PITCHER (peritoneaalinen karsinomatoosin heterogeenisyys)
Kuinka epigeneettinen säätelyn purkaminen vaikuttaa geenien ilmentymismalleihin saman kasvaimen subklooneissa, tiedetään huonosti. Peritoneaalinen karsinomatoosi (PC) on tila, jossa saman vatsakasvaimen useita etäpesäkkeitä kehittyy vatsaonteloon ja vatsaontelon sisäisiin elimiin, mikä määrittää saman syövän eri ekosysteemejä. PITCHER käsittelee epigeneettisesti säädellyn geenin ilmentymisen vaihteluita PC:n eri alakloonien välillä suhteessa solujen mekaanisiin vasteisiin ja tarjoaa näkemyksiä siitä, kuinka syövän epigeneettiset maisemat kehittyvät ympäristön paineiden alla ja syöpäsolujen käyttämistä strategioista sopeutuakseen siirtymiseen ekosysteemistä toiseen.
PITCHER on 10 ryhmän verkosto Lyonista, Grenoblesta ja Marseillesta, ja se perustuu tietoihin ja näytekeräyksiin potilaista, joille on tehty leikkaus munasarja- tai kolorektaalisesta karsinomatoosista. PC-leesiot ja mahdollisesti vastaavat primaaristen kasvainten näytteet kerätään samoista potilaista leikkauksen aikana tai lopulta kerätään jo olemassa olevista näytteistä. Epigeneettisiä maisemia analysoidaan bioinformatiikan putkilinjalla, joka yhdistää eksomin sekvensoinnin, transkription ja metylomin "epigeneettisten hotspottien" tunnistamiseksi, ja niiden vaihtelut leesioiden välillä arvioidaan. Nämä analyysit tehdään tuoreista (jos saatavilla) tai jo olemassa olevista näytteistä. Organoidiviljelmiä ja eläinmalleja johdetaan mahdollisuuksien mukaan vatsakalvon nesteiden ja kalvojen monisoluisista rakenteista, sytoskeletaalin ja nukleoskeletaalin mekaaniset vasteet karakterisoidaan atomivoimamikroskoopilla. Tuumorien aksonogeneesin, kasvaimissa olevien aksonikuitujen uusmuodostumisprosessin, roolia käsitellään. Kokeellisia tutkimuksia soluvasteista terapiaan suoritetaan matemaattisten ennustavien mallien johtamiseksi. Kaikki komponentit integroidaan PC:n systeemibiologiaan.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Olivier GLEHEN, MD
- Puhelinnumero: +33 4 78 86 23 71
- Sähköposti: olivier.glehen@chu-lyon.fr
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Sara CALATTINI, CRA
- Puhelinnumero: +33 4 78 86 37 79
- Sähköposti: sara.calattini@chu-lyon.fr
Opiskelupaikat
-
-
-
Lyon, Ranska
- Rekrytointi
- Lyon Sud hospital, Hospices Civils de Lyon
-
Ottaa yhteyttä:
- Olivier GLEHEN, MD
- Puhelinnumero: +33 4 78 86 23 71
- Sähköposti: olivier.glehen@chu-lyon.fr
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Potilaat, jotka suostuvat osallistumaan tutkimukseen
- Miehet/naiset yli 18-vuotiaat
- Potilaat, joilla on syöpähoitoa ja ruoansulatuskanavan tai munasarjaperäisen vatsakalvon karsinomatoosin hoitoa
- Potilailla oli histologinen/radiologinen vahvistus peritoneaalisairaudesta
- Serologisesti negatiivinen HIV, HEPATIITTI
Poissulkemiskriteerit:
• ei mitään
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
geneettiset ja epigeneettiset tiedot saatavilla 20 "multipletti" -bionäytteestä (vatsakalvon karsinomatoosi + terve kudos + primaarinen kasvain + kudos muusta kasvaimen etäpesäkkeestä - soveltuvin osin ja saatavilla - )
Aikaikkuna: osallistumisajan päättyminen (syyskuu 2022)
|
Päätavoitteena on toteuttaa spesifinen ja laadukas kudoskokoelma, jossa kootaan "multipletteja" samasta potilaasta peräisin olevista bionäytteistä, jotta voidaan rakentaa ydintietokanta PC:n mekanismeja, biomarkkereita ja toimivia terapeuttisia kohteita koskevaa tutkimusta varten.
Tämä tietokanta sisältää molekyylianalyysin seuraavan sukupolven sekvensoimalla primaaristen, peritoneaalisten ja metastaattisten leesioiden koko eksomin geneettisiä, transkriptomisia ja epigeneettisiä malleja.
"Omics"-tiedot kootaan käyttämällä tietomallia, joka sisältää myös anonymisoituja tietoja histopatologiasta ja hoitojen kliinisestä historiasta (jos mahdollista)
|
osallistumisajan päättyminen (syyskuu 2022)
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 69HCL16_0672
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .