Nauki omiczne w identyfikacji mechanizmów patogenetycznych i biomarkerów w chorobach neurodegeneracyjnych (NeurOmics)

Badanie ma na celu wykorzystanie nauk 'omicznych', stosując najbardziej zaawansowane technologie obecnie dostępne, w celu identyfikacji patogennych wariantów genomowych, białek i/lub zmienionych szlaków molekularnych w chorobach neurodegeneracyjnych oraz uzyskania nowej i pełniejszej charakterystyki osób dotkniętych badanymi chorobami neurodegeneracyjnymi. Dzięki integracji danych genomowych, ekspresji genów (transkryptomicznych i epigenomicznych), białkowych i metabolicznych oraz danych klinicznych, badanie ma również na celu identyfikację nowych markerów do diagnozy, rokowania, również w zakresie odpowiedzi na terapię, oraz monitorowania chorób neurodegeneracyjnych.

Badanie obejmuje rekrutację co najmniej 1200 osób z chorobą neurodegeneracyjną.

Populacja badana składa się z pacjentów z chorobami neurodegeneracyjnymi z IRCCS Ospedale Policlinico San Martino w Genui oraz Fundacji IRCCS Cà Granda Ospedale Maggiore Policlinico w Mediolanie i ewentualnych innych jednostek, które mogą chcieć uczestniczyć w badaniu po zatwierdzeniu przez Komisję Etyczną. Kandydaci kwalifikujący się do rekrutacji zostaną zidentyfikowani podczas wizyt ambulatoryjnych zaplanowanych w ramach kontroli klinicznych w dwóch ośrodkach. Podczas tych wizyt pacjentom zostanie zaproponowany udział w badaniu. Diagnoza kliniczna zostanie postawiona zgodnie z kryteriami stosowanymi dla każdego podtypu choroby neurodegeneracyjnej i szczegółowo opisana w projekcie.

Od pacjentów zakwalifikowanych do badania zostaną pobrane różne rodzaje próbek biologicznych, głównie krew obwodowa, ślina (jeśli pobranie krwi nie jest możliwe) oraz mocz. Próbki zostaną pobrane podczas rutynowego pobierania podczas jednej z wizyt kontrolnych.

Analizy 'omiczne', głównie genomika, transkryptomika, epigenomika itp., zostaną przeprowadzone na pobranych próbkach biologicznych i/lub ich pochodnych.

Analizy mogą być przeprowadzone na materiale genetycznym wyizolowanym z pełnej krwi obwodowej, śliny, PBMC (mononuklearne komórki krwi obwodowej), osocza, surowicy i/lub moczu.

Alikwot DNA, pseudonimizowany, zostanie przesłany do Laboratoriów Włoskiego Instytutu Technologii (Genua i Aosta) w celu przeprowadzenia analizy genomu i innych analiz omicznych.

Alikwot DNA i pochodne z pobrania (surowica, osocze, PBMC) będą przechowywane w Biobanku Ośrodków Klinicznych, do których są kierowani pacjenci.

Badanie nie przewiduje stosowania leków eksperymentalnych ani innych interwencji u pacjenta, poza tymi przewidzianymi w rutynowej diagnostyce.

Badanie planuje scharakteryzowanie z punktu widzenia 'omicznego' około 1200 pacjentów dotkniętych chorobami neurodegeneracyjnymi i przychodzących do IRCCS Policlinico San Martino w Genui oraz do Fondazione IRCCS Policlinico Cà Granda w Mediolanie i ewentualnych innych Jednostek, które mogą chcieć uczestniczyć w badaniu po zatwierdzeniu przez właściwą Komisję Etyczną.

Celem badania, dla różnych patologii będących przedmiotem zainteresowania, jest identyfikacja poprzez badanie genomu, wariantów pojedynczych i poligenowych, zarówno rzadkich, jak i częstych, pojedynczych nukleotydów (SNV) i/lub strukturalnych (takich jak CNV, insercje, translokacje, inwersje i insercje elementów ruchomych (MEI)), które mogą być przyczyną lub zwiększać ryzyko rozwoju choroby. Ponadto, integracja danych genomowych z innymi naukami 'omicznymi' umożliwi skorelowanie obecności takich wariacji z ekspresją genów, białek i metabolizmu, aby określić różne trajektorie mechanizmów molekularnych związanych z neurodegeneracją, ich wpływ na postęp choroby oraz identyfikację nowych celów terapeutycznych.