Retinitis Pigmentosan ja siihen liittyvien sairauksien taustalla olevien geenien ja mutaatioiden tunnistaminen

Tausta: Retinitis Pigmentosa (RP) on kliinisesti ja geneettisesti heterogeeninen sairaus, joka aiheuttaa näönmenetystä verkkokalvon fotoreseptorien ennenaikaisen kuoleman vuoksi. Yli 100 geeniä ja lokusta on liitetty RP:hen. Jokaisen näiden geenien osuus RP:n yleisestä esiintyvyydestä on kuitenkin suhteellisen pieni, ja monia niistä ei ole vielä löydetty. Nämä tunnistamattomat geenit ovat todennäköisesti hyvin harvinaisia. Suurin osa RP:n genetiikkaa koskevista tutkimuksista on tehty amerikkalaisilla ja eurooppalaisilla populaatioilla. Tutkijoiden kokemuksen perusteella Israelin väestön geneettinen rakenne on ainutlaatuinen, ja monet israelilaispotilailla tunnistetut geneettiset muutokset ovat uusia.

Työhypoteesi ja tavoitteet: tutkijoiden työhypoteesi on, että Israelin väestö on ainutlaatuinen RP-geenien identiteetin ja suhteellisen panoksen suhteen. Siksi tutkijoiden tavoitteena on suorittaa kattava geneettinen analyysi eri etnisistä taustoista tulevista sairastuneista israelilaisista yksilöistä uusien RP-mutaatioiden ja geenien tunnistamiseksi.

Menetelmät: RP-potilaita ja perheenjäseniä rekrytoidaan jatkuvasti tutkimukseen Hillel Yaffe Medical Centerin, Haderan, Israelin, oftalmologian osaston kautta. Suhteellisen korkea perustajamutaatioiden osuus Israelin väestöstä mahdollistaa nopean ja tehokkaan mutaatioseulonnan ja taudin syyn tunnistamisen suuressa määrässä vasta värvättyjä perheitä. Potilaat, jotka ovat negatiivisia kaikkien relevanttien mutaatioiden suhteen, tutkitaan käyttämällä koko eksomin sekvensointia. Bioinformaattista analyysiä käytetään mahdollisten patogeenisten varianttien tunnistamiseen. Todentamisen jälkeen tutkijat tarkistavat heidän yhteissegregaationsa taudin kanssa koko perheessä ja esiintymistiheyden kyseisessä populaatiossa.

Odotetut tulokset: Välittömät odotetut tulokset sisältävät epidemiologisen yleiskatsauksen RP:n jakautumisesta ja etiologiasta Israelin väestössä sekä uusien kausatiivisten geenien ja mekanismien tunnistamisen. Näillä geeneillä odotetaan olevan ratkaiseva rooli verkkokalvon kehityksessä ja toiminnassa, ja siten niiden tunnistaminen ja karakterisointi edistävät merkittävästi tutkijoiden ymmärrystä verkkokalvon rakenteesta ja toiminnasta sekä RP:n etiologiasta. Suurin odotettu pitkän aikavälin tulos on RP:n esiintymistiheyden väheneminen Israelissa. Tämä saavutetaan yhdistämällä ennaltaehkäisy (geneettisellä seulonnalla ja neuvonnalla korkean riskin väestöryhmien keskuudessa) ja hoidon (tunnistamalla potilasryhmät, joilla on yhteinen geneettinen diagnoosi ja jotka voidaan värvätä kliinisiin tutkimuksiin eri hoitostrategioiden arvioimiseksi).