Efeitos da Fenoximetilpenicilina, Amoxicilina e Amoxicilina-Ácido Clavulânico na Microbiota Intestinal (EPAAC)

Antecedentes: A lógica por trás deste projeto é que diferentes antibióticos têm efeitos variados na microbiota intestinal, o que tem implicações clínicas. Para investigar o dano colateral relativo durante o tratamento com diferentes antibióticos, é necessário um estudo randomizado. A amostragem repetida durante um período de 1 ano é necessária para capturar perturbações prolongadas e o tempo para uma microbiota restaurada. Para examinar prontamente os efeitos dos antibióticos, voluntários saudáveis ​​são ideais para o estudo, pois é mais provável que sua microbiota seja normal na inclusão. Eles também têm um baixo risco de encontrar outros fatores durante o acompanhamento que afetarão a composição das bactérias intestinais.

Objetivo: O objetivo do estudo é determinar: (1) composição da microbiota intestinal e prevalência de bactérias resistentes e genes de resistência antes e até 1 ano após o tratamento com antibióticos e (2) diferenças na microbiota após o tratamento com antibióticos; fenoximetilpenicilina, amoxicilina e amoxicilina-ácido clavulânico, respectivamente, em comparação com nenhum tratamento.

Método: O estudo é conduzido no Departamento de Doenças Infecciosas do Hospital Universitário de Uppsala. Um total de 120 voluntários saudáveis ​​serão recrutados para o estudo. Eles são randomizados para tratamento de 5 dias com fenoximetilpenicilina, amoxicilina ou amoxicilina-ácido clavulânico, ou nenhum tratamento antibiótico. Os indivíduos enviam amostras fecais em oito pontos de tempo diferentes; no início do estudo (antes do tratamento), imediatamente, uma semana e 1, 3, 6, 12 e 24 meses após o término do tratamento. Ao todo, os sujeitos fornecerão 8 amostras fecais durante o curso do estudo. Um total de 960 amostras fecais serão coletadas e analisadas.

Cada sujeito enviará duas amostras fecais em cada ponto de tempo. Uma amostra será congelada em escudo de DNA e entregue ao Scilifelab para análise da microbiota intestinal e sequenciamento metagenômico para detectar genes resistentes a antibióticos. A outra amostra fecal será entregue ao departamento de Microbiologia para análise com métodos fenotípicos (culturômica) para detectar resistência genes e bactérias resistentes.

Estatísticas: A compilação de dados e estatísticas será principalmente descritiva. Analisaremos a microbiota intestinal e a prevalência de genes de resistência nos indivíduos antes e imediatamente após o tratamento com antibióticos e, em seguida, monitoraremos a composição (diversidade) da microbiota intestinal, bactérias resistentes e genes de resistência 1 semana, 1, 3, 6, 12 e 24 meses após o término do tratamento. A diversidade será analisada por metagenômica (shotgun) e é utilizada como variável para comparar o grau de dano colateral na microbiota intestinal com diferentes antibióticos, e para comparar a microbiota intestinal antes e depois da antibioticoterapia no mesmo indivíduo. A diversidade da microbiota intestinal na amostra fecal 1 constituirá a linha de base. Cálculos estatísticos direcionados sobre diferenças entre grupos de tratamento e gênero em relação à microbiota intestinal, resistência e efeitos colaterais serão realizados dependendo dos resultados, que não podem ser previstos com antecedência.

Pontos finais e resultados: O ponto final primário é a diversidade e composição da microbiota intestinal, a prevalência de bactérias Gram-negativas multirresistentes em culturas de triagem e a prevalência de genes de resistência a antibióticos nas fezes antes e até 2 anos após o tratamento com antibióticos.

Os resultados podem ser usados ​​como base para direcionar a escolha do antibiótico para infecções pulmonares (pneumonia) para aqueles antibióticos com menor risco de perturbar a microbiota intestinal e levar à resistência.