Lasten motoristen neuronien ja hermolihassairauksien genetiikka
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Motoriseen yksikköön - joka koostuu motorisesta neuronista, sen myeliinivaipasta ja sen hermottuneista lihaskuiduista - vaikuttavat sairaudet ovat monimuotoinen, heterogeeninen ryhmä, jolla on heterogeeniset kliiniset esitykset ja geneettiset syyt. Monilla näistä häiriöistä on perinnöllinen komponentti. Joissakin tapauksissa tietyn neuromuskulaarisen/motorisen hermoston sairauden taustalla oleva genetiikka, kuten spinaalinen lihasatrofia (SMA) tai Duchennen lihasdystrofia, on hyvin karakterisoitu. On kuitenkin sairauksia, joiden geneettistä perustaa ei ole vielä määritetty, tai geneettisesti karakterisoituja sairauksia, joissa on uusia mutaatioita. Tämän geneettisen rekisterin tarkoituksena on luetteloida varhain alkavat motoriset hermosolut ja hermolihashäiriöt ja määrittää niiden geneettiset perusteet. Tästä rekisteristä saatujen näytteiden avulla tutkijat pystyvät antamaan geneettisen diagnoosin tietylle hermo-lihas-/motorihermosairaudelle, mikä johtaa näiden sairauksien sairastuneiden potilaiden parempaan hoitoon.
Monilla näistä häiriöistä on laaja kirjo fenotyyppistä vaihtelua. Esimerkiksi SMA:n vakavuus on melko vaihtelevaa, vaikka se johtuu yhden geenin eli selviytymismotorisen neuroni 1:n (SMN1) katoamisesta. Kopioituneen geenin selviytymismotorisen neuronin 2 (SMN2) kopioiden määrä sanelee fenotyyppisen vakavuuden SMA:ssa. Tässä tutkimuksessa tutkimusryhmä tunnistaa myös mahdollisia fenotyyppisen vakavuuden modifioijia tiettyjen sairauksien, kuten SMA:n ja Charcot-Marie-Toothin (CMT) taudin osalta. Uusien modifioivien geenien tunnistamisen myötä tutkijat pystyvät ennustamaan tarkemmin sairauden lopputulosta ja heillä on myös uusia tavoitteita näiden sairauksien hoitoaineiden kehittämiseen.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
Delaware
-
Wilmington, Delaware, Yhdysvallat, 19803
- Nemours Children's Hospital Delaware
-
-
Florida
-
Jacksonville, Florida, Yhdysvallat, 32207
- Nemours Children's Specialty Care
-
Orlando, Florida, Yhdysvallat, 32827
- Nemours Children's Hospital Orlando
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Neurologin vahvistama motorisen hermoston/neuromuskulaarisen sairauden diagnoosi
- Joku tutkimuksen tutkijoista nähdään
Poissulkemiskriteerit:
- yksikään tutkimuksen tutkijoista ei ole nähnyt
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Vain tapaus
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
näytekokoelma
Jokaiselta osallistujalta otetaan veri geneettistä analyysiä ja lymfoblastoidisolulinjan muodostamista varten.
|
veren kerääminen
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
geneettinen diagnoosi
Aikaikkuna: jopa 2 vuotta
|
Potilaan tilan geneettinen perusta varmistetaan/määritetään DNA-näytteen Sanger-sekvensoinnilla
|
jopa 2 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
SMN1-kopionumero
Aikaikkuna: jopa 2 vuotta
|
SMN1-geenin kopioiden lukumäärä määritetään käyttämällä array Digital polymerase Challection (PCR) -menetelmää.
|
jopa 2 vuotta
|
|
SMN2-kopionumero
Aikaikkuna: jopa 2 vuotta
|
SMN2-geenin kopioiden lukumäärä määritetään käyttämällä array-digitaalista PCR:ää.
|
jopa 2 vuotta
|
|
kohdegeenin mRNA-tasot
Aikaikkuna: jopa 2 vuotta
|
Taudin geenispesifisen lähettiribonukleiinihapon (mRNA) suhteelliset tasot mitataan käyttämällä kvantitatiivista PCR:ää.
|
jopa 2 vuotta
|
|
kohdegeenin proteiinitasot
Aikaikkuna: jopa 2 vuotta
|
Sairausgeenispesifisen proteiinin suhteelliset määrät mitataan käyttämällä immunoblottia.
|
jopa 2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Matthew ER Butchbach, Ph.D., Nemours Children's Clinic
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Stabley DL, Holbrook J, Harris AW, Swoboda KJ, Crawford TO, Sol-Church K, Butchbach MER. Establishing a reference dataset for the authentication of spinal muscular atrophy cell lines using STR profiling and digital PCR. Neuromuscul Disord. 2017 May;27(5):439-446. doi: 10.1016/j.nmd.2017.02.002. Epub 2017 Feb 6.
- Stabley DL, Harris AW, Holbrook J, Chubbs NJ, Lozo KW, Crawford TO, Swoboda KJ, Funanage VL, Wang W, Mackenzie W, Scavina M, Sol-Church K, Butchbach ME. SMN1 and SMN2 copy numbers in cell lines derived from patients with spinal muscular atrophy as measured by array digital PCR. Mol Genet Genomic Med. 2015 Jul;3(4):248-57. doi: 10.1002/mgg3.141. Epub 2015 Mar 21.
- Chen X, Sanchis-Juan A, French CE, Connell AJ, Delon I, Kingsbury Z, Chawla A, Halpern AL, Taft RJ; NIHR BioResource; Bentley DR, Butchbach MER, Raymond FL, Eberle MA. Spinal muscular atrophy diagnosis and carrier screening from genome sequencing data. Genet Med. 2020 May;22(5):945-953. doi: 10.1038/s41436-020-0754-0. Epub 2020 Feb 18.
- Jiang L, Lin R, Gallagher S, Zayac A, Butchbach MER, Hung P. Development and validation of a 4-color multiplexing spinal muscular atrophy (SMA) genotyping assay on a novel integrated digital PCR instrument. Sci Rep. 2020 Nov 16;10(1):19892. doi: 10.1038/s41598-020-76893-7.
- Stabley DL, Holbrook J, Scavina M, Crawford TO, Swoboda KJ, Robbins KM, Butchbach MER. Detection of SMN1 to SMN2 gene conversion events and partial SMN1 gene deletions using array digital PCR. Neurogenetics. 2021 Mar;22(1):53-64. doi: 10.1007/s10048-020-00630-5. Epub 2021 Jan 7.
- Pinto A, Cunha C, Chaves R, Butchbach MER, Adega F. Comprehensive In Silico Analysis of Retrotransposon Insertions within the Survival Motor Neuron Genes Involved in Spinal Muscular Atrophy. Biology (Basel). 2022 May 27;11(6):824. doi: 10.3390/biology11060824.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Neurologiset ilmenemismuodot
- Tuki- ja liikuntaelinten sairaudet
- Stomatognaattiset sairaudet
- Keskushermoston sairaudet
- Hermoston sairaudet
- Lihassairaudet
- Neuromuskulaariset ilmenemismuodot
- Patologiset tilat, anatomiset
- Geneettiset sairaudet, synnynnäiset
- Metaboliset sairaudet
- Ääreishermoston sairaudet
- Neurodegeneratiiviset sairaudet
- Synnynnäiset poikkeavuudet
- Heredodegeneratiiviset häiriöt, hermosto
- Lihassairaudet, Atrofiset
- Selkäydinsairaudet
- TDP-43 Proteinopatiat
- Proteostaasin puutteet
- Hermoston epämuodostumat
- Polyneuropatiat
- Lihasdystrofiat
- Atrofia
- Motorinen neuronitauti
- Amyotrofinen lateraaliskleroosi
- Lihasten atrofia
- Selkärangan lihasatrofia
- Hammassairaudet
- Charcot-Marie-Toothin tauti
- Hermojen puristusoireyhtymät
- Perinnöllinen sensorinen ja motorinen neuropatia
- Neuromuskulaariset sairaudet
Muut tutkimustunnusnumerot
- 764456
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .