Parkinsonin taudille alttiusgeenit ja torjunta-aineet

Vaikka monet patofysiologiset reitit voivat olla osallisena PD:stä vastuussa olevaan hermoston rappeutumiseen, geneettiset tekijät määrittävät todennäköisesti yleisen hermoston rappeutumisen herkkyyden. On olemassa useita geenien geneettisiä polymorfismeja, kuten sytokromi p450 -superperhettä koodaavia geenejä, joita kutsutaan "herkkyysgeeneiksi". Ne eivät kuitenkaan yleensä riitä aiheuttamaan sairauksia, ellei henkilö kohtaa altistumista ympäristömyrkkylle: taudin aiheuttaa geeni-ympäristö vuorovaikutus. Siksi on välttämätöntä arvioida toksiinille altistuneiden yksilöiden geneettinen herkkyys. Testaamme geeniympäristön vuorovaikutushypoteesia suorittamalla epidemiologisen populaatiopohjaisen tapauskontrollitutkimuksen äskettäin diagnosoiduista PD-potilaista kolmesta Kalifornian maaseutukunnasta: Kernistä, Fresnosta ja Tularesta. Odotamme keräävämme neljän vuoden aikana 400 tapausta, jotka paikalliset neurologit, maataloustyöläisklinikat ja Parkinsonin säätiöt ovat lähettäneet meille. Kutakin tapausta varten valitaan satunnaisesti yksi populaatiokontrolli asuntolohkokartoista ja Medicaren tietokannoista ja lisäksi yksi koskematon sisaruskontrolli ja mahdollisuuksien mukaan sisarukset, joita asia koskee, jotta vältetään mahdolliset harhaluulot ja tehottomuudet, jotka liittyvät kunkin kontrollityypin käyttöön. . Kullekin tutkimuskohteelle johdetaan ympäristö- ja työperäinen torjunta-ainealtistusarvio käyttämällä Kalifornian torjunta-ainekäyttöraportoinnin (PUR) tietoja ja tietoja torjunta-aineiden levittämisestä viljelykasveille yhdessä satelliittikuvissa ja ilmakuvissa esitettyjen satokuvioiden kanssa. Lisäksi kaikille opiskelijoille tehdään laajat altistushaastattelut. Kolmiportaisessa lähestymistavassa geenien ja ympäristön vuorovaikutusten vaikutusten tutkimiseksi aiomme: 1) testata PD:n assosiaatiota (ja yhteyttä) valittuihin lokuksiin, jotka liittyvät PD:hen aikaisemmissa tutkimuksissa käyttämällä monialleelisia toistomarkkereita ja genotyypitystä; 2) assosiaatiotesti käyttämällä 50 kandidaattigeenin intrageenisiä yhden nukleotidin polymorfismeja (SNP:itä), jotka on järjestetty "PD-ryhmän" luomiseksi; ja 3) hyödyntää tulevia teknisiä mahdollisuuksia genominlaajuisten assosiaatioiden seulomiseen käyttäen array-teknologiaa skannatakseen 5 000-10 000 SNP:tä koko genomissa. Tietojen analysoinnissa käytetään hierarkkisia mallinnusmenetelmiä useiden vertailukysymysten huomioon ottamiseksi ja aiemman tiedon, kuten geenituotteiden ja kemikaalien vuorovaikutuksesta johtuvan lisääntyneen neurotoksisuuden, sisällyttämiseksi.