Haima-sappikasvainmutaatioiden profilointi sappinäytteissä (ONCOBIL)

Hyvänlaatuisten ja pahanlaatuisten sappitiehyiden erotusdiagnoosi on vaikea ja vaativa tehtävä kliinikoille. Pahanlaatuisten sapen ahtaumien kliiniset, biokemialliset ja radiologiset ominaisuudet ovat epäspesifisiä, ja kudosdiagnoosia on vaikea saada ennen leikkausta. Tästä syystä on tarpeen kehittää uusia diagnostisia menetelmiä. Erityisen kiinnostavaa on sappitiehyissä kehittyvien kasvainsolujen erittämien tai erittämien kasvainmerkkiaineiden etsiminen.

Lisäksi potilaan kasvaimen molekyyliprofiili on perusta yksilöllisen hoidon valinnassa. Kolangiokarsinoomille on ominaista suuri geneettinen heterogeenisyys. Yleisimmät mutaatiot ovat TP53, KRAS, BRAF, EGFR, MET, NRAS, PIK3CA, ERBB2, SMAD4, FBXW7, ARID1A, PBRM1, BAP1 ja IDH1/2. Haimasyöpien tapauksessa yleisimpiä ovat KRAS-mutaatiot, jotka havaitaan 90 %:lla potilaista, sekä CDKN2A-, SMAD4-, TGFBR1-, TGFBR2-, ATM-, BRCA2-, MLL2-, MLL3-, KDM6A-, ARID1A-, ARID1B-, SMARC1-, GNAS- ja RNF43-mutaatiot.

On hyvin todettu, että KRAS- ja P53-mutaatioita voidaan havaita sappinäytteistä potilailta, joilla on kolangiokarsinoomaan ja haiman pään syöpään liittyviä sappivammoja. Päätavoitteena on määrittää, voiko sappinäyteanalyysi potilailta, joilla on pahanlaatuinen sapen ahtauma, mahdollistaa kasvaimen mutaatioprofiilin tunnistamisen ja kasvaimen genotyypin määrittämisen. Toissijaisena tavoitteena on arvioida verisuonten endoteelin kasvutekijän (VEGF) ja metalloproteinaasien (MMP) tasojen diagnostista arvoa sappinäytteissä.

Kasvaimen genotyypitys tehdään sappinäytteistä (supernatantti ja solupelletti) ja kasvainkudoksissa 10 potilaan sarjassa, joita hoidetaan kirurgisesti kolangiokarsinoomaan tai haiman pään syöpään liittyvän pahanlaatuisen sappirakon vuoksi. Biokemialliset markkerit, VEGF ja MMP, arvioidaan sappinäytteissä, jotka on saatu endoskooppisen retrogradisen kolangiopankreatografian aikana 50 potilaalta, joilla on pahanlaatuinen sappirauma ja 50 potilaalla, joita hoidetaan hyvänlaatuisten sappisairauksien vuoksi.