Choroba Parkinsona Geny podatności i pestycydy

Podczas gdy wiele szlaków patofizjologicznych może być zaangażowanych w neurodegenerację odpowiedzialną za PD, czynniki genetyczne prawdopodobnie determinują ogólną podatność na neurodegenerację. Istnieje wiele polimorfizmów genetycznych genów, takich jak te, które kodują nadrodzinę genów cytochromu p450 określanych jako „geny podatności”. Jednak na ogół nie wystarczają one do wywołania choroby, chyba że dana osoba zetknie się z toksyną środowiskową: choroba jest spowodowana interakcją gen-środowisko. Dlatego konieczna jest ocena podatności genetycznej osób narażonych na działanie toksyny. Przetestujemy hipotezę interakcji gen-środowisko, przeprowadzając epidemiologiczne populacyjne badanie kliniczno-kontrolne nowo zdiagnozowanych pacjentów z PD z trzech wiejskich hrabstw Kalifornii: Kern, Fresno i Tulare. W ciągu czterech lat spodziewamy się zebrać 400 przypadków skierowanych do nas przez lokalnych neurologów, kliniki dla robotników rolnych i fundacje zajmujące się chorobą Parkinsona. W każdym przypadku jedna kontrola populacji zostanie wybrana losowo z map działek mieszkalnych i baz danych Medicare, a ponadto jedna kontrola rodzeństwa nienaruszona i - jeśli to możliwe - rodzeństwo dotknięte chorobą, aby uniknąć potencjalnych uprzedzeń i nieefektywności nieodłącznie związanych z wykorzystaniem każdego rodzaju kontroli . Dla każdego podmiotu badania zostanie obliczone oszacowanie środowiskowego i zawodowego narażenia na pestycydy na podstawie danych raportowania stosowania pestycydów (PUR) stanu Kalifornia oraz informacji na temat stosowania pestycydów na uprawach w połączeniu z wzorcami upraw pokazanymi na zdjęciach satelitarnych i lotniczych; ponadto zostaną przeprowadzone obszerne wywiady ekspozycyjne ze wszystkimi badanymi osobami. W trójstopniowym podejściu do badania skutków interakcji gen-środowisko będziemy: 1) testować asocjację (i powiązanie) PD z wybranymi loci związanymi z PD we wcześniejszych badaniach z użyciem wieloallelicznych markerów powtórzeń i genotypowania; 2) test asocjacji przy użyciu wewnątrzgenowych polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP) 50 genów kandydujących ułożonych w celu utworzenia „macierzy PD”; oraz 3) wykorzystanie przyszłych możliwości technicznych do przeszukiwania powiązań w całym genomie przy użyciu technologii macierzowej do skanowania 5 000-10 000 SNP w całym genomie. Analiza danych będzie wykorzystywać hierarchiczne procedury modelowania, aby uwzględnić kwestie wielu porównań i uwzględnić wcześniejszą wiedzę, taką jak zwiększona neurotoksyczność spowodowana interakcją produktów genów i chemikaliów.