Marker für Lungendysbiose im Zusammenhang mit einer Exazerbation bei Patienten, die wegen zystischer Fibrose nachuntersucht wurden (DYSBIOSE-CF)

Therapeutische Fortschritte und die Organisation der Versorgung innerhalb des "CRCM" haben zu einer allgemeinen Verbesserung der Behandlung von Mukoviszidose geführt. Die Proteintherapien, die diesen Fortschritt markiert haben, zielen nur auf bestimmte Gene ab und betreffen eine kleine Anzahl von Patienten. Die Morbidität, Mortalität und die sozialen Kosten der Mukoviszidose sind immer noch beträchtlich. Exazerbationen modulieren die Prognose der Krankheit.

Wir interessieren uns für Dysbiose, also die Assoziation eines Ungleichgewichts in der Zusammensetzung und Funktion kommensaler komplexer mikrobieller Gemeinschaften und einer Veränderung der Immunantwort des Wirts. Es ist an der Entwicklung chronischer Lungenpathologien wie zystischer Fibrose beteiligt. Lungenmikrobiota und Wirtsreaktionen beeinflussen sich gegenseitig, und es gibt Hinweise darauf, dass Veränderungen der Mikrobiota-Wirt-Interaktionen eine wichtige Rolle bei der Entwicklung chronischer Atemwegserkrankungen spielen. Die Reaktion des Wirts kann teilweise durch Proteinmarker für Entzündungen oder Metaboliten gemessen werden, die Entzündungen regulieren (Tryptophan-Metaboliten).

Die meisten Mikrobiomstudien konzentrieren sich auf die bakterielle Mikrobiota, während andere Mikroorganismen wie Pilze und Viren einen wichtigen Kofaktor bei der Verschlechterung der Atmungsfunktion darstellen. Virale Dysbiose spielt wahrscheinlich eine Rolle beim Auftreten von Exazerbationen.

Unter den wenigen Studien, die das Pilzrisiko berücksichtigen, haben nur sehr wenige die Rolle von Pneumocystis jirovecii (PCJ) berücksichtigt. Diese nicht kultivierbare Spezies wurde bei 12,5 % der Patienten mit zystischer Fibrose gefunden und möglicherweise mit Exazerbationen in Verbindung gebracht. Wir werden prospektiv eine Kohorte von Patienten mit zystischer Fibrose verfolgen, indem wir vierteljährlich und während Episoden von Exazerbationen klinische und mikrobiologische Daten zu verschiedenen Proben (Kondensat der ausgeatmeten Luft (EAC), Sputum und Serum) sammeln.

Unser Projekt wird die Hypothese einer Korrelation zwischen Mikrobiota, Entzündung und der Produktion von Metaboliten, die Entzündungen regulieren (Dysbiose), überprüfen, aber auch bestimmen, was der anfängliche biologische Prozess ist, der zur Exazerbation führt: Dysbiose, die durch Variation der Mikrobiota oder Dysbiose induziert wird durch Modifikation des Wirtsabwehrsystems induziert. Darüber hinaus werden wir uns im Gegensatz zu Studien in diesem Bereich für die bakterielle, virale und pilzliche Mikrobiota interessieren.