Markører for pulmonal dysbiose forbundet med eksacerbation hos patienter fulgt for cystisk fibrose (DYSBIOSE-CF)

Terapeutiske fremskridt og organiseringen af ​​pleje inden for "CRCM" har ført til en generel forbedring i behandlingen af ​​cystisk fibrose. De proteinterapier, der har markeret denne progression, er kun rettet mod bestemte gener og vedrører et lille antal patienter. Sygeligheden, dødeligheden og de sociale omkostninger ved cystisk fibrose er stadig betydelige. Eksacerbationer modulerer prognosen for sygdommen.

Vi er interesserede i dysbiose, som er sammenhængen mellem en ubalance i sammensætningen og funktionerne af kommensale komplekse mikrobielle samfund og en ændring af værtens immunrespons. Det er involveret i udviklingen af ​​kroniske lungepatologier såsom cystisk fibrose Lungemikrobiota og værtsresponser påvirker hinanden gensidigt, og beviser tyder på, at ændringer i mikrobiota-værtsinteraktioner spiller en stor rolle i udviklingen af ​​kroniske luftvejssygdomme. Værtens respons kan delvist måles af proteinmarkører for inflammation eller metabolitter, der regulerer inflammation (tryptofanmetabolitter).

De fleste mikrobiomundersøgelser fokuserer på den bakterielle mikrobiota, mens andre mikroorganismer som svampe og vira repræsenterer en vigtig cofaktor i nedbrydningen af ​​åndedrætsfunktionen. Viral dysbiose spiller sandsynligvis en rolle i forekomsten af ​​eksacerbation.

Blandt de få undersøgelser, der inkorporerer svamperisiko, har meget få overvejet rollen som Pneumocystis jirovecii (PCJ). Denne ikke-dyrkbare art blev fundet hos 12,5% af patienterne med cystisk fibrose og muligvis forbundet med eksacerbationer. Vi vil prospektivt følge en kohorte af patienter med cystisk fibrose ved at indsamle kliniske og mikrobiologiske data om forskellige prøver (udåndet luftkondensat (EAC), sputum og serum) på kvartalsbasis og under episoder med eksacerbationer.

Vores projekt vil verificere hypotesen om en sammenhæng mellem mikrobiotaen, inflammation og produktionen af ​​metabolitter, der regulerer inflammation (dysbiose), men også for at bestemme, hvad der er den indledende biologiske proces, der fører til forværringen: dysbiose induceret af variation af mikrobiotaen eller dysbiosen induceret af modifikation af værtsforsvarssystemer. Derudover vil vi i modsætning til undersøgelser på dette område være interesserede i bakterie-, virus- og svampemikrobiotaen.