Hodnocení polymorfismů inflammasomových genů u pacientů s parodontitidou

Vrozená imunitní odpověď je první linií obranného mechanismu těla proti patogenům. Jedním z nejdůležitějších proteinů zapojených do vrozené imunitní odpovědi jsou záněty, které jsou multimerními proteinovými komplexy složenými ze senzorové molekuly (PRR), typicky z adaptorové molekuly apoptózy asociovaný speck-like protein obsahující kaspázovou náborovou doménu (CARD). a proteázová kaspáza-1. Byly popsány různé typy zánětů. U onemocnění parodontu je aktivace zánětu spojena s uvolňováním prozánětlivých cytokinů, které mohou vést k destrukci tkáně a poškození parodontu.

Rychlost progrese, věk nástupu a závažnost onemocnění parodontu jsou ovlivněny některými modifikovatelnými nebo nemodifikovatelnými rizikovými faktory přítomnými u hostitele. Genetické polymorfismy jsou nemodifikovatelné rizikové faktory parodontitidy. Variace v genech zánětu mohou být determinanty ve vývoji periodontálního onemocnění tím, že vedou k diverzitě zánětlivých markerů.

Velikost vzorku je určena na základě předchozí studie, která analyzuje účinek polymorfismu genu NLRP3 na náchylnost k parodontóze. Pro skupinu rs4612666 s hodnotou α 0,05 a mocninou 80 % je stanoveno, že v každé skupině by mělo být 80 účastníků. Celkem je zahrnuto 240 pacientů (80 periodontálně zdravých, 80 periodontitida stupně III stupně B, 80 parodontitida stupně III stupně C). Klinické parodontologické vyšetření celých úst zahrnuje měření hloubky sondování (PPD), úrovně klinického připojení (CAL), přítomnosti krvácení při sondování (BOP), gingiválního indexu (GI) a indexu plaku (PI) na 6 místech na zub, kromě třetí stoličky. Diagnóza parodontu u každého pacienta byla provedena podle Světového workshopu o klasifikaci parodontálních a periimplantátových onemocnění a stavů z roku 2017. Zdravá skupina zahrnuje jedince bez klinického zánětlivého vzoru a anamnézy parodontitidy, bez detekovaného klinického uchycení a ztráty kostní hmoty, BOP < 10 %, hloubka sondy ≤ 3 mm. Pacienti s periodontitidou stupně III ve stadiu III mají minimálně 20 zubů (kromě třetích molárů), s CAL ≥ 5 mm, hloubkou sondy ≥ 6 mm a rentgenologicky ukazují úbytek kostní hmoty zasahující až do jedné třetiny kořene, procento úbytku kosti věkem je 0,25-1 a pacienti stupně C ve stadiu III mají minimálně 20 zubů (kromě třetích molárů), s CAL ≥ 5 mm, hloubkou sondy ≥ 6 mm a rentgenologicky ukazují úbytek kostní hmoty zasahující až do jedné třetiny kořene, procento úbytku kosti podle věku je >1.

Odběr vzorku a izolace DNA a genotypizace Celkem 5 ml krve se odebere z antekubitální jamky metodou venepunkce od každého účastníka a uloží se při -80 °C do dne analýzy. Izolace DNA byla provedena pomocí souprav genomové DNA. Oblasti SNP rs4612666, rs75985579 a rs2793845 jsou detekovány z materiálu DNA pomocí souprav pro genotypizaci zařízení Real-Time PCR.

Statistická analýza byla provedena pomocí standardního statistického softwarového balíku výběrem vhodných testů.