A fenoximetilpenicillin, az amoxicillin és az amoxicillin-klavulánsav hatása a bél mikrobiotára (EPAAC)

Háttér: A projekt mögött az az indoklás áll, hogy a különböző antibiotikumok eltérő hatással vannak a bél mikrobiotára, aminek klinikai vonatkozásai is vannak. A különböző antibiotikumokkal végzett kezelés során fellépő relatív járulékos károsodások vizsgálatához randomizált vizsgálatra van szükség. Egy éven keresztül ismételt mintavétel szükséges a hosszan tartó zavarás és a mikrobióta helyreállításáig eltelt idő rögzítéséhez. Az antibiotikum hatások könnyű vizsgálatához az egészséges önkéntesek ideálisak a vizsgálathoz, mivel a mikrobiótájuk valószínűleg normális a felvételkor. Alacsony a kockázata annak, hogy a nyomon követés során olyan egyéb tényezőkkel találkoznak, amelyek befolyásolják a bélbaktériumok összetételét.

Célja: A vizsgálat célja: (1) a bélmikrobióta összetételének, valamint a rezisztens baktériumok és rezisztencia gének prevalenciájának meghatározása az antibiotikum kezelést megelőzően és azt követően legfeljebb 1 évig, valamint (2) a mikrobióta különbségei az antibiotikum kezelést követően; fenoximetilpenicillin, amoxicillin és amoxicillin-klavulánsav, összehasonlítva a kezelés nélkül.

Módszer: A vizsgálatot az Uppsalai Egyetemi Kórház fertőző betegségek osztályán végezték. Összesen 120 egészséges önkéntest vesznek fel a vizsgálatba. Véletlenszerűen 5 napos fenoximetilpenicillinnel, amoxicillinnel vagy amoxicillin-klavulánsavval végzett kezelésre vagy antibiotikum kezelés nélkülire osztják őket. Az alanyok nyolc különböző időpontban nyújtanak be székletmintát; a vizsgálat kezdetén (a kezelés előtt), azonnal, egy héttel és 1, 3, 6, 12 és 24 hónappal a kezelés befejezése után. Az alanyok összesen 8 székletmintát fognak adni a vizsgálat során. Összesen 960 székletmintát gyűjtenek és elemeznek.

Minden alany minden időpontban két székletmintát küld be. Az egyik mintát DNS-pajzsban lefagyasztják, és a Scilifelabba szállítják a bélmikrobióta elemzésére és a metagenomikus szekvenálásra az antibiotikum-rezisztens gének kimutatására. A másik székletmintát a mikrobiológiai osztályra szállítják fenotípusos módszerekkel (kulturomika) történő elemzésre a rezisztens kimutatására. gének és rezisztens baktériumok.

Statisztika: Az adatok és statisztikák összeállítása elsősorban leíró jellegű. Elemezzük a bélmikrobiótát és a rezisztencia gének prevalenciáját az alanyokban az antibiotikum kezelés előtt és közvetlenül utána, majd monitorozzuk a bélmikrobióta, rezisztens baktériumok és rezisztencia gének összetételét (diverzitását) 1 hét, 1, 3, 6, 12 és 24 hónappal a kezelés befejezése után. A diverzitást metagenomika (shotgun) segítségével elemzik, és változóként használják a bélmikrobióta járulékos károsodásának mértékének összehasonlítására a különböző antibiotikumokkal, valamint a bélmikrobióta összehasonlítására az antibiotikum-kezelés előtt és után ugyanabban az egyedben. Az 1. székletmintában lévő bélmikrobióta sokfélesége képezi az alapvonalat. Célzott statisztikai számításokat végeznek a kezelési csoportok és a nemek közötti különbségekre vonatkozóan a bélmikrobióta, a rezisztencia és a mellékhatások tekintetében az előre nem jelezhető kimenetel függvényében.

Végpontok és eredmények: Az elsődleges végpont a bélmikrobióta sokfélesége és összetétele, a multirezisztens Gram-negatív baktériumok prevalenciája a szűrési tenyészetekben, valamint az antibiotikum-rezisztencia gének előfordulása a székletben az antibiotikumos kezelés előtt és 2 évig.

Az eredmények alapul szolgálhatnak a tüdőfertőzések (tüdőgyulladás) antibiotikumának kiválasztásához azon antibiotikumok irányába, amelyeknél a legkisebb a bél mikrobiota megzavarásának és rezisztencia kialakulásának kockázata.