Henkilökohtainen genomiikka ennaltaehkäisevään kardiologiaan

Genomilaajuiset assosiaatiotutkimukset (GWAS) ovat tunnistaneet yli 1000 sairauteen liittyvää SNP:tä, joista monet liittyvät sydän- ja verisuonitauteihin (CVD). Useimmille perinteisille riskitekijöille on löydetty assosiaatioita, mukaan lukien lipidit, verenpaine/hypertensio, paino/painoindeksi, tupakointikäyttäytyminen ja diabetes. Tärkeää on, että GWAS on tunnistanut myös alttiusmuunnelmia sepelvaltimotaudille/sydäninfarktille (CHD/MI), joista monet ovat riippumattomia perinteisistä riskitekijöistä, eikä niitä siksi voida tällä hetkellä arvioida korvikemittauksilla. Ensimmäinen ja toistaiseksi vahvin näistä signaaleista löydettiin 9p21.3:sta ja ne liittyvät 20–40 %:n lisääntymiseen suhteellisessa sepelvaltimotaudin riskissä valkoihoisissa ja Itä-Aasiassa. Kuten useimmat tähän mennessä tunnistetut assosiaatiot, ei-koodaavan 9p21.3-kromosomaalisen alueen toiminta on edelleen epäselvää. Nämä markkerit ennustavat sairautta ja voivat vaatimattomalla tavalla parantaa uudelleenluokitteluindeksejä. Esimerkiksi aivan tuoreessa esimerkissä 13 SNP:tä, jotka aiemmin tunnistettiin GWAS:ssa CHD/MI:hen liittyviksi, sisällytettiin monilokusmalliin, jotta voidaan arvioida geneettisen riskin assosiaatio tapauskohtaiseen CHD/MI:hen useissa suurissa prospektiivisissä tutkimuksissa. Jopa sukuhistoriaan ja perinteisiin riskitekijöihin sopeutumisen jälkeen ylimmän kvintiilin yksilöillä oli 1,66 kertaa suurempi riski verrattuna alimman kvintiilin 36 henkilöihin. Keskitason riskipotilaiden uudelleenluokittelussa tapahtui merkittävä parannus. Näiden merkkien käytön ei ole vielä osoitettu ylittävän malleja, joihin kuuluvat perinteiset riskitekijät ja sukuhistoria. Tämä puute johtuu luultavasti siitä, että suurin osa perinnöllisistä riskeistä on edelleen havaitsematta. Tämän perinnöllisyysvajeen perusta on edelleen epäselvä, mutta se on intensiivisen tutkimuksen kohteena. Perinnöllisyysvajeesta huolimatta on silti mahdollista, että tunnettujen geneettisten riskitekijöiden käyttö voi parantaa potilaiden tuloksia. Esimerkiksi geneettinen testaus voi parantaa potilaan hoitoon sitoutumista ja riskitekijöiden vähentämistä sepelvaltimotaudin Mendelin muodoissa, kuten familiaalinen hyperkolesterolemia (FH). Kuitenkaan "puutarhalajikkeiden" sepelvaltimotaudin osalta ei ole koskaan tehty kliinistä tutkimusta, joka osoittaisi, että geneettisten merkkiaineiden käyttö parantaa tuloksia. NIH, US Preventive Services Task Force ja muut riippumattomat ennaltaehkäisykeskukset ovat saaneet vahvoja signaaleja siitä, että geneettistä seulontaa valvotaan erittäin tarkasti, kunnes tällaisia ​​​​tutkimuksia on olemassa. Tällä hetkellä sekä Evaluation of Genomic Applications in Practice and Prevention (EGAPP) -työryhmä että ACC/AHA Taskforce on Practice Guidelines -työryhmä suosittelevat olemaan tekemättä sepelvaltimotaudin geneettistä testausta 39,40, koska niiden käyttöä ei tue kliinisiä tutkimuksia koskevia tietoja. Näistä suosituksista ja tehokkuustietojen puutteesta huolimatta "suoraan kuluttajalle" -yrityksiin kohdistuu valtavia taloudellisia paineita lisätä geneettistä testausta. Tässä yhteydessä on täydellinen tilaisuus kehittää hyvin suunniteltuja kliinisiä tutkimuksia näiden muunnelmien testaamiseksi.