Génomique personnelle pour la cardiologie préventive

Les études d'association à l'échelle du génome (GWAS) ont identifié plus de 1000 SNP associés à la maladie, dont beaucoup sont liés aux maladies cardiovasculaires (MCV). Des associations ont été trouvées pour la plupart des facteurs de risque traditionnels, notamment les lipides, la tension artérielle/l'hypertension, le poids/l'indice de masse corporelle, le tabagisme et le diabète. Il est important de noter que GWAS a également identifié des variantes de susceptibilité aux maladies coronariennes/infarctus du myocarde (CHD/IM), dont beaucoup sont indépendantes des facteurs de risque traditionnels et ne peuvent donc pas actuellement être évaluées par des mesures de substitution. Le premier, et jusqu'à présent le plus fort, de ces signaux a été trouvé dans le 9p21.3 locus et sont associés à une augmentation de 20 à 40 % du risque relatif de maladie coronarienne chez les populations caucasiennes et est-asiatiques. Comme la plupart des associations identifiées à ce jour, la fonction de la région chromosomique non codante 9p21.3 reste incertaine. Ces marqueurs prédisent la maladie et peuvent modestement améliorer les indices de reclassement. Par exemple, dans un exemple très récent, 13 SNP précédemment identifiés dans GWAS comme associés à CHD/MI ont été incorporés dans un modèle multilocus pour estimer l'association d'un score de risque génétique avec l'incident CHD/MI dans plusieurs grandes études prospectives. Même après ajustement pour les antécédents familiaux et les facteurs de risque traditionnels, les individus du quintile supérieur présentaient un risque 1,66 fois plus élevé que ceux du quintile inférieur 36. Il y a eu une amélioration significative de la reclassification des patients à risque intermédiaire. Il n'a pas encore été démontré que l'utilisation de ces marqueurs surpasse les modèles incluant les facteurs de risque traditionnels et les antécédents familiaux. Cette lacune est probablement due au fait que la grande majorité des risques héréditaires reste non découverte. La base de cet écart d'héritabilité reste incertaine mais fait l'objet d'intenses recherches. Malgré l'écart d'héritabilité, il est toujours possible que l'utilisation de facteurs de risque génétiques connus puisse améliorer les résultats pour les patients. Par exemple, les tests génétiques peuvent améliorer l'adhésion du patient et la réduction des facteurs de risque pour les formes mendéliennes de maladies coronariennes telles que l'hypercholestérolémie familiale (HF). Cependant, pour la maladie coronarienne "de variété jardin", il n'y a jamais eu d'essai clinique qui indique que l'utilisation de marqueurs génétiques améliore les résultats. Le NIH, le groupe de travail américain sur les services préventifs et d'autres centres de prévention indépendants signalent clairement que le dépistage génétique sera étroitement surveillé jusqu'à ce que de tels essais existent. Actuellement, le groupe de travail sur l'évaluation des applications génomiques dans la pratique et la prévention (EGAPP) et le groupe de travail de l'ACC/AHA sur les directives de pratique recommandent de ne pas faire de tests génétiques pour les maladies coronariennes 39,40 car il n'y a pas de données d'essais cliniques à l'appui de leur utilisation. Malgré ces recommandations et le manque de données sur l'efficacité, il existe d'énormes pressions financières pour augmenter les tests génétiques par les entreprises "directement aux consommateurs". Dans ce contexte, il existe une opportunité parfaite pour développer des essais cliniques bien conçus pour tester ces variants.