Pikatesti Staphylococcus aureuksen havaitsemiseksi veri- ja haavainfektioissa

Staphylococcus aureus (SA) on edelleen suuri patogeeni ihmisille, mikä aiheuttaa ihon, pehmytkudoksen, luun ja muiden elinten infektioita. Tämän organismin aiheuttama bakteremia on yleistä, ja sitä esiintyy usein lääketieteellisten toimenpiteiden, kuten suonensisäisten linjojen ja implantoitavien laitteiden yhteydessä. Metisilliiniresistentin S. aureuksen (MRSA) lisääntymisen myötä riippuvuus vankomysiinistä on lisääntynyt, lääkkeestä, jonka aktiivisuus metisilliinille herkkää S. aureusta (MSSA) vastaan ​​on huonompi kuin beetalaktaamit. Jos mikrobiologian laboratoriossa olisi kyky tunnistaa S. aureus (SA) ja sen lääkeherkkyys tunneissa eikä päivissä, kohdennettu hoito olisi mahdollista aikaisemmin sairauden kulkua. Lääkärit voisivat keskeyttää antibioottien käytön, kun SA:ta ei ole, keskeyttää muiden laajakirjoisten antibioottien käytön, kun SA:ta on läsnä, tai korvata empiirisen vankomysiinin nafsilliinilla, kun MSSA on tunnistettu.

GeneXpert-järjestelmä (Cepheid) havaitsee reaaliaikaisen PCR:n avulla geenit, jotka koodaavat Staphylococcus aureus -proteiinia A (SPA), stafylokokkikasettikromosomia (SCC) ja metisilliiniresistenssiä (mecA). Kaikki veriviljelmät, joissa on Gram-värjäys, joka paljastaa grampositiivisia kokkeja klustereissa, testataan PCR:llä sinä päivänä, jona niistä tuli positiivisia. Rutiininomaiseen bakteriologiseen viljelyyn toimitetut haavanäytteet testataan 48 tunnin kuluessa keräämisestä. Tuloksia verrataan standardin bakteriologisen viljelmän tuloksiin. Lisäksi poikkeamat GeneXpert- ja haavaviljelytulosten välillä tarkastellaan potilasasiakirjoissa sen varmistamiseksi, liittyykö antibioottien käyttöön näytteenottohetkellä vääriä positiivisia tuloksia, joissa haavaviljely ei tuota S. aureusta, mutta PCR havaitsee stafylokokin DNA:n komponentit.

Tutkimuksen toisessa vaiheessa haavanäytteiden ja veriviljelmien PCR-tulokset raportoidaan lääkäreille välittömästi reaktion päätyttyä. S. aureuksen varhaisen tunnistamisen kliininen vaikutus määritetään vertaamalla antibioottihoitoa ja kliinisiä tuloksia potilailla, joiden varhainen tunnistaminen oli saatavilla, niiden potilaiden potilaisiin, joille tavanomainen bakteriologinen viljely oli ainoa diagnostinen testi.