投手 (腹膜癌腫症の不均一性)

エピジェネティックな調節解除が同じ腫瘍のサブクローンにおける遺伝子発現パターンにどのような影響を与えるかはほとんどわかっていません。 腹膜癌腫症（PC）は、同じ腹部腫瘍の複数の転移が腹腔および腹腔内臓器に発生する状態であり、そのため、同じ癌の異なる生態系が定義されます。 PITCHER は、細胞の機械反応に関連して、PC の異なるサブクローン間でエピジェネティックに調節される遺伝子発現の変動に取り組み、環境圧力下でがんのエピジェネティックな状況がどのように進化するか、またある生態系から別の生態系への移行に適応するためにがん細胞が使用する戦略についての洞察を提供します。

PITCHER は、卵巣または結腸直腸起源の腹膜癌腫症の手術を受けた患者のデータと検体収集に基づいて、リヨン、グルノーブル、マルセイユの 10 チームからなるネットワークです。 PC病変および最終的に一致する原発腫瘍の標本は、手術時に同じ患者から収集されるか、最終的には既存の標本から回収されます。 エピジェネティックなランドスケープは、エキソームシークエンシング、トランスクリプトーム、メチロームを組み合わせたバイオインフォマティクスパイプラインによって分析され、「エピジェ​​ネティックなホットスポット」が特定され、病変全体にわたるその変動が評価されます。 これらの分析は、新鮮なサンプル (入手可能な場合) または既存のサンプルで実現されます。 可能であれば、オルガノイド培養物および動物モデルは、腹膜液および膜、細胞骨格および核骨格の機械反応の多細胞構造に由来し、原子間力顕微鏡を使用して特性評価されます。 腫瘍における軸索線維の新形成プロセスである腫瘍軸索形成の役割について取り上げます。 治療に対する細胞反応の実験的研究は、数学的予測モデルを導き出すために実行されます。 すべてのコンポーネントは、PC のシステム バイオロジー マップに統合されます。