Profilowanie mutacji guza trzustki i dróg żółciowych w próbkach żółci (ONCOBIL)

Diagnostyka różnicowa łagodnych i złośliwych zwężeń dróg żółciowych jest trudnym i wymagającym zadaniem dla klinicystów. Charakterystyka kliniczna, biochemiczna i radiologiczna złośliwych zwężeń dróg żółciowych jest niespecyficzna, a rozpoznanie tkanki jest trudne do uzyskania przed operacją. Z tego powodu istnieje potrzeba opracowania nowych metod diagnostycznych. Szczególnie interesujące jest poszukiwanie markerów nowotworowych wydzielanych lub wydalanych z żółcią przez komórki nowotworowe rozwijające się w drogach żółciowych.

Ponadto profil molekularny guza pacjenta jest podstawą doboru terapii spersonalizowanej. Cholangiocarcinoma charakteryzują się dużą heterogenicznością genetyczną. Najczęstsze mutacje to TP53, KRAS, BRAF, EGFR, MET, NRAS, PIK3CA, ERBB2, SMAD4, FBXW7, ARID1A, PBRM1, BAP1 i IDH1/2. W przypadku raków trzustki najczęściej występują mutacje KRAS wykrywane u 90% chorych oraz mutacje CDKN2A, SMAD4, TGFBR1, TGFBR2, ATM, BRCA2, MLL2, MLL3, KDM6A, ARID1A, ARID1B, SMARC1, GNAS i RNF43.

Dobrze wiadomo, że mutacje KRAS i P53 można wykryć w próbkach żółci od pacjentów ze zwężeniami dróg żółciowych związanymi z rakiem dróg żółciowych i rakiem głowy trzustki. Głównym celem jest ustalenie, czy analiza próbek żółci od pacjentów ze złośliwym zwężeniem dróg żółciowych może pozwolić na identyfikację profilu mutacji guza i określenie genotypu guza. Drugim celem jest ocena wartości diagnostycznej poziomu czynnika wzrostu śródbłonka naczyniowego (VEGF) i metaloproteinaz (MMP) w próbkach żółci.

Genotypowanie nowotworu zostanie przeprowadzone w próbkach żółci (supernatant i osad komórkowy) oraz tkankach nowotworowych w serii 10 pacjentów leczonych chirurgicznie z powodu złośliwego zwężenia dróg żółciowych związanego z rakiem dróg żółciowych lub rakiem głowy trzustki. Markery biochemiczne, VEGF i MMP, zostaną ocenione w próbkach żółci pobranych podczas endoskopowej cholangiopankreatografii wstecznej u 50 pacjentów ze złośliwym zwężeniem dróg żółciowych i 50 pacjentów leczonych z powodu łagodnych chorób dróg żółciowych.