Rychlý test k detekci Staphylococcus aureus v infekcích krve a ran

Staphylococcus aureus (SA) zůstává hlavním patogenem pro lidské bytosti, způsobuje infekce kůže, měkkých tkání, kostí a dalších orgánů. Bakterémie způsobená tímto organismem je běžná a často se vyskytuje ve spojení s lékařskými zásahy, jako jsou intravenózní kanyly a implantabilní zařízení. S nárůstem methicilin-rezistentního S. aureus (MRSA) narůstá závislost na vankomycinu, léku, který je horší než beta-laktamy ve své aktivitě proti methicilin-susceptibilnímu S. aureus (MSSA). Pokud by mikrobiologická laboratoř byla schopna identifikovat S. aureus (SA) a jeho lékovou citlivost během několika hodin, nikoli dnů, byla by cílená terapie možná dříve v průběhu onemocnění. Klinici by byli schopni vysadit antibiotika, když SA není přítomná, vysadit jiná širokospektrá antibiotika, když je SA přítomná, nebo nahradit empirický vankomycin nafcilinem, když je identifikována MSSA.

Systém GeneXpert (Cepheid) využívá PCR v reálném čase k detekci genů, které kódují Staphylococcus aureus protein A (SPA), stafylokokový kazetový chromozom (SCC) a rezistenci na meticilin (mecA). Všechny hemokultury s Gramovým barvením odhalujícím Gram pozitivní koky v shlucích budou testovány pomocí PCR v den, kdy se staly pozitivními. Výtěry z ran odeslané k běžné bakteriologické kultivaci budou testovány do 48 hodin od odběru. Výsledky budou porovnány s výsledky standardní bakteriologické kultivace. Kromě toho budou v lékařském záznamu přezkoumány nesrovnalosti mezi výsledky GeneXpert a kultivace rány, aby se zjistilo, zda je použití antibiotik v době odběru vzorku spojeno s falešně pozitivními výsledky, kdy kultivace rány neposkytuje S. aureus, ale PCR detekuje stafylokokovou DNA komponenty.

Ve druhé fázi studie budou výsledky PCR pro výtěry z ran a hemokultury hlášeny lékařům ihned po dokončení reakce. Klinický dopad časné identifikace S. aureus bude stanoven srovnáním antibiotické léčby a klinického výsledku pacientů, u kterých byla časná identifikace dostupná, s pacienty, pro které byla konvenční bakteriologická kultivace jediným diagnostickým testem.