Marcadores de Disbiose Pulmonar Associada à Exacerbação em Pacientes Acompanhados por Fibrose Cística (DYSBIOSE-CF)

Os avanços terapêuticos e a organização do cuidado dentro do "CRCM" levaram a uma melhora geral no manejo da fibrose cística. As terapias com proteínas que marcaram essa progressão visam apenas alguns genes e dizem respeito a um pequeno número de pacientes. A morbidade, mortalidade e custo social da fibrose cística ainda são consideráveis. As exacerbações modulam o prognóstico da doença.

Estamos interessados ​​na disbiose, que é a associação de um desequilíbrio na composição e funções das comunidades microbianas complexas comensais e uma alteração da resposta imune do hospedeiro. Está envolvido no desenvolvimento de patologias pulmonares crônicas, como a fibrose cística. A microbiota pulmonar e as respostas do hospedeiro influenciam-se mutuamente, e as evidências sugerem que as mudanças nas interações microbiota-hospedeiro desempenham um papel importante na evolução das doenças respiratórias crônicas. A resposta do hospedeiro pode ser parcialmente medida por marcadores proteicos de inflamação ou metabólitos que regulam a inflamação (metabólitos do triptofano).

A maioria dos estudos de microbioma se concentra na microbiota bacteriana, enquanto outros microrganismos, como fungos e vírus, representam um importante cofator na degradação da função respiratória. A disbiose viral provavelmente desempenha um papel no surgimento da exacerbação.

Entre os poucos estudos que incorporam o risco fúngico, muito poucos consideraram o papel do Pneumocystis jirovecii (PCJ). Essa espécie não cultivável foi encontrada em 12,5% dos pacientes com fibrose cística e possivelmente associada a exacerbações. Seguiremos prospectivamente uma coorte de pacientes com fibrose cística coletando dados clínicos e microbiológicos em várias amostras (condensado de ar exalado (EAC), escarro e soro) trimestralmente e durante episódios de exacerbações.

Nosso projeto irá verificar a hipótese de uma correlação entre a microbiota, a inflamação e a produção de metabólitos reguladores da inflamação (disbiose), mas também determinar qual é o processo biológico inicial que leva à exacerbação: disbiose induzida por variação da microbiota ou disbiose induzida pela modificação dos sistemas de defesa do hospedeiro. Além disso, diferentemente dos estudos nessa área, estaremos interessados ​​na microbiota bacteriana, viral e fúngica.