Hengitysteiden mikrobiomimuutokset vakavasti sairaiden lapsipotilaiden keinotekoisen hengitysteiden vaihdon jälkeen.

Keinotekoiset hengitystiet, kuten endotrakeaaliset putket ja trakeostomiat, lasten ja vastasyntyneiden tehohoitoyksiköissä (PICU, NICU, vastaavasti) pelastavat muun muassa hengitysvajauksesta kärsivien potilaiden hengen. Nämä laitteet eivät ole ilman infektioriskiä – ventilaattoriin liittyvät infektiot (VAI), nimittäin ventilaattoriin liittyvä keuhkokuume (VAP) ja ventilaattoriin liittyvä trakeiitti (VAT), ovat yleisiä. Epäillyn VAI-hoidon osuus lasten tehohoitoyksikön (PICU) antibioottien käytöstä on lähes puolet. VAI voi edustaa jatkumoa henkitorven kolonisaatiosta, etenemisestä trakeobronkiaaliseen tulehdukseen ja sitten keuhkokuumeeseen. Näiden hengitysteiden kolonisaatio on yleistä, eikä bakteerien kasvu välttämättä tarkoita kliinisesti merkittävää infektiota. Trakeostomiat, jotka ovat krooniseen käyttöön tarkoitettuja keinotekoisia hengitysteitä, vaihdetaan rutiininomaisesti puolikuukausittain tai kuukausittain, osittain bakteerien biofilmin muodostumisen häiritsemiseksi, mikä auttaa bakteerien kolonisaatiossa ja ehkä infektiossa. Kun trakeostomiapotilaita otetaan hoitoon akuutin kroonisen hengitysvajauksen tai infektion vuoksi, nämä keinotekoiset hengitystiet vaihdetaan myös rutiininomaisesti joissakin laitoksissa. On kuitenkin edelleen kriittinen tarve ymmärtää, kuinka keinotekoinen hengitysteiden vaihto muuttaa näiden potilaiden bakteeriympäristöä sairauden ja terveyden vuoksi. Tässä tutkimuksessa oletetaan, että tekohengitysteiden vaihtaminen muuttaa tekohengitysteiden mikrobiomia muuttamalla keinotekoisten hengitysteiden eri bakteerilajien mikrobien monimuotoisuutta ja suhteellista runsautta. Tässä tutkimuksessa kerätään mahdollisia henkitorven aspiraatioita potilailta, joilla on keinotekoiset hengitystiet. Seulomme ja rekisteröimme kaikki Cohen Children's Medical Centerin (CCMC) NICU- tai PICU-hoitoon otetut potilaat, joilla on trakeostomia ja jotka saavat henkitorven aspiraatiot joka toinen viikko hoidon aikana. Kun keinotekoisten hengitysteiden vaihto tapahtuu, henkitorven aspiraatteja saadaan myös päivinä ennen ja jälkeen. Henkitorven aspiraatteja saadaan rutiininomaisesti NICU:ssa ja PICU:ssa keinotekoisten hengitysteiden imulla, ja se on minimaalisen riskin toimintaa. Nämä näytteet tuodaan Feinstein Institutes for Medical Researchiin 16 s ribosomaalisen DNA:n (16srDNA) sekvensointia varten, mikä mahdollistaa tarkan ja herkän bakteeriflooran suhteellisen runsauden havaitsemisen ja luokittelun. Henkitorven aspiraatit jaetaan 4 ryhmään antibioottien käytön huomioon ottamiseksi viikon sisällä aspiraattien keräämisestä, mukaan lukien: (1) Ei antibiootteja, hengitysteiden muutos; (2) ei antibiootteja, ei hengitysteiden muutosta; (3) antibiootit, hengitysteiden muutos; (4) antibiootit, ei hengitysteiden muutosta. Lisäksi hankitaan kliinisiä ja epidemiologisia tietoja sähköisestä sairauskertomuksesta.