Efectos de la fenoximetilpenicilina, la amoxicilina y la amoxicilina-ácido clavulánico en la microbiota intestinal (EPAAC)

Antecedentes: el fundamento de este proyecto es que diferentes antibióticos tienen efectos variables sobre la microbiota intestinal, lo que tiene implicaciones clínicas. Para investigar el daño colateral relativo durante el tratamiento con diferentes antibióticos se necesita un ensayo aleatorio. Se requiere un muestreo repetido durante un período de 1 año para capturar la perturbación prolongada y el tiempo hasta una microbiota restaurada. Para examinar fácilmente los efectos de los antibióticos, los voluntarios sanos son ideales para el estudio, ya que es muy probable que su microbiota sea normal en el momento de la inclusión. También tienen un bajo riesgo de encontrar otros factores durante el seguimiento que afectarán la composición de las bacterias intestinales.

Objetivo: El propósito del estudio es determinar: (1) la composición de la microbiota intestinal y la prevalencia de bacterias resistentes y genes de resistencia antes y hasta 1 año después del tratamiento con antibióticos, y (2) las diferencias en la microbiota después del tratamiento con antibióticos; fenoximetilpenicilina, amoxicilina y amoxicilina-ácido clavulánico respectivamente en comparación con ningún tratamiento.

Método: El estudio se lleva a cabo en el Departamento de Enfermedades Infecciosas del Hospital Universitario de Uppsala. Se reclutará un total de 120 voluntarios sanos para el estudio. Se aleatorizan a 5 días de tratamiento con fenoximetilpenicilina, amoxicilina o amoxicilina-clavulánico, oa ningún tratamiento antibiótico. Los sujetos envían muestras fecales en ocho momentos diferentes; al inicio del estudio (antes del tratamiento), inmediatamente, una semana y 1, 3, 6, 12 y 24 meses después de finalizar el tratamiento. En total, los sujetos proporcionarán 8 muestras fecales durante el curso del estudio. Se recogerán y analizarán un total de 960 muestras fecales.

Cada sujeto enviará dos muestras fecales en cada momento. Una muestra se congelará en DNA-shield y se entregará a Scilifelab para el análisis de la microbiota intestinal y la secuenciación metagenómica para detectar genes resistentes a los antibióticos. La otra muestra fecal se entregará al departamento de Microbiología para su análisis con métodos fenotípicos (culturómicos) para detectar la resistencia. genes y bacterias resistentes.

Estadísticas: La recopilación de datos y estadísticas será principalmente descriptiva. Analizaremos la microbiota intestinal y la prevalencia de genes de resistencia en los sujetos antes e inmediatamente después del tratamiento con antibióticos, y luego monitorearemos la composición (diversidad) de la microbiota intestinal, bacterias resistentes y genes de resistencia 1 semana, 1, 3, 6, 12 y 24 meses después de finalizado el tratamiento. La diversidad se analizará mediante metagenómica (escopeta) y se utiliza como variable para comparar el grado de daño colateral sobre la microbiota intestinal con diferentes antibióticos, y comparar la microbiota intestinal antes y después del tratamiento antibiótico en un mismo individuo. La diversidad de la microbiota intestinal en la muestra fecal 1 constituirá la línea base. Se realizarán cálculos estadísticos específicos sobre las diferencias entre los grupos de tratamiento y el género en lo que respecta a la microbiota intestinal, la resistencia y los efectos secundarios, según los resultados, que no se pueden predecir de antemano.

Criterios de valoración y resultados: El criterio principal de valoración es la diversidad y composición de la microbiota intestinal, la prevalencia de bacterias gramnegativas multirresistentes en cultivos de detección y la prevalencia de genes de resistencia a antibióticos en las heces antes y hasta 2 años después del tratamiento con antibióticos.

Los resultados pueden usarse como base para orientar la elección del antibiótico para las infecciones pulmonares (neumonía) hacia aquellos antibióticos que tienen el menor riesgo de alterar la microbiota intestinal y generar resistencia.