COVID-19:n kliinisen vaihtelun geneettiset perusteet (GEN-COVID)
COVID-19:n kliinisen vaihtelun Italian väestössä määrittävien geneettisten perusteiden tunnistaminen
GEN-COVID-monikeskustutkimuksen tavoitteena on tunnistaa isäntägenomin geneettiset variantit, jotka ovat vastuussa COVID-19-potilaiden kliinisestä vaihtelusta. Tämä tähänastinen vaihtelu liittyy vain osittain potilaiden ikään ja liitännäissairauksiin. Tutkimuksen ensisijaisena tavoitteena on siis tunnistaa sairauden vakavuuteen liittyviä geneettisiä variantteja, kun taas toissijaisena tavoitteena on tunnistaa sairauden pitkittäissuuntaisiin kehityskulkuihin liittyvät muunnelmat.
Tämä on laboratoriotutkimus, johon kuuluu geneettisten tutkimusten suorittaminen, mukaan lukien kokonaisten eksomien sekvensointi ja genomin laajuiset assosiaatiotutkimukset, ihmisbiologisesta materiaalista, joka on peräisin COVID-19-tartunnan saaneilta potilailta.
Jokaisesta tutkimukseen osallistuneesta potilaasta kerätään myös kliinisiä tietoja, jotka ovat hyödyllisiä taudin vaikeusasteen kuvaamisessa.
Mukana odotetaan yhteensä vähintään 2 000 COVID-19-potilasta.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Vuoden 2019 koronavirustaudin (COVID-19), SARS-CoV-2:n aiheuttaman vakavan akuutin hengitystieoireyhtymän, puhkeaminen, joka ilmaantui ensimmäisen kerran joulukuussa 2019 Wuhanissa, Huananissa, Hubein maakunnassa Kiinassa, on johtanut miljooniin tapauksiin maailmanlaajuisesti muutaman lyhyen kuukauden ja kehittyy nopeasti todelliseksi pandemiaksi. COVID-19-pandemia on valtava haaste maailman terveydenhuoltojärjestelmille. Euroopan maista Italia koki ensimmäisenä SARS-CoV-2-tartunnan epidemiaaallon, johon liittyi vakava kliininen kuva ja kuolleisuus 14 prosenttiin.
Taudille on ominaista erittäin heterogeeninen fenotyyppivaste SARS-CoV-2-infektioon, ja suurimmalla osalla tartunnan saaneista henkilöistä on vain lieviä tai jopa ei lainkaan oireita. Vakavat tapaukset voivat kuitenkin nopeasti kehittyä kohti kriittistä hengitysvaikeusoireyhtymää ja useiden elinten vajaatoimintaa. COVID-19:n oireet vaihtelevat kuumeesta, yskästä, kurkkukipusta, tukkoisuudesta ja väsymyksestä hengenahdistukseen, verenvuototautiin, keuhkokuumeeseen, jota seuraavat hengityshäiriöt ja septiset sokit.
GEN-COVID on akateeminen monikeskustutkimus, joka on suunniteltu keräämään ja systematisoimaan biologisia näytteitä ja kliinisiä tietoja useista Italian sairaaloista ja terveydenhuoltolaitoksista potilastason fenotyyppi- ja genotyyppitietojen saamiseksi. Hankkeen tavoitteena on tunnistaa COVID-19:n kliinisen vaihtelevuuden geneettiset tekijät isäntägenetiikkaa tutkimalla. Geneettisiin analyyseihin kuuluvat Suomen molekyylilääketieteen instituutin (FIMM) suorittamat Genome Wide Association Studies -tutkimukset ja Sienan yliopiston suorittama Whole Exome Sequencing (WES). SARS-CoV-2-tartunnan saaneet yksilöt (puikkovirus PCR-positiivinen), joiden kliininen vakavuus on erilainen, kerätään. Erityisesti ilmoittautuneisiin koehenkilöihin kuuluvat vain aikuiset (potilaat, joiden ikä on vähintään 18 vuotta), joilla on seuraavat kliiniset tilatyypit: oireettomat henkilöt, kotihoidon potilaat, joilla on lieviä oireita, ja sairaalapotilaat (i-invasiivista ventilaatiota vaativat; ii-potilaat, jotka tarvitsevat ei-invasiivinen ilmanvaihto, ts. CPAP ja BiPAP sekä korkeavirtaushappihoito; iii- ne, jotka tarvitsevat tavanomaista happihoitoa, ja iv- jotka eivät vaadi happihoitoa).
Rahoitus. MIUR-projekti "Dipartimenti di Eccellenza 2018-2020" Sienan yliopiston lääketieteellisen biotekniikan laitokselle, Italiaan; Yksityiset lahjoittajat COVID-tutkimukseen (italialainen D.L. n. 18, 17.3.2020).
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Alessandra Renieri, MD, PhD
- Puhelinnumero: 00390577233303
- Sähköposti: alessandra.renieri@unisi.it
Opiskelupaikat
-
-
-
Siena, Italia, 53100
- Rekrytointi
- University of Siena
-
Ottaa yhteyttä:
- Alessandra Renieri, MD, PhD
- Puhelinnumero: 00390577233303
- Sähköposti: alessandra.renieri@unisi.it
-
Päätutkija:
- Francesca Mari, MD, PhD
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Ikä > tai yhtä suuri kuin 18
- SARS-CoV-2 PCR-positiivinen vanupuikolla
Poissulkemiskriteerit:
- ei mitään
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
SARS-CoV-2 PCR-positiiviset yksilöt
Aikuiset (> o yhtä kuin 18 vuotta) SARS-CoV-2 PCR -positiiviset henkilöt, joilla on erilaiset kliiniset tulokset: oireettomista vakavasti sairastuneisiin COVID-19-potilaisiin.
|
Massiivinen rinnakkaissekvensointi ja isäntägenomin genotyypitys SARS-CoV-2-tartunnan saaneiden yksilöiden, joilla on erilaisia kliinisiä tuloksia oireettomista vakavasti sairastuneisiin potilaisiin, jotta voidaan tunnistaa vaikean COVID-19:n geneettiset tekijät ja geneettiset suojaavat tekijät.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Tunnistaa COVID-19:n vakavuuden geneettiset tekijät
Aikaikkuna: 6 vuotta
|
Yhden tai useamman vakavasta lopputuloksesta vastaavan ehdokasgeenin tunnistaminen ja sen/niiden myöhempi käyttö ennustetarkoituksiin ja ennaltaehkäisevään hoitoon ja/tai hoitoon.
|
6 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Tunnistaa COVID-19:n kliinisten kehityskulkujen geneettiset tekijät.
Aikaikkuna: 6 vuotta
|
COVID-19:n kliinisistä kehityskulkuista vastaavien ehdokasgeenien tunnistaminen.
|
6 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Francesca Mari, MD, PhD, University of Siena
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Wu Z, McGoogan JM. Characteristics of and Important Lessons From the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Outbreak in China: Summary of a Report of 72 314 Cases From the Chinese Center for Disease Control and Prevention. JAMA. 2020 Apr 7;323(13):1239-1242. doi: 10.1001/jama.2020.2648. No abstract available.
- Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, Song J, Zhao X, Huang B, Shi W, Lu R, Niu P, Zhan F, Ma X, Wang D, Xu W, Wu G, Gao GF, Tan W; China Novel Coronavirus Investigating and Research Team. A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019. N Engl J Med. 2020 Feb 20;382(8):727-733. doi: 10.1056/NEJMoa2001017. Epub 2020 Jan 24.
- Fallerini C, Daga S, Mantovani S, Benetti E, Picchiotti N, Francisci D, Paciosi F, Schiaroli E, Baldassarri M, Fava F, Palmieri M, Ludovisi S, Castelli F, Quiros-Roldan E, Vaghi M, Rusconi S, Siano M, Bandini M, Spiga O, Capitani K, Furini S, Mari F; GEN-COVID Multicenter Study; Renieri A, Mondelli MU, Frullanti E. Association of Toll-like receptor 7 variants with life-threatening COVID-19 disease in males: findings from a nested case-control study. Elife. 2021 Mar 2;10:e67569. doi: 10.7554/eLife.67569.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (TODELLINEN)
Ensisijainen valmistuminen (ODOTETTU)
Opintojen valmistuminen (ODOTETTU)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (TODELLINEN)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (TODELLINEN)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 16917
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
IPD-jaon aikakehys
IPD-jaon käyttöoikeuskriteerit
IPD-jakamista tukeva tietotyyppi
- STUDY_PROTOCOL
- MAHLA
- ICF
- CSR
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .