Marcatori di disbiosi polmonare associati a esacerbazione in pazienti seguiti per fibrosi cistica (DYSBIOSE-CF)

I progressi terapeutici e l'organizzazione delle cure all'interno del "CRCM" hanno portato a un miglioramento complessivo nella gestione della fibrosi cistica. Le terapie proteiche che hanno segnato questa progressione prendono di mira solo alcuni geni e riguardano un numero ristretto di pazienti. La morbilità, la mortalità e il costo sociale della fibrosi cistica sono ancora considerevoli. Le riacutizzazioni modulano la prognosi della malattia.

Siamo interessati alla disbiosi, che è l'associazione tra uno squilibrio nella composizione e nelle funzioni di comunità microbiche commensali complesse e un'alterazione della risposta immunitaria dell'ospite. È coinvolto nello sviluppo di patologie polmonari croniche come la fibrosi cistica. Il microbiota polmonare e le risposte dell'ospite si influenzano reciprocamente e le prove suggeriscono che i cambiamenti nelle interazioni microbiota-ospite svolgono un ruolo importante nell'evoluzione delle malattie respiratorie croniche. La risposta dell'ospite può essere parzialmente misurata da marcatori proteici di infiammazione o metaboliti che regolano l'infiammazione (metaboliti del triptofano).

La maggior parte degli studi sul microbioma si concentra sul microbiota batterico, mentre altri microrganismi come funghi e virus rappresentano un importante cofattore nella degradazione della funzione respiratoria. La disbiosi virale probabilmente gioca un ruolo nella comparsa della riacutizzazione.

Tra i pochi studi che incorporano il rischio fungino, pochissimi hanno considerato il ruolo di Pneumocystis jirovecii (PCJ). Questa specie non coltivabile è stata trovata nel 12,5% dei pazienti con fibrosi cistica e possibilmente associata a riacutizzazioni. Seguiremo prospetticamente una coorte di pazienti con fibrosi cistica raccogliendo dati clinici e microbiologici su vari campioni (condensato di aria espirata (EAC), espettorato e siero) su base trimestrale e durante episodi di esacerbazioni.

Il nostro progetto verificherà l'ipotesi di una correlazione tra microbiota, infiammazione e produzione di metaboliti che regolano l'infiammazione (disbiosi), ma anche per determinare quale sia il processo biologico iniziale che porta alla riacutizzazione: disbiosi indotta da variazione del microbiota o disbiosi indotta dalla modifica dei sistemi di difesa dell'ospite. Inoltre, a differenza degli studi in quest'area, saremo interessati al microbiota batterico, virale e fungino.