Exom- und Genomanalyse zur Aufklärung genetischer Ätiologien und Populationsmerkmale in der Plain Community

Das langfristige Ziel dieses Vorschlags ist es, ein translationales Medizinprogramm für die Amish- und Mennonitengemeinschaften alter Ordnung einzurichten, das ihren Mitgliedern mit sinkenden Kosten und effektiven Diagnosestrategien zugänglich ist, und die erhaltenen genetischen Informationen zu nutzen, um die genetischen Kräfte besser zu verstehen und Risiken für die Gesundheit dieser Bevölkerungsgruppen. Als Brücke dazu wird die Sequenzierungstechnologie der nächsten Generation verwendet, um genetische Defekte in Amish-Familien/Personen alter Ordnung zu identifizieren, die ein klinisches Bild haben, das auf eine Mendelsche Störung hindeutet, aber mit unbekannter Diagnose. Die Forscher planen die Entwicklung zielgerichteter analytischer NGS-Panels, die für den allgemeinen Einsatz im klinischen Umfeld beim Umgang mit Patienten und Familien von Plain Communities optimiert sind und zu besseren und schnelleren klinischen Interventionen und einer Verbesserung der Ergebnisse führen. Die Studie beinhaltet auch die Verwendung der Gesamtgenomsequenzierung für eine Plattform zur Entdeckung mutierter Allele, um neuartige genetische Risiken in dieser Population zu identifizieren, die bei Patienten noch nicht identifiziert wurden, und um diese Plattform zu verwenden, um genetische Unterschiede in Amish-Gemeinschaften alter Ordnung in ganz Pennsylvania und letztendlich im ganzen Land zu beschreiben . Mit WGS wird die Populationsgenetik analysiert, indem die Verteilung genetischer Varianten zwischen den verschiedenen Amish-Gemeinschaften verglichen und diese mit ihren europäischen Abstammungsvarianten verglichen werden, die im 1000-Genomprojekt verfügbar sind, um den Einfluss der Gründerselektion und der genetischen Drift in diesen Populationen zu untersuchen .