Timisnar - Biomarkers-alatutkimus (Timisnar-mirna) (TiMiSNAR-miRNA)

Neoadjuvantti kemoradioterapia (nCHT), jota seuraa leikkaus, on paikallisesti edenneen peräsuolen syövän perushoito, mikä johtaa kasvaimen koon merkittävään pienenemiseen (supistuminen) ja siirtymiseen kohti varhaisempaa sairauden vaihetta primaarisessa kasvaimessa ja imusolmukkeissa (downstaging). Kasvainnäytteen laaja histopatologinen käsittely leikkauksen jälkeen, mukaan lukien tuumorin regressioluokitus (TRG) ja imusolmukkeiden tila (ypN), auttoi visualisoimaan yksilöllisen kasvaimen herkkyyden CRT:lle retrospektiivisesti. Koska vaste nCHT:lle on heterogeeninen, tarvitaan kuitenkin kelvollisia biomarkkereita kasvainvasteen seuraamiseen. Merkittävä määrä tutkimuksia pyrki tunnistamaan kasvainkudoksesta löydetyt molekyylimarkkerit, kun taas veripohjaisten biomarkkerien merkitystä on arvioitu vähemmän.

Verinäytteet, ts. Nestebiopsialla on kuitenkin useita etuja:

1. Verinäytteiden ottaminen on vähemmän invasiivista, halvempaa, helppo ajoittaa ja lähes ilman vakavia komplikaatioita.
2. Verinäytteet ovat tuoreen DNA:n ja RNA:n lähde ilman säilöntäaineista johtuvia muutoksia; varsinkin peräsuolen syövän tapauksessa kasvaimensisäisen heterogeenisyyden lisäksi kasvainbiopsioihin liittyy yleensä normaali, adenomatoottinen tai stroomakudos. Tämä kontaminaatio voi vaikuttaa molekyylianalyysien tuloksiin
3. Potilaiden veren tutkiminen voi selittää molekyylien heterogeenisyyden ja korvata kasvaintaakan, koska kasvainperäisiä fragmentteja tai biomarkkereita kerätään kaikista potilaan kehon kasvainsoluista verenkierron kautta.
4. Nestebiopsia voi tarjota sekä mahdollisuuden dynaamiseen seurantaan hoidon aikana että mahdollisuuden arvioida taudin aktiivisuutta jopa patologisen täydellisen vasteen (pCR) jälkeen tai kasvaimen resektion jälkeen, kun kudosta ei ole jätetty molekyylianalyyseihin.

Kliinisissä rutiineissa karsinoembryoninen antigeeni (CEA) on todettu tähän mennessä paksusuolen syöpään (CRC) liittyväksi kasvainmarkkeriksi, mutta sitä ei suositella kolorektaalisyövän seulontatestiksi. Ensinnäkin normaalit CEA-tasot eivät sulje pois kolorektaalisyövän mahdollisuutta. Toiseksi kohonnut CEA ei liity kategorisesti CRC:hen tai taudin etenemisen seurantajaksoon. Kiertävä kasvain-DNA (ctDNA) on nykyään tärkein tapa seurata kasvaintaakkaa ja hoitoresistenssiä, arvioida jäljellä olevan taudin olemassaoloa mahdollisesti parantavan hoidon jälkeen ja seurata taudin uusiutumista erittäin herkästi ja spesifisesti.

Mahdollisena vaihtoehtona CEA:lle ja ctDNA:lle mikroRNA:ita (miRNA:ita) tutkitaan parhaillaan veripohjaisina biomarkkereina. miRNA:t ovat pieniä, ei-koodaavia RNA:ita, jotka säätelevät geenin ilmentymistä transkription jälkeisellä mRNA:n sitoutumisella, mikä edistää kohdemiRNA:iden destabiloitumista. MiRNA:iden kohdespesifisyys on suurelta osin ennalta määrätty niiden niin kutsutulla "siemensekvenssillä" (sisältää nukleotideja miRNA:n kohdissa 2-7). Ne ovat erittäin konservoituneita lajien välillä, pysyviä ja helposti havaittavissa pieninäkin pitoisuuksina. Niitä on analysoitu laajasti fysiologisissa ja patologisissa prosesseissa, ja niiden ilmentyminen on kudosspesifistä.

Tähän mennessä ei ole toteutettu seulontamenetelmää relevanttien miRNA:iden tunnistamiseksi biomarkkereina peräsuolen syöpää sairastavien potilaiden verestä.