Marcadores moleculares en cánceres y precánceres (MOCA) (MOCA)

Es en este contexto que la prescripción de terapias dirigidas está ahora condicionada por la identificación de anomalías genéticas específicas en el tumor. Como tal, se ha demostrado que los inhibidores de la quinasa son efectivos en pacientes con cáncer de pulmón de células no pequeñas o melanoma metastásico cuando se identifican mutaciones en el receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR) o BRAF, respectivamente. Por el contrario, la identificación de la mutación KRAS o NRAS en los cánceres de colon metastásicos predice la resistencia a las terapias basadas en anticuerpos anti-EGFR. En estas condiciones, la prescripción de estas terapias dirigidas proporciona un gran beneficio a los pacientes. La eficacia de estas terapias está relacionada con el hecho de que las mutaciones diana son mutaciones "conductoras" que emiten una poderosa señal oncogénica. Estas mutaciones también son un 'talón de Aquiles' para la célula tumoral, que se vuelve hipersensible a ciertos inhibidores de la tirosina quinasa. Sin embargo, el escape del tumor de las terapias dirigidas está bien documentado después de unos meses de tratamiento. Aquí nuevamente, el análisis molecular de tumores en progresión ha revelado heterogeneidad intratumoral con, en particular, la aparición de mutaciones secundarias responsables, al menos en parte, del desarrollo de resistencia. De ahí la importancia de caracterizar el perfil molecular de los tumores tanto durante la historia natural de la enfermedad como en los pacientes tratados para ofrecerles un seguimiento adecuado.

Entre los 170 virus del papiloma humano (VPH) descritos en 2013, una docena de los llamados VPH oncogénicos o de alto riesgo son responsables de todos los cánceres de cuello uterino, casi todos los cánceres anales, la mitad de los cánceres de vulva y vagina y ciertos cánceres del aparato digestivo superior. tracto. Si bien la infección por VPH es necesaria para que se desarrolle el cáncer, no es suficiente y los cofactores que promueven la infección persistente aumentan el riesgo de desarrollar lesiones precancerosas y luego cánceres. Así, la historia natural de la infección por estos virus está íntimamente ligada a la del cáncer que inducen. Los mecanismos moleculares de la carcinogénesis/transformación relacionada con el VPH están bien descritos. Es la acción combinada de dos proteínas virales (E6 y E7) sobre los dos represores tumorales p53 y pRb lo que inicialmente levanta los mecanismos intrínsecos de senescencia replicativa de la célula (que adquiere así la capacidad de dividirse indefinidamente), y luego conduce gradualmente a su transformación. Sin embargo, los determinantes que hacen que una célula infectada se inmortalice y luego se transforme siguen siendo poco conocidos y la gran mayoría de las infecciones se eliminan espontáneamente dentro de los 10 a 18 meses posteriores al desarrollo de respuestas inmunitarias efectivas. Es probable que los cofactores del huésped (inmunosupresión, factores genéticos), virales y ambientales (tabaquismo, anticonceptivos orales) influyan en el proceso de carcinogénesis. Por lo tanto, se reconoce que HPV16 es el genotipo más cancerígeno. Es el VPH de mayor persistencia y está asociado con el mayor riesgo de desarrollar precáncer o cáncer de cuello uterino. Se ha demostrado que los cánceres de cuello uterino asociados con HPV16 (o HPV18/45) tienen un peor pronóstico que aquellos infectados con otros genotipos. Por el contrario, en los cánceres del tracto aerodigestivo superior, los inducidos por un VPH (en más del 95% de los casos es el VPH16), tienen mejor pronóstico que los no inducidos por un virus. Por lo tanto, el genotipado de un tumor para identificar el tipo de VPH implicado podría ser de interés clínico, especialmente en función de la localización del tumor.

El manejo terapéutico de los pacientes con cánceres asociados al VPH generalmente consiste en una combinación de cirugía y/o radioquimioterapia (cis-platino, 5-fluorouracilo) dependiendo de la extensión del tumor. Para los cánceres anales, el trabajo de Bisonne mostró que la adición de una tercera molécula de quimioterapia (taxano) era muy prometedora, ya que permitía remisiones no observadas anteriormente. Las razones de tal eficacia no están claras, ni existe un predictor de respuesta al tratamiento.

Los análisis de genética molecular se llevan a cabo utilizando varios tipos de muestras, como células de frotis o punciones, biopsias, piezas quirúrgicas y numerosos fluidos, como orina, líquido cefalorraquídeo o sangre. Si bien el estándar para el diagnóstico molecular actual es analizar la muestra del tumor, se considera ampliamente el uso de una "biopsia líquida" de una simple muestra de sangre. De hecho, ahora se ha demostrado que los cánceres liberan ADN que se puede detectar en la sangre de los pacientes, este es el ADN tumoral circulante. Por lo tanto, es posible diagnosticar o realizar un seguimiento biológico de los cánceres (p. antes/después del tratamiento) de una biopsia líquida. Sin embargo, el estudio del ADN tumoral circulante aún enfrenta algunas dificultades. En primer lugar, la concentración de ADN circulante es muy baja, del orden de unas pocas decenas de nanogramos por ml de plasma. Además, la gran mayoría del ADN circulante se compone de ADN liberado de células normales y la proporción de ADN tumoral circulante es solo del 1 al 4% del ADN circulante. Finalmente, el ADN tumoral circulante generalmente está fragmentado (<200 pb). Para superar estas limitaciones, es necesario utilizar técnicas de alta sensibilidad, tanto para medir la concentración de ADN circulante como para buscar alteraciones moleculares características del tumor. En este sentido, el análisis del ADN tumoral circulante aporta una nueva dimensión al tratamiento de los pacientes con cáncer. Basándose en el análisis del ADN tumoral circulante, es posible orientar el tratamiento hacia una terapia dirigida en ausencia de una biopsia de tejido, evaluar la eficacia de un tratamiento, seguir la evolución de la enfermedad e incluso identificar la recurrencia. El análisis del ADN del tumor circulante también proporciona una instantánea de todas las alteraciones genéticas en el tumor (primarias y metastásicas) que reflejan la heterogeneidad del tumor, mientras que los resultados de la biopsia son solo representativos del sitio del que se tomaron. Para los cánceres asociados con el VPH, la detección del genoma viral a partir de biopsias líquidas también es factible en gran medida. Sin embargo, todavía se necesitan estudios hoy en día no solo para validar el principio de la biopsia líquida en los cánceres, sino también para aclarar su utilidad clínica. Resultados recientes han demostrado que los cambios en la carga viral del VPH en plasma predicen la respuesta al tratamiento.

Desde la secuenciación del genoma humano en 2001, las técnicas de análisis del ADN han progresado enormemente y las nuevas tecnologías de 'next generation sequencing' (NGS) permiten el análisis simultáneo de un número muy elevado de genes (varios cientos) de varias decenas de muestras diferentes. Estas capacidades de secuenciación permiten explorar rápidamente una gran cantidad de anomalías genéticas a un costo menor. Existen datos sobre anomalías genéticas en los cánceres asociados con el VPH y se ha informado recientemente que los VPH también están sujetos a variaciones genéticas durante el proceso de carcinogénesis.

Los avances tecnológicos en biología molecular (secuenciación de alto rendimiento, PCR digital, ADN tumoral circulante) ahora permiten describir con mucha precisión cualquier modificación genética o epigenética que pueda constituir un potencial biomarcador. Una mejor descripción de estas modificaciones genéticas en muestras secuenciales durante la transición entre un estado normal, un precáncer y un cáncer en función del tiempo permitirá desarrollar, por un lado, modelos que predigan la aparición de cánceres y, por otro Por otro lado, herramientas innovadoras para el diagnóstico y estratificación del riesgo de desarrollar un cáncer. Será posible proponer intervenciones médicas tempranas solo para aquellos pacientes que las necesiten. El estudio de las anomalías genéticas en pacientes tratados por cáncer permitirá proponer herramientas innovadoras para el seguimiento de la enfermedad, la predicción de la recaída o la cura o la identificación de nuevas dianas terapéuticas o vacunales.

Es por esto que los investigadores quieren poder recolectar muestras biológicas de diversa índole (frotis, biopsias, fluidos biológicos, etc.), ya sea que hayan sido tomadas en el contexto de la atención o almacenadas en colecciones declaradas (bibliotecas de tumores, por ejemplo) . Estas muestras se recogerán y almacenarán en el Hospital Universitario de Besançon en forma de colección (colección MOCA) que se asociará con datos clínicos. Luego, los investigadores podrán construir cohortes homogéneas de pacientes a partir de esta colección a partir de la cual los investigadores pueden estudiar biomarcadores teranósticos.