Syövän DNA-seulonnan pilottitutkimus (CANDACE) (CANDACE)

Tutkimukseen suostuvia osallistujia pyydetään antamaan suostumus kahden veripullon (yhteensä noin 20 ml) alustavaan keräämiseen ja vastaamaan kysymyksiin, jotka koskevat heidän sairaushistoriaansa ja elämäntapaansa, jotka liittyvät syöpäriskiin. Tutkimukseen osallistuvilta pyydetään myös suostumus verinäytteen seurantaan ja jos varmistustestit osoittavat positiivisen tuloksen, seurantaan PET/CT-skannaukset ja muut tutkimukset.

BC Generations -projektiin osallistuu 1 000 55–75-vuotiasta osallistujaa. Tämä on vain kutsutut tutkimus.

• Vastaajat, jotka antavat suostumuksensa ja haluavat osallistua tutkimukseen, ohjataan sitten online-kyselyyn, jossa heitä pyydetään vastaamaan elämäntapaansa ja sairaushistoriaansa koskeviin kysymyksiin.
• Suostumuslomake ja kyselyn tulokset vastaanotetaan sähköisesti UBC-tutkimussivustolla.
• Kun osallistujatiedot on vastaanotettu UBC:lle, ne syötetään salasanalla suojattuun laskentataulukkoon UBC-palvelimella. Tässä vaiheessa osallistujille lähetetään hakulomake, joka ohjaa heidät yhteen useista mahdollisista verenkeräyspisteistä (LifeLabs), jossa flebotomisti ottaa kaksi 10 ml:n verenottoa. Boreal maksaa verinäytteet LifeLabsin kanssa tehdyllä sopimuksella, ja ne suoritetaan Streck-stabiloiduissa cfDNA-verenkeräysputkissa (joissa verta voidaan säilyttää huoneenlämmössä yli viikon ajan).
• Kerättyään kaksi veriputkea LifeLabs toimittaa BC Cancer Research Centeriin 24–48 tunnin kuluessa keräämisestä. Tutkimushenkilöstö kerää putket (5 päivän sisällä ensimmäisestä verenotosta) ja kuljettaa ne UBC:hen, jossa ne poistetaan ja niille annetaan satunnainen tunniste (UBC-tutkimusnumero). Mahdolliset henkilötunnisteet putkista poistetaan kokonaan, tarvittaessa hankaamalla. Tunnistamistiedot syötetään salasanalla suojattuun laskentataulukkoon (UBC-palvelimella), joka yhdistää osallistujan tiedot UBC-tutkimuksen numeroon. Tästä eteenpäin verinäytteet ja myöhemmät fraktiot ja tulokset tunnistetaan vain tutkimusnumeron perusteella. Tunnistamattomat putket kuljetetaan Boreal Genomicsille, jossa ne erotetaan plasma- ja solufraktioiksi, mukaan lukien erytrosyytit ja buffy coat. Verinäytteiden muut kuin plasmakomponentit yhdistetään ja sen jälkeen hylätään. Plasmafraktio laitetaan erilliseen putkeen ja jäädytetään myöhempää analyysiä varten. Alkuperäiset veriputket (nyt tyhjät) tuhotaan.
• Jäädytetyt plasmanäytteet, joiden identifiointi on nyt poistettu, toimitetaan Pathway Genomicsille (San Diego, CA), jossa DNA-sisältö analysoidaan kiertävän kasvaimen DNA-määrityksellä, jossa käytetään UBC/Boreal Genomics -rikastustekniikkaa. Kaikki osallistujien plasma lähetetään Pathwaylle, jossa se käytetään määrityksessä. Plasma, jota ei käytetä määrityksessä, tuhoutuu. Plasmaa, verta tai muita näytteitä ei säilytetä Pathway Genomicsissa tai UBC:ssä määrityksen suorittamiseen vaadittavan väliaikaisen varastoinnin (1–2 viikkoa) lisäksi.
• Pathway Genomicsin kiertävän kasvaimen DNA-määrityksen tulokset (raaka sekvensointitiedot) palautetaan UBC:hen ja analysoidaan syöpämutaatioiden esiintymisen varalta. Kaikkia näytteitä, jotka osoittavat aktivoivia mutaatioita määrityksen teknisen tunnistusrajan (LOD) yläpuolella, kutsutaan positiivisiksi. Yksi poikkeus tehdään TP53-mutaatioille, joiden tiedetään esiintyvän joissakin normaaleissa yksilöissä alhaisina tasoina. Näille mutaatioille asetetaan 0,1 %:n taso, jonka yläpuolella näytettä kutsutaan positiiviseksi.
• Kun tiedot on analysoitu, negatiivisen tuloksen saaneille osallistujille lähetetään sähköposti, jossa heitä kiitetään osallistumisesta ja ilmoitetaan negatiivisesta tuloksesta.
• Onkologi-apututkija ottaa välittömästi yhteyttä puhelimitse osallistujiin, joiden näytteestä saatiin positiivinen tulos, ja samaan aikaan hän lähettää postitse kirjeen, jossa heille ilmoitetaan tuloksesta ja pyydetään palaamaan toiseen verikokeeseen. Tutkijat odottavat, että tämä kommunikointi tapahtuu noin kuukauden kuluttua alkuperäisestä verinäytteestä. Kirje sisältää tutkimusryhmän ja onkologiapukututkijoiden yhteystiedot siltä varalta, että osallistujalla on tässä vaiheessa kysyttävää tai huolenaiheita. Kirjeen mukana lähetetään hakulomake. Verenkeräyskäynnillä otetaan kaksi 10 ml:n putkea verta, jotta voidaan testata uusinta ja varmistaa, että mutaatio on jatkuvasti läsnä.
• Ylimääräisen arvonnan näytteitä käsitellään edellä alkuperäisten näytteiden kohdalla kuvatulla tavalla kahta poikkeusta lukuun ottamatta. Ensinnäkin näytteet käsitellään Boreal Genomicsissa sen sijaan, että ne toimitettaisiin Pathway Genomicsille. Toiseksi, osa buffy coat DNA:sta (iduradan DNA) testataan myös Boreal-paneelissa olevien 96 syöpämutaatioiden havaitsemiseksi harvinaisten tapausten havaitsemiseksi, joissa kiertävä kasvain-DNA-signaali on peräisin matalan tason ituradan mutaatioista kasvain-DNA:n sijaan. Tämä testi tehdään Boreal Genomicsissa ja kaikki jäljelle jäänyt buffy coat tai DNA, jota ei ole käytetty testissä, hylätään. Tiedot kiertävän kasvaimen DNA-määrityksestä ja buffy coat -testistä palautetaan UBC:lle ja niitä verrataan alkuperäiseen veritulokseen.
• Osallistujat, joilla todetaan syöpään liittyvä ituradan mutaatio yllä olevan testauksen aikana, saavat tiedon onkologien avustajilta ja heille tarjotaan konsultaatiota BC Cancer Agencyn perinnöllisen syöpäohjelman kanssa, jossa he voivat tavata lääketieteellisen geneetiikan konsultaatio. Halutessaan näillä osallistujilla on mahdollisuus kliinisesti validoituun ituradan mutaation uudelleentestaukseen.
• Osallistujiin, joille lisäverinäyte ei anna positiivista tulosta syöpämutaatioiden suhteen, otetaan puhelimitse yhteyttä tulosten selvittämiseksi.
• Onkologiapututkija ottaa puhelimitse yhteyttä osallistujiin, joille lisäverinäyte antaa positiivisen tuloksen samoihin syöpämutaatioihin, jotka havaittiin ensimmäisessä verinäytteessä. Heille lähetetään myös kirje. Tutkijat odottavat tämän yhteydenpidon tapahtuvan noin viikon sisällä toisesta verinäytteestä. Odotettaessa osallistujan onkologista arviointia (katso alla) ja tutkimustuloksia pyydetään PET-CT-skannausta fluorodeoksiglukoosi-aineella (FDG) ja mahdollisesti muita testejä. Elleivät onkologiset tutkimukset muuta viittaa, oletusseuranta on koko kehon PET-CT. Lääketieteellisiä kuvantamistutkimuksia suorittaville osallistujille annetaan hakulomake ja heidät ohjataan suorittamaan pyydetty skannaus, jonka tutkimuksen rahoittaja (Boreal Genomics) maksaa.
• Tietäen, että epänormaalista DNA-testistä ilmoittaminen voi aiheuttaa osallistujille tuskaa, tutkijat ovat sitoutuneet (a) suorittamaan testauksen loppuun ja ottamaan yhteyttä osallistujaan toisen testin tuloksesta 14 päivän kuluessa veren otosta; (b) tutkimusonkologin tekemä ilmoitus toisesta tuloksesta (epänormaali tai normaali) puhelimitse (c) onkologisen seuranta-ajan ennakkovaraus ja kahden vaihtoehdon tarjoaminen osallistujalle, kun hän soittaa ilmoittaakseen toisesta epänormaalista tuloksesta (d) ) onkologisen arvioinnin suorittaminen 3 viikon kuluessa siitä, kun potilaalle kerrottiin, että toinen testi on epänormaali.

• Onkologinen arviointi suoritetaan BC Cancer Agencyn Vancouver Centerissä, ja se sisältää todennäköisesti:

  • Täydellinen historia, mukaan lukien syövän riskitekijät ja järjestelmien katsaus oireiden etsimiseksi, jotka voivat johtua syövästä.

  • Fyysinen tarkastus:

    - Pää ja niska, rintakehä, vatsa, iho, neurologinen järjestelmä imunestejärjestelmä ja peräsuolen. Miehillä: eturauhasen tutkimus. Naisilla: rintojen ja gynekologiset tutkimukset

  • Koko kehon PET-CT-skannaus
  • Ikäkohtaiset tavanomaiset syöpäseulontatutkimukset, kuten ulosteen immunokemiallinen testi (FIT) paksusuolen syövän varalta, Papanicolaou-testi kohdunkaulan syövän varalta ja mammografia rintasyövän varalta, jos niitä ei ole suoritettu, ne ovat erääntyneet tai myöhässä.
  • Lisätutkimuksia ohjaavat historia, fyysinen tutkimus, koko kehon PET-CT ja standardiseulontatutkimukset.
  • Tutkimuksiin voivat kuulua: täydellinen verenkuva, maksaentsyymit, kasvainmarkkerit, virtsan analyysi, kontrastitehoste MRI, kontrastitehostettu CT sekä pään ja kaulan, keuhkoputkien, virtsarakon, ylemmän ruoansulatuskanavan ja alemman ruoansulatuskanavan endoskopia.
• Näiden testien tulokset palautetaan onkologien tutkijoille ja tohtori Marzialille, minkä jälkeen ne syötetään tutkimustietokantaan. Tulokset ilmoitetaan osallistujalle kirjallisesti sekä henkilökohtaisesti tai puhelimitse. Onkologi lähettää osallistujat lisätutkimuksiin ja asianmukaisille kliinikoille seurantaa varten lisätutkimuksia varten. Onkologi tarjoaa osallistujille myös lähetteen tukevaan neuvontaan tässä vaiheessa.
• Onkologin tutkija välittää tulokset osallistujan perhelääkärille, mikäli osallistujalla on sellainen.
• Osallistujille, joiden tutkimuksissa havaitaan mahdollisesti pahanlaatuinen massa, otetaan biopsia joko kuvantamisohjauksella tai lähetteen kautta sopivalle asiantuntijalle.
• Osallistujille, joiden tutkimuksissa ei havaita mahdollisesti pahanlaatuista massaa, ilmoitetaan kirjallisesti, sekä henkilökohtaisesti tai puhelimitse, että kiertävän kasvaimen DNA-testi antoi väärän positiivisen tuloksen ja heitä kehotetaan jatkamaan ikäänsä vastaavaa syöpäseulontaa. ja sukuhistoriaa.
• Osallistujille, joilla on positiiviset kiertävän kasvaimen DNA-tulokset ja jotka eivät halua tehdä lisätestejä, mukaan lukien mahdolliset PET-CT:t, tarjotaan edelleen seurantakäyntiä onkologin rinnakkaistutkijan kanssa keskustellakseen tuloksista ja tarjotakseen yllä kuvattua tukea.
• Vuoden kuluttua ensimmäisestä verinäytteestä osallistujiin otetaan yhteyttä sähköpostitse selvittääkseen, onko syöpädiagnoosi tehty tänä aikana. Vastaamattomille osallistujille soitetaan ja perhelääkäreille lähetetään kirje, jossa tiedustellaan, onko osallistujalla diagnosoitu syöpä.

Tässä tutkimuksessa kerätyt tiedot toimitetaan BC Generations Projectille.