Omic-vitenskaper for identifisering av patogenetiske mekanismer og biomarkører i nevrodegenerative sykdommer (NeurOmics)

Studiet har som mål å bruke 'omics'-vitenskaper, ved å bruke de mest avanserte teknologiene som for tiden er tilgjengelige, for å identifisere patogene genomiske varianter, proteiner og/eller endrede molekylære veier i neurodegenerative sykdommer og for å oppnå en ny og mer komplett karakterisering av personer som er rammet av de neurodegenerative sykdommene som studeres. Takket være integrasjonen av genomiske, genuttrykks (transkriptomiske og epigenomiske), protein- og metabolske data og kliniske data, har studiet også som mål å identifisere nye markører for diagnostisering, prognose, også når det gjelder respons på terapi, og overvåking av neurodegenerative sykdommer.

Studiet innebærer rekruttering av minst 1200 personer med neurodegenerative sykdommer.

Studiepopulasjonen består av pasienter med neurodegenerative sykdommer fra IRCCS Ospedale Policlinico San Martino i Genova og IRCCS Cà Granda Ospedale Maggiore Policlinico Foundation i Milano og eventuelle andre enheter som kan ønske å delta i studiet etter godkjenning fra etisk komité. Personer som er kvalifisert for rekruttering vil bli identifisert under polikliniske besøk planlagt under de kliniske kontrollene ved de to sentrene. Under disse besøkene vil pasienter bli forespurt om å delta i studiet. Den kliniske diagnosen vil bli stilt i henhold til kriteriene som brukes for hver undertype av nevrodegenerativ sykdom og detaljert i prosjektet.

Forskjellige typer biologiske prøver vil bli samlet inn fra pasienter som er inkludert i studiet, hovedsakelig perifert blod, spytt (hvis blodprøvetaking ikke er mulig) og urin. Prøver vil bli tatt under rutinemessig prøvetaking ved ett av oppfølgingsbesøkene.

Omics-analyser, hovedsakelig genomikk, transkriptomikk, epigenomikk osv., vil bli utført på de innsamlede biologiske prøvene og/eller deres derivater.

Analyser kan utføres på genetisk materiale ekstrahert fra helt perifert blod, spytt, PBMC (perifere mononukleære blodceller), plasma, serum og/eller urin.

En andel DNA, pseudonymisert, vil bli sendt til laboratoriene ved det italienske teknologiinstituttet (Genova og Aosta) for genom- og andre omics-analyser.

En andel DNA og derivatene fra innsamlingen (serum, plasma, PBMC) vil bli lagret i biobanken til de kliniske sentrene som pasientene er henvist til.

Studiet forutser ikke bruk av eksperimentelle legemidler eller andre inngrep på pasienten, bortsett fra de som er forutsatt i den diagnostiske rutinen.

Studiet planlegger å karakterisere fra et 'omics'-synspunkt omtrent 1200 pasienter som er rammet av neurodegenerative sykdommer og tilknyttet IRCCS Policlinico San Martino i Genova og Fondazione IRCCS Policlinico Cà Granda i Milano og eventuelle andre enheter som kan ønske å delta i studiet etter godkjenning fra relevant etisk komité.

Målet med studiet, for de forskjellige patologiene av interesse, er å identifisere, gjennom studiet av genomet, enkle og polygene varianter, både sjeldne og vanlige, enkeltnukleotid (SNV) og/eller strukturelle (som CNV, innsettinger, translokasjoner, inversjoner og mobile element innsettinger (MEI)) som kan være årsak eller gi en økt risiko for å utvikle sykdommen. Dessuten vil integrasjonen av genomiske data med andre 'omics'-vitenskaper gjøre det mulig å korrelere tilstedeværelsen av slike variasjoner med gen-, protein- og metabolsk uttrykk, for å skissere forskjellige baner for molekylære mekanismer assosiert med nevrodegenerasjon, deres innvirkning på sykdomsprogresjon og identifisering av nye terapeutiske mål.