridium difficile nelle feci mediante metodo ELISA
- Gravi condizioni cliniche (sepsi, grave disidratazione, importanti comorbilità)
- Precedente i.c. colectomia totale o parziale
- Alto rischio di complicanze post-colonscopia
- Altre cause di sintomi simili a quelli causati da CDI, come altre infezioni, malattie infiammatorie intestinali o sindrome dell'intestino irritabile
- Esame parassitologico positivo delle feci per Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum e altri parassiti
- Coprocoltura positiva per Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, Escherichia coli enteropatogeno e altri microrganismi ad eccezione di Clostridium difficile
- Positività dei seguenti test sierologici: HAV-IgM, HBsAg, Anti-HCV, Anti-HIV1-2, VDRL
- Gravidanza o allattamento
- Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo
Pazienti con MDRO
- Soggetti <18
- Soggetti impossibilitati ad eseguire o intolleranti all'endoscopia inferiore
- Soggetti negativi al tampone rettale MDRO
- Positività per coltura fecale parassitologica per Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum e altri parassiti.
- Coltura fecale positiva per C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogeni Escherichia coli.
- Soggetti in trattamento con ciclosporina, micofenolato o tacrolimus
- Donne in gravidanza o allattamento
- Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo
Pazienti con IBD
- Soggetti <18 anni.
- Soggetti con diagnosi di colite non determinata
- Pazienti con comorbidità significative (sepsi, trauma grave nelle ultime 4 settimane, insufficienza cardiaca di classe NYHA IV)
- Pazienti con sintomi compatibili con quelli causati da IBD, come colite infettiva, sindrome dell'intestino irritabile, colite ischemica, colite attinica.
- Soggetti che ricevono o che dovrebbero ricevere ciclosporina, micofenolato o tacrolimus entro 4 settimane dalla visita di studio del primo giorno.
- Positività per coltura fecale parassitologica per Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/dispar, Cryptosporidium parvum e altri parassiti.
- Coltura fecale positiva per C. difficile, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Campylobacter, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, enteropatogeni Escherichia coli.
- Pazienti con diagnosi di colangite sclerosante primitiva.
- Donne in gravidanza o allattamento.
- Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo
Pazienti con IBS
- Malattie infettive in atto o pregresse (HAV, HBV, HCV, HIV, Cytomegalovirus, virus di Epstein-Barr)
- Malattia epatica cronica
- Storia di infezioni da C. difficile
- Terapia recente (<3 mesi) con antibiotici, farmaci immunosoppressori, chemioterapia
- Terapia cronica con inibitori della pompa protonica
- Pregressa storia di trapianto di organi/tessuti
- Precedenti interventi chirurgici gastrointestinali (es. bypass gastrico)
- Infezioni ricorrenti delle vie urinarie (3 casi all'anno)
- Precedenti malattie cardiovascolari acute maggiori (infarto del miocardio, ictus)
- Diabete mellito di tipo 2
- eGFR inferiore a 60ml/minuto e/o diagnosi di nefropatia
- Malattie infiammatorie sistemiche
- Sospetto, diagnosi clinica o precedente storia di cancro (<5 anni)
- Malattie autoimmuni o anamnesi di malattie autoimmuni croniche e sistemiche
- Malattie neurodegenerative
- Gravidanza e allattamento
- Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo.
Pazienti con encefalopatia epatica
- Storia di infezioni da C. difficile
- Terapia cronica con inibitori della pompa protonica
- Pregressa storia di trapianto di organi/tessuti
- Recente comparsa di diarrea
- Diarrea cronica
- Precedenti interventi chirurgici gastrointestinali (es. bypass gastrico)
- Infezioni ricorrenti delle vie urinarie (3 casi all'anno)
- Precedenti malattie cardiovascolari acute maggiori (infarto del miocardio, ictus)
- Diabete mellito di tipo 2
- eGFR inferiore a 60ml/minuto e/o diagnosi di nefropatia
- Malattie infiammatorie sistemiche
- Sospetto, diagnosi clinica o precedente storia di cancro (<5 anni)
- Malattie autoimmuni o anamnesi di malattie autoimmuni croniche e sistemiche
- Gravidanza e allattamento
- Condizioni psichiatriche che riducono la conformità al protocollo
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
|---|---|
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volontari sani
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Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine.
Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
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Pazienti CDI
Pazienti con infezione difficile da Clostridium
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Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine.
Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
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Pazienti MDRO
Pazienti con infezione da organismi multiresistenti ai farmaci
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Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine.
Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
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Pazienti con IBD
Pazienti con malattia infiammatoria cronica intestinale
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Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine.
Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
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Pazienti con IBS
Pazienti con sindrome dell'intestino irritabile
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Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine.
Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
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Pazienti con encefalopatia epatica
Pazienti con Encefalopatia Epatica
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Questionario anamnestico, Questionario alimentare 3 giorni, Questionario frequenza alimentare
Misurazione della pressione arteriosa, esame fisico addominale e toracico
Raccolta di feci, esame di coprocoltura, urine, saliva, PBMC e sangue per biobanche, per valutare il profilo proteomico, metascriptomico, metabolomico, metagenomico e metagenetico e per eseguire screening di routine.
Analisi per l'identificazione, la quantificazione e la caratterizzazione dei batteri che promuovono la salute
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Raccolta di campioni biologici per la costituzione della prima Biobanca Nazionale del Microbioma
Lasso di tempo: attraverso il completamento degli studi, una media di 1 anno
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Reclutamento di 225 soggetti (pazienti CDI, MDRO, IBD, IBS, Encefalopatia Epatica e volontari sani) per la raccolta di campioni biologici per la costituzione della prima Biobanca Nazionale del Microbioma
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attraverso il completamento degli studi, una media di 1 anno
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Collaboratori e investigatori
Collaboratori
Investigatori
- Investigatore principale: Giuseppe Losurdo, MD, Azienda Ospedaliera Universitaria Consorziale Policlinico di Bari
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Aira A, Feher C, Rubio E, Soriano A. The Intestinal Microbiota as a Reservoir and a Therapeutic Target to Fight Multi-Drug-Resistant Bacteria: A Narrative Review of the Literature. Infect Dis Ther. 2019 Dec;8(4):469-482. doi: 10.1007/s40121-019-00272-7. Epub 2019 Oct 25.
- Rivera-Flores R, Moran-Villota S, Cervantes-Barragan L, Lopez-Macias C, Uribe M. Manipulation of microbiota with probiotics as an alternative for treatment of hepatic encephalopathy. Nutrition. 2020 May;73:110693. doi: 10.1016/j.nut.2019.110693. Epub 2019 Dec 6.
- Yoon YK, Suh JW, Kang EJ, Kim JY. Efficacy and safety of fecal microbiota transplantation for decolonization of intestinal multidrug-resistant microorganism carriage: beyond Clostridioides difficile infection. Ann Med. 2019 Nov-Dec;51(7-8):379-389. doi: 10.1080/07853890.2019.1662477. Epub 2019 Sep 13.
- Ni J, Wu GD, Albenberg L, Tomov VT. Gut microbiota and IBD: causation or correlation? Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2017 Oct;14(10):573-584. doi: 10.1038/nrgastro.2017.88. Epub 2017 Jul 19.
- Rajilic-Stojanovic M, Jonkers DM, Salonen A, Hanevik K, Raes J, Jalanka J, de Vos WM, Manichanh C, Golic N, Enck P, Philippou E, Iraqi FA, Clarke G, Spiller RC, Penders J. Intestinal microbiota and diet in IBS: causes, consequences, or epiphenomena? Am J Gastroenterol. 2015 Feb;110(2):278-87. doi: 10.1038/ajg.2014.427. Epub 2015 Jan 27.
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (EFFETTIVO)
Completamento primario (EFFETTIVO)
Completamento dello studio (EFFETTIVO)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (EFFETTIVO)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (EFFETTIVO)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
- Malattie dell'apparato digerente
- Insufficienza epatica
- Insufficienza epatica
- Malattie metaboliche
- Malattie del sistema nervoso centrale
- Malattie del sistema nervoso
- Infezioni
- Malattie del fegato
- Gastroenterite
- Malattie del colon, funzionali
- Malattie del colon
- Malattie intestinali
- Infezioni batteriche
- Infezioni batteriche e micosi
- Infezioni batteriche Gram-positive
- Malattie cerebrali, metaboliche
- Sindrome dell'intestino irritabile
- Malattie infiammatorie intestinali
- Encefalopatia epatica
- Malattie del cervello
- Malattie gastrointestinali
- Infezioni da Clostridium
Altri numeri di identificazione dello studio
- BIOMIS-Gastr
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
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