Omics-vetenskaper för identifiering av patogena mekanismer och biomarkörer i neurodegenerativa sjukdomar (NeurOmics)

Studien syftar till att använda 'omics'-vetenskaper med de mest avancerade tekniker som för närvarande finns tillgängliga för att identifiera patogena genomiska varianter, proteiner och/eller förändrade molekylära vägar vid neurodegenerativa sjukdomar och för att få en ny och mer komplett karakterisering av personer som drabbats av de neurodegenerativa sjukdomar som studeras. Tack vare integrationen av genomiska data, genuttrycksdata (transkriptomiska och epigenomiska), proteindata och metabola data samt kliniska data syftar studien också till att identifiera nya markörer för diagnostik, prognos, även när det gäller respons på behandling, och övervakning av neurodegenerativa sjukdomar.

Studien innebär rekrytering av minst 1 200 individer med neurodegenerativ sjukdom.

Studiepopulationen består av patienter med neurodegenerativa sjukdomar från IRCCS Ospedale Policlinico San Martino i Genua och IRCCS Cà Granda Ospedale Maggiore Policlinico Foundation i Milano samt eventuella andra enheter som kan vilja delta i studien efter godkännande av etikprövningsnämnden. De individer som är kvalificerade för deltagande kommer att identifieras under de öppenvårdsbesök som är schemalagda under de kliniska kontrollerna vid de två centrorna. Under dessa besök kommer patienter att erbjudas att delta i studien. Den kliniska diagnosen kommer att ställas enligt de kriterier som används för varje undergrupp av neurodegenerativ sjukdom och som är detaljerade i projektet.

Olika typer av biologiska prover kommer att samlas in från patienter som ingår i studien, huvudsakligen perifert blod, saliv (om blodprovstagning inte är möjlig) och urin. Proverna kommer att tas under regelbunden provtagning vid ett av uppföljningsbesöken.

Omics-analyser, huvudsakligen genomik, transkriptomik, epigenomik etc., kommer att utföras på de tagna biologiska proverna och/eller deras derivat.

Analyser kan utföras på genetiskt material som extraherats från helt perifert blod, saliv, PBMC (perifera blodmononukleära celler), plasma, serum och/eller urin.

En aliquot av DNA, pseudonymiserad, kommer att skickas till laboratorierna vid Italian Institute of Technology (Genua och Aosta) för genom- och andra omics-analyser.

En aliquot av DNA och derivaten från insamlingen (serum, plasma, PBMC) kommer att förvaras i biobanken vid de kliniska centrarna där patienterna hänvisas.

Studien förutser inte användning av experimentella läkemedel eller andra ingrepp på patienten, förutom de som föreskrivs i den diagnostiska rutinen.

Studien planerar att karakterisera från ett 'omics'-perspektiv cirka 1 200 patienter som drabbats av neurodegenerativa sjukdomar och som tillhör IRCCS Policlinico San Martino i Genua och Fondazione IRCCS Policlinico Cà Granda i Milano samt eventuella andra enheter som kan vilja delta i studien efter godkännande av relevant etikprövningskommitté.

Syftet med studien, för de olika sjukdomar av intresse, är att identifiera genom studier av genomet, enkla och polygena varianter, både sällsynta och vanliga, enstaka nukleotidvarianter (SNV) och/eller strukturella (såsom CNV, insertioner, translocationer, inversioner och insättningar av mobila element (MEI)) som kan vara orsakande eller ge en ökad risk att utveckla sjukdomen. Dessutom kommer integrationen av genomdata med andra 'omics'-vetenskaper att göra det möjligt att korrelera förekomsten av sådana variationer med gen-, protein- och metabolt uttryck, för att skissera olika banor för molekylära mekanismer associerade med neurodegeneration, deras inverkan på sjukdomsförloppet och identifiering av nya terapeutiska mål.