Влияние феноксиметилпенициллина, амоксициллина и амоксициллин-клавулановой кислоты на микробиоту кишечника (EPAAC)

Справочная информация. Смысл этого проекта заключается в том, что разные антибиотики по-разному влияют на кишечную микробиоту, что имеет клинические последствия. Для изучения относительного побочного повреждения при лечении различными антибиотиками необходимо рандомизированное исследование. Повторный отбор проб в течение 1 года необходим для регистрации продолжительных нарушений и времени до восстановления микробиоты. Чтобы легко изучить эффекты антибиотиков, здоровые добровольцы идеально подходят для исследования, поскольку их микробиота, скорее всего, будет нормальной на момент включения. У них также низкий риск столкнуться с другими факторами во время последующего наблюдения, которые повлияют на состав кишечных бактерий.

Цель: Целью исследования является определение: (1) состава кишечной микробиоты и распространенности устойчивых бактерий и генов резистентности до и в течение 1 года после лечения антибиотиками и (2) различий в микробиоте после лечения антибиотиками; феноксиметилпенициллин, амоксициллин и амоксициллин-клавулановая кислота соответственно по сравнению с отсутствием лечения.

Метод: исследование проводится в отделении инфекционных заболеваний Университетской больницы Уппсалы. Всего для исследования будет привлечено 120 здоровых добровольцев. Они рандомизированы для 5-дневного лечения феноксиметилпенициллином, амоксициллином или амоксициллином-клавулановой кислотой или для отсутствия лечения антибиотиками. Субъекты сдают образцы фекалий в восемь различных моментов времени; в начале исследования (до лечения), сразу, через одну неделю и через 1, 3, 6, 12 и 24 месяца после завершения лечения. Всего в ходе исследования испытуемые предоставят 8 образцов фекалий. Всего будет собрано и проанализировано 960 проб фекалий.

Каждый субъект будет представлять два образца фекалий в каждый момент времени. Один образец будет заморожен в ДНК-щите и доставлен в Scilifelab для анализа кишечной микробиоты и метагеномного секвенирования для выявления генов, устойчивых к антибиотикам. генов и резистентных бактерий.

Статистика. Сбор данных и статистики будет в первую очередь носить описательный характер. Мы проанализируем кишечную микробиоту и распространенность генов резистентности у субъектов до и сразу после лечения антибиотиками, а затем проведем мониторинг состава (разнообразия) кишечной микробиоты, резистентных бактерий и генов резистентности через 1 неделю, 1, 3, 6, через 12 и 24 месяца после завершения лечения. Разнообразие будет проанализировано с использованием метагеномики (шотган) и использовано в качестве переменной для сравнения степени побочного повреждения кишечной микробиоты при применении различных антибиотиков, а также для сравнения кишечной микробиоты до и после лечения антибиотиками у одного и того же человека. Разнообразие кишечной микробиоты в образце фекалий 1 будет составлять исходный уровень. Целевые статистические расчеты различий между группами лечения и полом в отношении микробиоты кишечника, резистентности и побочных эффектов будут проводиться в зависимости от исходов, которые невозможно предсказать заранее.

Конечные точки и результаты. Первичной конечной точкой является разнообразие и состав кишечной микробиоты, распространенность полирезистентных грамотрицательных бактерий в скрининговых культурах и распространенность генов устойчивости к антибиотикам в фекалиях до и в течение 2 лет после лечения антибиотиками.

Результаты могут быть использованы в качестве основы для выбора антибиотика для лечения легочных инфекций (пневмонии) в пользу тех антибиотиков, которые имеют наименьший риск нарушения микробиоты кишечника и развития резистентности.