LoViReT (Low Viral Reservoir hoidetut potilaat) (LoViReT)

Antiretroviraalinen yhdistelmähoito (cART) on erittäin onnistunut estämään HIV-1:n replikaatiota ja kliinistä etenemistä tartunnan saaneilla potilailla. Se ei kuitenkaan estä virusvarastojen muodostumista, jolloin syntyy piilevästi infektoituneita soluja, jotka provosoivat HIV-viremian nopean toipumisen hoidon keskeyttämisen jälkeen. Erilaisia ​​strategioita HIV-1-varastojen torjumiseksi on ehdotettu viime vuosina rajoitetulla menestyksellä. Itse asiassa muutama kuvailtu HIV-1-toiminnallinen parannustapaus löytyy eliitti- ja hoidon jälkeisistä kontrolloijista. Siten jotkut potilaat, joilla on säännöllinen HIV:n eteneminen, voivat hallita replikaatiota spontaanisti, useimmat heistä saatuaan CART:n primaarisen HIV-1-infektion aikana. Itse asiassa "Mississippi-vauvalla", jota hoidettiin 36 tuntia syntymän jälkeen, oli havaittamaton viremia 27 kuukauden ajan hoidon keskeyttämisen jälkeen. Viime aikoina on myös todistettu onnistuneesti hoidetuilla potilailla, että alhainen proviraalinen reservoir liittyy parempaan HIV-1-hallintaan hoidon lopettamisen jälkeen. Siten sellaisten potilaiden tunnistaminen, joilla on matalampi latenttivarasto kroonisessa infektiossa, mahdollistaa mahdollisten mekanismien paljastamisen toiminnallisen parantumisen saavuttamiseksi CART-hoidon lopettamisen jälkeen.

Badalonan keskuksemme jakaa biologisen näytekokoelman, joka sisältää 72 000 näytettä HIV-1-tartunnan saaneilta henkilöiltä. Näytteet 319 potilaasta, jotka olivat olleet suppressiivisessa CART-hoidossa yli 3 vuoden ajan, on seulottu käyttämällä erittäin herkkää BioRad-pisara-digitaalipolymeraasiketjureaktioalustaa (ddPCR). Seulottujen potilaiden joukossa on 20 "Low Viral Reservoir Treated" -potilaan (LoViReT) kohortti, joilla on erittäin alhainen tai havaitsematon HIV-1-DNA-taso perifeerisestä verestä huolimatta siitä, että he olivat aloittaneet CART:n kroonisen HIV-1-infektion aikana, minkä odotetaan nostetaan 40 potilaaseen. Sellaisten tekijöiden löytäminen, jotka vähentävät HIV-varastoa ja saavat LoViReT-potilaat ylläpitämään erittäin alhaisia ​​proviraalisen HIV-1-DNA:n pitoisuuksia, avaa uusia hoitostrategioita, jotka perustuvat säiliön pitämiseen alhaisimmilla tasoilla normaalin viruskuorman kliinisen markkerin rinnalla. Lisäksi toinen toinen vaihe kontrolloidusta CART-keskeytyksestä voidaan suunnitella arvioimaan todellista vaikutusta, joka on äärimmäisen alhaisten piilevien säiliötasojen säilyttämisellä toiminnallisen HIV-hoidon jatkamiseksi.

Selvittääksemme mekanismeja, joilla LoViReT-kohortti ylläpitää erittäin alhaisia ​​HIV-1-DNA-tasoja huolimatta siitä, että se on aloittanut CART:n kroonisen HIV-1-infektion aikana, tätä kohorttia tutkitaan eri näkökulmista. Kaikkia tuloksia verrataan kontrolliryhmään, jossa on 40 henkilöä, joilla on standarditaso HIV:n kokonais-DNA:ta (säiliö). Kolme kaupunginjohtajan tavoitetta käsitellään tulosten ekstrapoloimiseksi suurempiin kroonisiin HIV-1-tartunnan saaneisiin populaatioihin:

• Tutkia CART:n roolia HIV-varaston suppressiossa LoViReT-potilailla verrokkeihin verrattuna. Tämän tavoitteen saavuttamiseksi kullekin potilaalle suoritetaan proviraalisen HIV-DNA:n pitkittäinen analyysi, mukaan lukien CART:ta edeltävät ajankohdat. Yhteensä analysoidaan 200 näytettä ja rakennetaan dynaamisia malleja kahdelle eri tasolle. Solupopulaatioiden yleinen immuunifenotyyppi, mukaan lukien myös aktivaatiomarkkerit, arvioidaan myös kaikissa aikapisteissä.
• Tutkia HIV-sekvenssien eheyttä LoViReT-potilailla ja sen suhdetta patogeneesiin verrokkeihin verrattuna. Genotyyppinen HIV-tropismi ja koko virusgenomi analysoidaan sekvensoimalla potilaiden perifeerisen veren mononukleaaristen solujen (PBMC) DNA:sta. Tutkimuksen 40 LoViReT- ja 40 kontrollipotilaalta otetaan tuoreita verinäytteitä. Lisäksi niille, jotka harjoittavat virustuotantoa, käytetään virusisolaatteja viruksen replikaatiokapasiteetin ja solun patogeneesin analysointiin.
• Tutkia immuuni-geneettisten tekijöiden roolia, jotka yhdessä CART:n kanssa vähentävät HIV-varastoja LoViReT-potilailla. Funktionaalinen T-soluvaste mitataan eristämällä CD8 T-soluja ja mittaamalla HIV:n replikaation estokyky kussakin potilaassa. Spesifinen HIV:hen liittyvä CD8-T-soluinterferonin tuotanto arvioidaan myös epitooppiärsykkeellä. Myös muita etenemiseen liittyviä geneettisiä tekijöitä, kuten ihmisen leukosyyttiantigeenin (HLA) tyyppiä sekä CCR5-, CCR2- ja SIGLEC-1-yksinukleotidipolymorfismeja (SNP:t), tutkitaan.