Sciences omiques pour l'identification des mécanismes pathogéniques et des biomarqueurs dans les maladies neurodégénératives (NeurOmics)

L'étude vise à utiliser les sciences 'omiques', en employant les technologies les plus avancées actuellement disponibles, afin d'identifier les variants génomiques pathogènes, les protéines et/ou les voies moléculaires altérées dans les maladies neurodégénératives et d'obtenir une caractérisation nouvelle et plus complète des sujets atteints par les maladies neurodégénératives étudiées. Grâce à l'intégration des données génomiques, d'expression génique (transcriptomique et épigénomique), protéiques et métaboliques et des données cliniques, l'étude vise également à identifier de nouveaux marqueurs pour le diagnostic, le pronostic, également en termes de réponse au traitement, et le suivi des maladies neurodégénératives.

L'étude implique le recrutement d'au moins 1 200 individus atteints de maladie neurodégénérative.

La population étudiée est constituée de patients atteints de maladies neurodégénératives de l'IRCCS Ospedale Policlinico San Martino de Gênes et de la Fondation IRCCS Cà Granda Ospedale Maggiore Policlinico de Milan et de toute autre unité qui pourrait souhaiter participer à l'étude après approbation par le CE. Les sujets éligibles au recrutement seront identifiés lors des consultations externes programmées pendant les contrôles cliniques dans les deux centres. Lors de ces visites, il sera proposé aux patients de participer à l'étude. Le diagnostic clinique sera établi selon les critères utilisés pour chaque sous-type de maladie neurodégénérative et détaillés dans le projet.

Différents types d'échantillons biologiques seront collectés auprès des patients recrutés dans l'étude, principalement du sang périphérique, de la salive (si le prélèvement sanguin n'est pas possible) et de l'urine. Les échantillons seront prélevés lors des prélèvements réguliers lors de l'une des visites de suivi.

Des analyses omiques, principalement génomiques, transcriptomiques, épigénomiques, etc., seront réalisées sur les échantillons biologiques prélevés et/ou leurs dérivés.

Les analyses pourront être effectuées sur le matériel génétique extrait du sang périphérique total, de la salive, des PBMC (cellules mononucléaires du sang périphérique), du plasma, du sérum et/ou de l'urine.

Un aliquot d'ADN, pseudonymisé, sera envoyé aux laboratoires de l'Institut italien de technologie (Gênes et Aoste) pour l'analyse du génome et d'autres analyses omiques.

Un aliquot d'ADN et les dérivés de la collecte (sérum, plasma, PBMC) seront stockés dans la biobanque des centres cliniques auxquels les patients sont référés.

L'étude ne prévoit pas l'utilisation de médicaments expérimentaux ou d'autres interventions sur le patient, autres que celles prévues dans la routine diagnostique.

L'étude prévoit de caractériser d'un point de vue 'omique' environ 1 200 patients atteints de maladies neurodégénératives et affiliés à l'IRCCS Policlinico San Martino de Gênes et à la Fondation IRCCS Policlinico Cà Granda de Milan et à toute autre unité qui pourrait souhaiter participer à l'étude après approbation par le TEC compétent.

L'objectif de l'étude, pour les différentes pathologies d'intérêt, est d'identifier, par l'étude du génome, des variants monogéniques et polygéniques, rares et communs, à nucléotide unique (SNV) et/ou structurels (tels que CNV, insertions, translocations, inversions et insertions d'éléments mobiles (MEI)) qui pourraient être causaux ou conférer un risque accru de développer la maladie. De plus, l'intégration des données génomiques avec d'autres sciences 'omiques' permettra de corréler la présence de telles variations avec l'expression génique, protéique et métabolique, de délimiter différentes trajectoires de mécanismes moléculaires associés à la neurodégénérescence, leur impact sur la progression de la maladie et l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques.