JARRO (Heterogeneidade da Carcinomatose Peritoneal)

Como a desregulação epigenética afeta os padrões de expressão gênica em subclones do mesmo tumor é pouco conhecido. A Carcinomatose Peritoneal (PC) é uma condição na qual múltiplas metástases do mesmo tumor abdominal se desenvolvem na cavidade peritoneal e órgãos intraperitoneais, definindo assim diferentes ecossistemas do mesmo câncer. PITCHER aborda as variações na expressão gênica regulada epigeneticamente entre diferentes subclones de PC em relação às mecanorrespostas celulares, fornecendo informações sobre como as paisagens epigenéticas do câncer evoluem sob pressões ambientais e sobre as estratégias usadas pelas células cancerígenas para se adaptar à transição de um ecossistema para o outro.

PITCHER é uma rede de 10 equipes de Lyon, Grenoble e Marselha, com base em dados e coleta de amostras de pacientes que foram submetidos a uma cirurgia para carcinomatose peritoneal de origem ovariana ou colorretal. Lesões de PC e eventualmente espécimes correspondentes de tumores primários serão coletados nos mesmos pacientes no momento da cirurgia ou eventualmente recuperados de amostras já existentes. As paisagens epigenéticas serão analisadas por um pipeline de bioinformática combinando sequenciamento de exoma, transcriptoma e metiloma para identificar "hotspots epigenéticos", e suas variações entre as lesões serão avaliadas. Estas análises serão realizadas em amostras frescas (quando disponíveis) ou pré-existentes. Quando possível, culturas de organoides e modelos animais serão derivados de estruturas multicelulares em fluidos peritoneais e membranas, mecanorrespostas citoesqueléticas e nucleoesqueléticas serão caracterizadas usando Microscopia de Força Atômica. O papel da axonogênese tumoral, um processo de neoformação de fibras axônicas em tumores, será abordado. Estudos experimentais de respostas celulares à terapia serão realizados para derivar modelos preditivos matemáticos. Todos os componentes serão integrados em um mapa de biologia de sistemas do PC.