Personlig genomikk for forebyggende kardiologi

Genomomfattende assosiasjonsstudier (GWAS) har identifisert over 1000 sykdomsassosierte SNP-er, inkludert mange relatert til kardiovaskulær sykdom (CVD). Assosiasjoner er funnet for de fleste tradisjonelle risikofaktorer, inkludert lipider, blodtrykk/hypertensjon, vekt/kroppsmasseindeks, røykeatferd og diabetes. Viktigere er at GWAS også har identifisert følsomhetsvarianter for koronar hjertesykdom/hjerteinfarkt (CHD/MI), hvorav mange er uavhengige av tradisjonelle risikofaktorer og derfor ikke for øyeblikket kan vurderes med surrogattiltak. Det første, og så langt det sterkeste, av disse signalene ble funnet i 9p21.3 locus og er assosiert med en 20-40 % økning i den relative risikoen for koronar hjertesykdom blant kaukasiske og østasiatiske befolkninger. Som de fleste assosiasjonene som er identifisert til dags dato, er funksjonen til den ikke-kodende 9p21.3 kromosomregionen fortsatt uklar. Disse markørene forutsier sykdom og kan beskjedenhet forbedre reklassifiseringsindekser. For eksempel, i et helt ferskt eksempel, ble 13 SNP-er tidligere identifisert i GWAS som assosiert med CHD/MI inkorporert i en multilocus-modell for å estimere assosiasjonen til en genetisk risikoscore med hendelse CHD/MI i flere store prospektive studier. Selv etter justering for familiehistorie og tradisjonelle risikofaktorer, hadde individer i den øverste kvintilen 1,66 ganger økt risiko sammenlignet med de på den nederste kvintilen 36. Det var en betydelig forbedring i reklassifisering av pasienter med middels risiko. Bruken av disse markørene har ennå ikke vist seg å overgå modeller inkludert tradisjonelle risikofaktorer og familiehistorie. Denne mangelen skyldes sannsynligvis at det store flertallet av arvelig risiko forblir uoppdaget. Grunnlaget for dette arvelighetsgapet er fortsatt uklart, men er i fokus for intens etterforskning. Til tross for arvelighetsgapet er det fortsatt mulig at bruk av kjente genetiske risikofaktorer kan forbedre pasientresultatene. For eksempel kan genetisk testing forbedre pasientens etterlevelse og risikofaktorreduksjon for Mendelske former for koronarsykdom som familiær hyperkolesterolemi (FH). For koronarsykdom "hagevariant" har det imidlertid aldri vært en klinisk studie som indikerer at bruk av genetiske markører forbedrer resultatene. Det er sterke signaler fra NIH, US Preventive Services Task Force og andre uavhengige forebyggingssentre om at genetisk screening vil bli nøye gransket inntil slike forsøk eksisterer. Foreløpig anbefaler både Evaluering av Genomic Applications in Practice and Prevention (EGAPP) Working Group og ACC/AHA Taskforce on Practice Guidelines mot genetisk testing for koronarsykdom 39,40 fordi det ikke finnes data fra kliniske studier som støtter bruken av dem. Til tross for disse anbefalingene, og mangel på effektdata, er det et enormt økonomisk press for å øke genetisk testing av "direkte til forbruker"-selskaper. I denne sammenhengen er det en perfekt mulighet til å utvikle veldesignede kliniske studier for å teste disse variantene.