Marcadores de disbiosis pulmonar asociados a exacerbación en pacientes seguidos por fibrosis quística (DYSBIOSE-CF)

Los avances terapéuticos y la organización de la atención dentro del "CRCM" han llevado a una mejora general en el manejo de la fibrosis quística. Las terapias con proteínas que han marcado esta progresión solo se dirigen a ciertos genes y afectan a un número reducido de pacientes. La morbilidad, la mortalidad y el coste social de la fibrosis quística siguen siendo considerables. Las exacerbaciones modulan el pronóstico de la enfermedad.

Nos interesa la disbiosis, que es la asociación de un desequilibrio en la composición y funciones de las comunidades microbianas del complejo comensal y una alteración de la respuesta inmune del huésped. Está involucrada en el desarrollo de patologías pulmonares crónicas como la fibrosis quística. La microbiota pulmonar y las respuestas del huésped se influyen mutuamente, y la evidencia sugiere que los cambios en las interacciones microbiota-huésped juegan un papel importante en la evolución de las enfermedades respiratorias crónicas. La respuesta del huésped puede medirse parcialmente mediante marcadores proteicos de inflamación o metabolitos que regulan la inflamación (metabolitos de triptófano).

La mayoría de los estudios de microbioma se centran en la microbiota bacteriana, mientras que otros microorganismos como hongos y virus representan un cofactor importante en la degradación de la función respiratoria. La disbiosis viral probablemente juega un papel en la aparición de la exacerbación.

Entre los pocos estudios que incorporan el riesgo fúngico, muy pocos han considerado el papel de Pneumocystis jirovecii (PCJ). Esta especie no cultivable se encontró en el 12,5% de los pacientes con fibrosis quística y posiblemente asociada a exacerbaciones. Realizaremos un seguimiento prospectivo de una cohorte de pacientes con fibrosis quística mediante la recopilación de datos clínicos y microbiológicos en varias muestras (condensado de aire exhalado (EAC), esputo y suero) trimestralmente y durante los episodios de exacerbaciones.

Nuestro proyecto verificará la hipótesis de una correlación entre la microbiota, la inflamación y la producción de metabolitos que regulan la inflamación (disbiosis), pero también determinará cuál es el proceso biológico inicial que conduce a la exacerbación: disbiosis inducida por variación de la microbiota o disbiosis inducida por la modificación de los sistemas de defensa del huésped. Además, a diferencia de los estudios en esta área, nos interesará la microbiota bacteriana, viral y fúngica.