Omics-videnskaber til identifikation af patogenetiske mekanismer og biomarkører i neurodegenerative sygdomme (NeurOmics)

Studiet har til formål at anvende 'omics'-videnskaber ved hjælp af de mest avancerede nu tilgængelige teknologier for at identificere patogene genomiske varianter, proteiner og/eller ændrede molekylære pathway'er i neurodegenerative sygdomme og for at opnå en ny og mere komplet karakterisering af personer påvirket af de undersøgte neurodegenerative sygdomme.
Takket være integrationen af genomiske, genexpressions- (transkriptomiske og epigenomiske), protein- og metaboliske data samt kliniske data, sigter studiet også mod at identificere nye markører til diagnostik, prognose, også med hensyn til respons på terapi, og overvågning af neurodegenerative sygdomme.

Studiet indebærer rekruttering af mindst 1.200 personer med neurodegenerative sygdomme.

Studiepopulationen består af patienter med neurodegenerative sygdomme fra IRCCS Ospedale Policlinico San Martino i Genova og IRCCS Cà Granda Ospedale Maggiore Policlinico Foundation i Milano samt eventuelle andre enheder, der måtte ønske at deltage i studiet efter godkendelse af etisk komité.
De berettigede til rekruttering vil blive identificeret under de ambulante besøg planlagt under de kliniske kontroller på de to centre.
Under disse besøg vil patienter blive tilbudt at deltage i studiet.
Den kliniske diagnose vil blive stillet i henhold til kriterierne anvendt for hver subtype af neurodegenerative sygdomme og detaljeret i projektet.

Forskellige typer biologiske prøver vil blive indsamlet fra patienter inkluderet i studiet, primært perifert blod, spyt (hvis blodprøvetagning ikke er mulig) og urin.
Prøver vil blive taget under almindelig prøvetagning ved et af opfølgningsbesøgene.

Omics-analyser, primært genomik, transkriptomik, epigenomik osv., vil blive udført på de indsamlede biologiske prøver og/eller deres derivater.

Analyser kan udføres på genetisk materiale ekstraheret fra heel perifert blod, spyt, PBMC'er (perifere mononukleære blodceller), plasma, serum og/eller urin.

En aliquot af DNA, pseudonymiseret, vil blive sendt til laboratorierne ved Italian Institute of Technology (Genova og Aosta) til genom- og andre omics-analyser.

En aliquot af DNA og derivater fra indsamlingen (serum, plasma, PBMC) vil blive opbevaret i biobanken ved de kliniske centre, som patienterne er henvist til.

Studiet forudser ikke anvendelse af eksperimentelle lægemidler eller andre indgreb på patienten, ud over dem forudset i den diagnostiske rutine.

Studiet planlægger at karakterisere fra et 'omics'-synspunkt cirka 1.200 patienter med neurodegenerative sygdomme tilknyttet IRCCS Policlinico San Martino i Genova og Fondazione IRCCS Policlinico Cà Granda i Milano samt eventuelle andre enheder, der måtte ønske at deltage i studiet efter godkendelse fra den relevante etiske komité.

Formålet med studiet for de forskellige patologier er at identificere gennem undersøgelse af genomet, enkelt- og polygeniske varianter, både sjældne og almindelige, enkeltnukleotid (SNV) og/eller strukturelle (såsom CNV, insertioner, translocationer, inversioner og mobile element insertioner (MEI)), der kan være årsag til eller give en forøget risiko for at udvikle sygdommen.
Desuden vil integrationen af genomiske data med andre 'omics'-videnskaber gøre det muligt at korrelere tilstedeværelsen af sådanne variationer med gen-, protein- og metabolisk ekspression for at skitsere forskellige forløb af molekylære mekanismer associeret med neurodegeneration, deres indvirkning på sygdomsforløbet og identifikation af nye terapeutiske mål.