Osobní genomika pro preventivní kardiologii

Genomové široké asociační studie (GWAS) identifikovaly více než 1000 SNP souvisejících s onemocněním, včetně mnoha souvisejících s kardiovaskulárním onemocněním (CVD). Byly nalezeny asociace pro většinu tradičních rizikových faktorů včetně lipidů, krevního tlaku/hypertenze, hmotnosti/indexu tělesné hmotnosti, kouření a cukrovky. Důležité je, že GWAS také identifikovaly varianty citlivosti na koronární srdeční chorobu/infarkt myokardu (CHD/IM), z nichž mnohé jsou nezávislé na tradičních rizikových faktorech, a proto je v současné době nelze hodnotit pomocí náhradních opatření. První a zatím nejsilnější z těchto signálů byl nalezen v 9p21.3 lokus a jsou spojeny s 20-40% zvýšením relativního rizika ischemické choroby srdeční u kavkazské a východoasijské populace. Stejně jako většina dosud identifikovaných asociací zůstává funkce nekódující chromozomální oblasti 9p21.3 nejasná. Tyto markery předpovídají onemocnění a mohou mírně zlepšit reklasifikační indexy. Například ve velmi nedávném příkladu bylo 13 SNP dříve identifikovaných v GWAS jako asociovaných s CHD/MI začleněno do multilokusového modelu pro odhad asociace skóre genetického rizika s incidentem CHD/MI v několika velkých prospektivních studiích. I po úpravě na rodinnou anamnézu a tradiční rizikové faktory měli jedinci v horním kvintilu 1,66krát zvýšené riziko ve srovnání s těmi v dolním kvintilu 36. Došlo k významnému zlepšení v reklasifikaci pacientů se středním rizikem. Dosud nebylo prokázáno, že použití těchto markerů překonává modely zahrnující tradiční rizikové faktory a rodinnou anamnézu. Tento nedostatek je pravděpodobně způsoben tím, že naprostá většina dědičného rizika zůstává neodhalena. Základ pro tuto mezeru v dědičnosti zůstává nejasný, ale je předmětem intenzivního vyšetřování. Navzdory rozdílu v dědičnosti je stále možné, že použití známých genetických rizikových faktorů může zlepšit výsledky pacientů. Například genetické testování může zlepšit adherenci pacientů a snížit rizikové faktory pro mendelovské formy koronárních onemocnění, jako je familiární hypercholesterolémie (FH). U koronárních onemocnění "zahradní odrůdy" však nikdy neproběhla klinická studie, která by naznačovala, že použití genetických markerů zlepšuje výsledky. Existují silné signály z NIH, US Preventive Services Task Force a dalších nezávislých center prevence, že genetický screening bude přísně prověřován, dokud takové studie nebudou existovat. V současné době pracovní skupina pro hodnocení genomických aplikací v praxi a prevenci (EGAPP) i pracovní skupina ACC/AHA pro praktické pokyny doporučují nedoporučovat genetické testování na koronární onemocnění 39,40, protože neexistují žádné údaje z klinických studií podporující jejich použití. Navzdory těmto doporučením a nedostatku údajů o účinnosti existují obrovské finanční tlaky na zvýšení genetického testování ze strany „přímo spotřebitelských“ společností. V této souvislosti se nabízí skvělá příležitost vyvinout dobře navržené klinické studie k testování těchto variant.