Nonsense-mutaatioiden korjaus kystisessä fibroosissa
tiistai 17. marraskuuta 2020 päivittänyt: University Hospital, Lille
Sellaisten potilaiden, joilla on kystinen fibroosi, joilla on nonsense-mutaatioita CFTR-geenissä, ylähengitysteiden epiteelisoluissa olevien nonsense-mutaatioiden korjaavien molekyylien optimointi
Nonsense-mutaation läsnäolo johtaa kantaja-mRNA-mutaation nopeaan hajoamiseen mekanismilla, jota kutsutaan NMD:ksi (nonsense-mediated mRNA decay) [6, 13]. Tällä hetkellä on olemassa kolme päästrategiaa ainakin nonsense-mutaatioiden korjaamiseksi: eksonien ohittaminen, NMD:n estäminen ja nonsense-mutaatioiden läpivienti.
Laboratoriossa kehitimme strategian nonsense-mutaatioiden korjaamiseksi yhdistäen NMD:n eston ja translektuurin aktivoinnin. Tätä tarkoitusta varten olemme rakentaneet seulontajärjestelmiä NMD:tä inhiboivien ja/tai läpivientitehostajien tunnistamiseksi. Näin tunnistetut molekyylit testataan sitten solulinjoilla ja hiirimalleilla, joissa on nonsense-mutaatio.
Yksi tavoitteistamme on valita joukko molekyylejä, jotka voivat korjata tehokkaasti järjettömiä mutaatioita. Tätä varten meidän on testattava näitä molekyylejä monilla erilaisilla nonsense-mutaatioilla.
Tämä työ tulee:
- määrittää, voimmeko korjata kaikki järjettömät mutaatiot, jotka on testattu ainakin yhdellä molekyylillämme
- määrittää, mikä on yleistä tietyn molekyylin korjaaman mutaatioryhmän sisällä
- osata määrittää parametrit, jotka tekevät yhden mutaation korjaavan yhden molekyylin toimesta, mutta toisella ei tai vain vähän.
Tämä tutkimus parantaa siksi teoreettista tietämyksemme ennenaikaisten lopetuskodonien tunnistamisesta, mutta myös ehdottaa terapeuttisia lähestymistapoja CFTR-geenin nonsense-mutaatioiden korjaamiseksi kystisessä fibroosissa kohdennetusti potilaalle.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Odotettu)
85
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskeluyhteys
- Nimi: Anne Prévotat, MD
- Puhelinnumero: +33 03 20 44 59 48
- Sähköposti: anne.prevotat@chru-lille.fr
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Fabrice Lejeune, PhD
- Sähköposti: fabrice.lejeune@inserm.fr
Opiskelupaikat
-
-
-
Amiens, Ranska
- Rekrytointi
- Camsp Chu Amiens
-
Bron, Ranska
- Rekrytointi
- Hopital Femme Mere Enfant - Hcl - Bron
-
Lille, Ranska
- Rekrytointi
- Hôpital Calmette,CHU
-
Päätutkija:
- Anne Prévotat, MD
-
Marseille, Ranska
- Rekrytointi
- Aphm Hopital La Timone - Marseille
-
Montpellier, Ranska
- Rekrytointi
- Chu Montpellier
-
Paris, Ranska
- Rekrytointi
- Cmp Enfants Aphp Robert Debre - Paris
-
Paris, Ranska
- Rekrytointi
- Hu Paris Centre Site Cochin Aphp - Paris 14
-
Strasbourg, Ranska
- Rekrytointi
- Hopitaux Universitaires de Strasbour
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
8 vuotta ja vanhemmat (Lapsi, Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Potilaat, joilla on kystinen fibroosi ja joilla on nonsense-mutaatio CFTR-kanavaa koodaavan geenin kahdessa alleelissa.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Mies/nainen aikuiset ja alaikäiset yli 8-vuotiaat
- Potilaat, joilla on kystinen fibroosi ja joilla on nonsense-mutaatio CFTR-kanavaa koodaavan geenin kahdessa alleelissa.
- Potilaat, joiden CFTR-geenin potilaiden genotyyppi tunnetaan.
- Potilaat, joilla on sosiaaliturva
- Suuret potilaat, jotka ovat antaneet suostumuksensa
- Alaikäiset potilaat vanhempien luvalla
Poissulkemiskriteerit:
- Potilaat, joilla on muu mutaatio kuin nonsense CFTR-geenissä
- Potilaat, joiden CFTR-geeniä ei sekvensoitu kahdesta alleelista
- Potilaat, jotka eivät halua osallistua tähän tutkimukseen tai henkilöt, jotka eivät anna tai eivät voi antaa suostumusta.
- Raskaana oleville tai imettäville naisille
- Hoidossa tai holhouksessa olevat potilaat
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Jodidi-ionien kuljetus CEVAS-kalvon läpi
Aikaikkuna: alle 48 tuntia keräyksen jälkeen.
|
Potilassoluja viljellään BEGM (Lonza) -elatusaineessa ja inkuboidaan nonsense-mutaatioiden korjaajan kanssa 20 tuntia ja fluoresoivan molekyylin kanssa nimeltä SPQ (6-metoksi-N-3'-sulfopropyylikinoliniumille).
Jodi voi sitoa SPQ:ta ja sammuttaa SPQ-fluoresenssin.
Nitraatit sitovat SPQ:ta sammuttamatta SPQ-fluoresenssia.
Sijoittamalla potilassolut ensin runsaasti jodia sisältävään väliaineeseen SPQ-fluoresenssin sammuttamiseksi ja sitten nitraattirikkaaseen alustaan, pystymme mittaamaan näissä soluissa olevan funktionaalisen CFTR-proteiinin tason mittaamalla fluoresenssin uudelleen ilmaantumista käyttämällä fluorimetri.
Itse asiassa nitraatti pystyy korvaamaan jodin SPQ:ssa sammuttamatta SPQ-fluoresenssia vain, jos jodi poistuu soluista CFTR-kanavien kautta.
Tämä määritys mahdollistaa sen määrittämisen, pystyykö nonsense-mutaation korjaaja johtamaan funktionaalisen CFTR-proteiinin synteesiin
|
alle 48 tuntia keräyksen jälkeen.
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Potilassolujen immortalisointi
Aikaikkuna: keskimäärin 12 kuukautta
|
Potilassolujen immortalisointia yritetään transfektoimalla rakenne, joka ekspressoi replikaation aloituskohtaan viallista SV40:tä, kuten on kuvattu julkaisussa Gruenert et ai., 2004
|
keskimäärin 12 kuukautta
|
|
CFTR-geenin ilmentyminen mRNA- ja proteiinitasolla
Aikaikkuna: alle 1 viikko.
|
alle 1 viikko.
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Keskiviikko 3. helmikuuta 2016
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Tiistai 1. tammikuuta 2030
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Tiistai 1. tammikuuta 2030
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Keskiviikko 1. elokuuta 2018
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 11. syyskuuta 2018
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Torstai 13. syyskuuta 2018
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Keskiviikko 18. marraskuuta 2020
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 17. marraskuuta 2020
Viimeksi vahvistettu
Torstai 1. lokakuuta 2020
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2013_59
- 2014-A01236-41 (Muu tunniste: ID-RCB number, ANSM)
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
PÄÄTTÄMÄTÖN
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Kystinen fibroosi
-
National Institute of Allergy and Infectious Diseases...Valmis